Detailed information on CNT30691142


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONORUT000348, E-value = 0.0

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30596274Oryza sativaOryza meridionalis14.1557.9694.44324forward
CNT30369613Oryza sativaOryza glumipatula20.9344.1199.16479forward
CNT30100326Oryza sativaOryza rufipogon16.385.3594.91373forward
CNT30115577Oryza sativaOryza nivara49.7294.2196.751138forward

Expression of CNT30691142

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (33 aa)
IPEPTNPREKALCLSAALISITGRGRDDRRQPL*

>peptide 2 (38 aa)
MVRVHSLCSNGFIYALCATTCLAMLRNMQMLIPSIIKM*

>peptide 3 (54 aa)
MSNTTVLCHVVGSRRVRHHGVKFKAWAHHLTVLDIFPSMPRMEEHVSCWCKARF*

>peptide 4 (48 aa)
SQSRRIRERRPSASPLLSSPSQAAGETTVDSLSEPRQSPGTKASPMTP*

>peptide 5 (45 aa)
PRADESEREGPLPLRCSHLHHRPRERRPSTASLSHANRRERKPRR*

Sequence

>CNT30691142
ATCCCAGAGCCGACGAATCCGAGAGAGAAGGCCCTCTGCCTCTCCGCTGCTCTCATCTCCATCACAGGCCGCGGGAGAGACGACCGTCGACAGCCTCTCT
GAGCCACGCCAATCGCCGGGAACGAAAGCCTCGCCGATGACGCCCTGAAGCACGCATCGGAGCGCCGCTGTTTCGTCATCATTGTCGCCTGGCCGAATCC
ATCTATCTCAAGCCAAGCCGCTGCGCCGTGAAGTTTGCCTCGACTTCCTCTTCAAGACGCCTCAAGAATCACCATCGGAGACACTAGGAGCACGGAGAAC
ACGCCCCTTTTTCCTCGGCGCCGATCTGAACCTGCCACCGTCGCTACTGCCGAATCCATCCTCTCCGTTCTTGGAGCTGTTCAAGCTATCATCGTCGACC
CAGAGGAGATTGCCGCCGCCGAGCAGTTGCACGAGTCGCCGTCACCCACCAAGCTTTGCCAGTCCTGTCTAGCATCTCGATAATTGCATAATCGGTGAAG
GACTGGATTAGGTGCTAACGTTTCTCTGATCAAGGCAAGTTTTCTCCTCCCATCCTTTGAACACATTGAATCCCATGATTTGAGGAATGAAAATATTTGT
TTGCAAAGTTGCATGTGAACTTAGACTATATCGGTATTTAAAATTGGGTTAAGGTAGTTATGACCTATTTGCTACATACCCCCACCTTGAATAATTGATC
CTCTTGCTGTTTGAAACCCTAGAAATGGTTAGAGTACACTCTTTGTGCTCAAATGGGTTTATATATGCTCTATGTGCAACTACTTGCTTAGCCATGCTTA
GAAATATGCAAATGCTCATTCCATCTATAATTAAAATGTGATTTTGATACATGAACCTTTGCTAGAATAAAATGAATATGATGGGTATTTGCGAACTAAA
ATGTGTAAAATGTGATTTTATACTTGGGCGGCAAGTGGTGTGCATATGGTGTTAGTTGCATACCGATAGGGGGAGTGTTTGCCCAAGTCCATAAGGACCG
AACTTGTGTCACCCATTTAAAGTTATTCGTACATCCACATGTGCTAGTATGGGATGGTCTAAGCTGATTAATCTATTTAGGACTAGCCTTGCATTCTGGT
AGGCCGGTGTGTATGAGTTCGTATAATTCAGAGGAGCTTCCTATTTACCCCGACGTGGTAGTTTAGGTGACTAAACATGTCCAATACAACGGTATTGTGC
CACGTGGTGGGTTCCCGTCGTGTCCGCCACCACGGCGTTAAGTTTAAGGCGTGGGCCCACCACTTAACGGTTCTAGACATATTTCCAAGTATGCCTAGGA
TGGAGGAACACGTATCGTGCTGGTGCAAGGCTAGATTCTAAGTAGTGTAAAGGATTCGTTGTGACCTCTAGTCCGCACTCATAATGTAGAGTGTGTGGTA
CTTGGCCGGCACTGAACCAACTAGAGTGTAGCCTCTAGGCTTCTATCATATCATGTGGGTAAAGGTGTACAAACTCTGCAGAGTTCTTTAAACTAATCGA
TTAGCCGTGCTCACAGTCAAGAGCGCTTTGGTGATGTGTCATGAGTATTTAAACTAATCGATTAGCCGTGCTCACAGTCAAGAGCGCTTTGGTGATGTGT
CATGAGTATAGACTATGTTTTAAAAATGTAATCATGTGACATTGGTTTGAAATTGATAAATGTGTTGAGTTGTGTGTGTGGTGATACATTATGACTTATT
GTTAAGTATGACAATAAGAGATTGATTATGATGGAATTATGAAGAAGTTAATAATGAAACTTAAAACTTGTCTTTGTTAATTGAAGCATCAACTCCTTTA
CAAAAGAATTGCGAAACAAAACTTGCTTTATGCTGAAATTAAACTACATATTGCCTTCCTTTGAATATATGTCTTACATGTAGTATGATAGGATTGATTT
GTGCTTGCCAGTACATTAAACAAGTTAACTTGTTTAATGTACTGACTTGCTGTTGATATAACCTTTTGTTTGCAGGTTTAGATTTAGTCTTTGAGTGATG
CGGGTTCCGATTGCTTCTTCTAGGATGAGAACTTAATGGGGTAAACCCCTAGTCGATGTGCTTGTGATTGGGTAGTCAAGCTTCCGCTGTTCTCTAATAA
GTCTATTTGGCCGGTCGGTCTATGTAATTATTAAGTTGTTGTAAGTCTTAAGTTTCTTTTATCTTAGTTGTGTTTGCTATGTATAATCATGTTTAAGATG
AAAGTGTGAATCTAGTGCACTAGTGCACATCCTGGGAACTAGATTTACATGAGTATGAGTTAGGAATATTTGAGAGGTTGTAGATCTTT