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Detailed information on CNT30690859


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30555174Oryza sativaOryza glaberrima69.9436.8995.151196forward
CNT30596990Oryza sativaOryza meridionalis27.7838.2196475forward
CNT30105215Oryza sativaOryza longistaminata100.0659.7697.251711forward
CNT30578158Oryza sativaOryza barthii16.0227.7987.23274forward

Expression of CNT30690859

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (31 aa)
MENLVKYDMFDTFALESLKFSKIGGYYEFRD*

>peptide 2 (38 aa)
MLRLKYLCLAYLTYESFLIPGLYAHDALQIDKQQLFYY*

>peptide 3 (41 aa)
MMYYDLSAGFGLPQKARMLKLNSTKMYMQSHTPTHTSICSD*

>peptide 4 (32 aa)
MALFISNEGRCIPITSNHTRACTDQSRCHVLI*

>peptide 5 (35 aa)
MPCFNLIFLDLSTQQSYLQLYSDFGDDISWPTESS*

Sequence

>CNT30690859
GCACAATATTAATCTTATCTTAAGCTCTTGAGGTTTAATAGAGCAATAGTTATTTCTAATTATGCATGCATACAAAATTATCCTATGATGGCTTCACTGA
GCATTGATTTAAAGAACTATATACAGATATAATCCTTAACTCAAATGCACTTGTAGATCATCAGAGATAATTCTTGCTGTTAACTATGTAATGAGATAGC
TGATCTATACTTGAATTATTCTTTTTAAGAATCCACTAAATTTAAGATGATACTATATTGTCCAATTACTTATAAAAACTATGTCTTGAGCGCATATGAT
GTACTATGATTTAAGTGCAGGTTTTGGTCTTCCTCAAAAAGCTAGAATGCTTAAGCTTAATTCCACAAAGATGTATATGCAGTCACACACTCCTACACAT
ACTAGTATATGCTCAGATTAAAATACTTATGCCTTGCCTATCTCACTTATGAGTCTTTCTTGATCCCAGGTCTATATGCACATGATGCTCTCCAAATAGA
TAAACAGCAATTGTTCTATTATTAAATCATGAATGGCCTTGTTTATATCTAATGAAGGCAGATGCATACCTATAACTTCTAATCATACTAGAGCATGCAC
AGATCAAAGTAGATGCCATGTTTTAATTTAATTTTTCTTGATTTATCTACTCAACAATCTTACCTTCAACTGTATTCTGATTTTGGTGATGATATTTCCT
GGCCTACTGAATCCTCTTGAGCTTCCCTCAATTAATCTTCCTTTTTGTTAATTAATTTCTTTGCTAGTCCTAATTCTTGGCATCCTGCTGGAACTGCTAC
AGGTTGCTACTCCTCCTAGAGTTTGTTTGGCACCTTTTTGAGATGAAATCCCTTGCTTCCTCCTGAGCTTGAGCTGAAACCCCTTGCTCCACTTGTAAAT
CAGGTACTTGTCCTCTTGTCTCTTGTTTTCCAGGTACTTCTTGACTGCTTCTTGCTATCTTTCTCGATCTGGTACTGGTGATTCTCTTCCTCCTCTTGAA
GCTCATTCTCTTGCTTGATTTTTGCTCCATCTTGCTTATTGACCTGAGTTTCTTGTTTCTTCTAAATCTCAAGCAAGCACTGCTTCACCTCCTACTCCCT
TGTCTTTCTCCCTCTCTCTGGTTGCTTGACCACAGATGCTATAGTTGAGCTGTGGTGTGGTTGAGGTATAGAACTTTTAGTTGGTTATTTCTCTTTCTCC
CAATCTCCACTGATTTCCAGCCGTGGTTGCTTGCTGTTGCTGGGATCTTACTACTACTATGGCTGCTGTACTACTGCTCTGCTAGCTCGCTCTCCCTGGC
TACTCTCTGATTGCCTTCCCTTGGATAATACAATGTGATCTTGTAAGTTGTATTGTCTCTCCAGATGAACTACTAGCTACTGCTGCTGCTCATTGCAGCC
AAAAATGGTAGTACTACTGCTCACCTTGGTCTCTACGACAGTATAGCTTGGTTTGGGAGAAATTTCACACTGAGATGGTTAATTTGGTGGAGCTGAACTA
GTGACTCACCTGCTGGTTGTTTGGTGGCTTCATGCATGTTAGACACCTAACCATAGCATGCTCGGTGGAGGTGGAATGATGGATAGAATTTACTAATTTT
TAGTTTAAATGGAAAATCTGGTAAAGTATGATATGTTTGATACTTTTGCACTTGAGTCCCTCAAGTTTAGTAAAATTGGAGGTTACTATGAGTTTAGGGA
CTGATATTAC