Detailed information on CNT30690731


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONORUT000291, E-value = 0.0

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30369193Oryza sativaOryza glumipatula29.462.7999.26675forward
CNT30574690Oryza sativaOryza barthii98.5210098.362262forward
CNT30115548Oryza sativaOryza nivara27.4810099.21631forward

Expression of CNT30690731

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (84 aa)
AWPQRVVDLGFPFLALFSASLSRHSSLSTPKPKKPRERAPTLPLHLSFVVGRRKGGRRRSPTSRLHPYLIHVLLSSLHAEQILF*

>peptide 2 (34 aa)
MVITCVPIGGECAQTDLRTSLNVSSFRIQYNHMC*

>peptide 3 (30 aa)
RVATTCRRPRFPFSRSLLRQSESPFFTVHP*

>peptide 4 (81 aa)
MYRVPCSCMIIISHHVGKVYKLCRVKTNRLAVLAVMSGVWICVEYRLVFILLNAEIYLQIVMKFKNELLAAMDGNEVYIYT*

>peptide 5 (75 aa)
MAQQVRRSATVFFTSGCRRHCRFRLLRSSSSRSSRRRSPAEGRRRREDARAVAVTKTPEKFNLTRDDCLIGEEVI*

>peptide 6 (67 aa)
MPSKSSFDSILFRPLQRRERDLVYGSSGARSKRRRSRHRRRSERCRPSQAEPSRQRLLLEVLLKTPQ*

>peptide 7 (61 aa)
MGPPLNGSRSYNGYGLGWSNTYRAGVRLNHEFWKSFVVSNKSGTYVSRAMLLHDYYFASCG*

Sequence

>CNT30690731
CGCGTGGCCACAACGTGTCGTCGACCTCGGTTTCCCTTTTCTCGCTCTCTTCTCCGCCAGTCTGAGTCGCCATTCTTCACTGTCCACCCCTAAGCCGAAG
AAACCCAGGGAGAGAGCTCCAACTCTCCCTCTCCACCTCTCTTTCGTCGTCGGCCGCCGAAAAGGGGGACGCCGCCGATCGCCAACGAGTCGTCTCCATC
CCTATCTGATTCACGTTCTATTATCTTCTCTCCATGCCGAGCAAATCCTCTTTTGACTCCATCTTGTTTCGTCCACTGCAGCGACGGGAACGCGACCTCG
TCTACGGGAGCTCTGGAGCGCGCTCCAAGCGCCGCCGCAGCCGACATCGTCGCCGTTCCGAGCGCTGTAGACCGAGCCAAGCCGAGCCGTCACGCCAACG
CCTTCTCCTTGAAGTCCTCCTCAAAACCCCTCAATAATCCCAGGCAATGGCGCAGCAAGTGCGGAGATCGGCCACCGTCTTCTTCACCTCCGGTTGCCGT
CGCCATTGTCGTTTCCGCCTCCTCCGCAGCTCGTCGTCCCGTTCGAGCCGTCGCCGTTCACCCGCAGAAGGACGCCGTCGCCGGGAGGATGCGCGAGCCG
TTGCTGTCACCAAGACCCCGGAAAAGTTCAACCTAACCCGCGATGATTGCTTAATCGGTGAAGAAGTGATTTAGGTGTTGACTTTTTCCAGTTACAAGGC
AAGTCCCACCTCCCTCTCTTTGATCACTTTGAACCTATGTTTTGGAGGTTATTGAAAATGTTTGCAAATCTTGCATGCCGATTGTACGCTAATAAATTAA
AATTTTGTTAAACTTGTTAGACAAACTCCTATTATTTGCATTATCACCTTAACCCCACATATATCCTTATCTATCATTCCTAACCTTAGGAACAATATGA
CTATACCACTTCATATATGAGTTTTGGAGTCACTAGGTTACTATAATGCTTAGCCATGCTTAGAATGGTCTTCCTTATTATTATGGGCTCATTACAAACA
TGAAAATTGATTTTGAAATAATCTGGACAGAACTTTAATACTTGTAATTTTGATAAATAAAATAATGGAAAACATGGATTTTAGGTTTGGGCCTCAAGTG
GTGCACATATGGTGATTACTTGTGTACCGATAGGGGGAGAGTGCGCCCAAACCGACCTAAGGACTTCACTCAATGTCAGTTCATTTCGTATACAGTACAA
CCACATGTGCTAGTATTGGATAGCCCAAGCTTAGTAAACTATTTATGGTTTAGCCTTACATTCTGGTAGGCCGGTGTGTGTGAGTTCGGATAACTCAGAG
GAACTTCCTATTTACCCCGGTGTGGTAGTTTAGGTGACTAAGTCTGTCCAATACAATGGTATTGTGCCACGTGGGTGGGTTCCCGTTGTGTCCGCCACCA
CGGCGTTAAGTTTAAGGCATGGGCCCGCCACTTAACGGTTCTAGGTCATATAATGGGTATGGCTTAGGATGGAGTAACACGTATCGTGCTGGTGTAAGGC
TAAATCATGAATTTTGGAAAAGCTTTGTTGTGAGTAATAAATCGGGTACTTATGTATCGCGTGCCATGCTCTTGCATGATTATTATTTCGCATCATGTGG
GTAAAGTGTACAAACTCTGCAGAGTTAAAACTAATCGATTAGCCGTGCTCGCGGTCATGAGCGGCGTGTGGATATGTGTTGAGTATAGACTTGTGTTTAT
TCTTCTAAATGCTGAAATTTACCTTCAAATTGTGATGAAATTTAAGAATGAACTCCTTGCTGCCATGGATGGCAATGAGGTGTATATTTATACATGACTA
ATGACTACTTTGATGCCCATATATGTCAAGTACTAGCTTGCTGAAATTTATTTGAAAGCAAATCTGATTTGGAAATGTTTTATGCAAATAAAATTTGCTT
TATGCTAAAAAGAACCATACTATGCCTTTCTTGATTACATGTGCAAGTAGGATGTTAGGCTTGTCTTGGTGCTTGCCAGTACATTATTTTTAATAATGTA
CTAACTCTTATTGTTGAATTAACCTTTTACTTGCAGGTTTTAGATTTAGTCTTTGAGTGATGCGGGTAATCGACTGTTTCTTCTAGGACTTGAACTTAAT
GGGGTAAACCCCTAGTCGGTGTGCTTGTGGATTGGGTAGACAAGCTTCCGTTGTTCTCTCATGTGTCTATTTGGCCGGTCGGCCTATGTAATTATTAAGT
TGTTGTAAGTCTTAAGTTTCTTTCATCTTAGTTGTGTTTGCTATGTATAATCATGCTTAAGATGAAAGTGTGGATCTAGTGCACATCCTAAGAATT