Detailed information on CNT30689906


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONORUT000291, E-value = 0.0

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30597133Oryza sativaOryza meridionalis34.933.8788.52845forward
CNT30110249Oryza sativaOryza longistaminata23.7575.3695.83575forward
CNT3099957Oryza sativaOryza rufipogon98.8410099.542393forward
CNT30115525Oryza sativaOryza nivara25.9410099.2628forward

Expression of CNT30689906

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (34 aa)
MVITCVPIGGECAQTDLRTSLNVSSFRIQYNHMC*

>peptide 2 (61 aa)
MGPPLNGSRSYNGYGLGWSNTYRAGVRLNHEFWKSFVVSNKSGTYVSRAMLLHDYYFASCG*

>peptide 3 (30 aa)
RVATTCRRPRFPFSRSLLRQSESPFFTVHP*

>peptide 4 (81 aa)
MYRVPCSCMIIISHHVGKVYKLCRVKTNRLAVLAVMSGVWICVEYRLVFILLNAEIYLQIVMKFKNELLAAMDGNEVYIYT*

>peptide 5 (84 aa)
AWPQRVVDLGFPFLALFSASLSRHSSLSTPKPKKPRERAPTLPLHLSFVVGRRKGGRRRSPTSRLHPYLIHVLLSSLHAEQILF*

>peptide 6 (67 aa)
MPSKSSFDSILFRPLQRRERDLVYGSSGARSKRRRSRHRRRSERCRPSQAEPSRQRLLLEVLLKTPQ*

>peptide 7 (74 aa)
MAQQVRRSATVFFTSGCRRHCRFRLLRSSSRSSRRRSPAEGRRRREDARAVAVTKTPEKFNLTRDDCLIGEEVI*

Sequence

>CNT30689906
CGCGTGGCCACAACGTGTCGTCGACCTCGGTTTCCCTTTTCTCGCTCTCTTCTCCGCCAGTCTGAGTCGCCATTCTTCACTGTCCACCCCTAAGCCGAAG
AAACCCAGGGAGAGAGCTCCAACTCTCCCTCTCCACCTCTCTTTCGTCGTCGGCCGCCGAAAAGGGGGACGCCGCCGATCGCCAACGAGTCGTCTCCATC
CCTATCTGATTCACGTTCTATTATCTTCTCTCCATGCCGAGCAAATCCTCTTTTGACTCCATCTTGTTTCGTCCACTGCAGCGACGGGAACGCGACCTCG
TCTACGGGAGCTCTGGAGCGCGCTCCAAGCGCCGCCGCAGCCGACATCGTCGCCGTTCCGAGCGCTGTAGACCGAGCCAAGCCGAGCCGTCACGCCAACG
CCTTCTCCTTGAAGTCCTCCTCAAAACCCCTCAATAATCCCAGGCAATGGCGCAGCAAGTGCGGAGATCGGCCACCGTCTTCTTCACCTCCGGTTGCCGT
CGCCATTGTCGTTTCCGCCTCCTCCGCTCGTCGTCCCGTTCGAGCCGTCGCCGTTCACCCGCAGAAGGACGCCGTCGCCGGGAGGATGCGCGAGCCGTTG
CTGTCACCAAGACCCCGGAAAAGTTCAACCTAACCCGCGATGATTGCTTAATCGGTGAAGAAGTGATTTAGGTGTTGACTTTTTCCAGTTACAAGGCAAG
TCCCACCTCCCTCTCTTTGATCACTTTGAACCTATGTTTTGGAGGTTATTGAAAATGTTTGCAAATCTTGCATGCCGATTGTACGCTAATAAATTAAAAT
TTTGTTAAACTTGTTAGACAAACTCCTATTATTTGCATTATCACCTTAACCCCACATATATCCTTATCTATCATTCCTAACCTTAGGAACAATATGACTA
TACCACTTCATATATGAGTTTTGGAGTCACTAGGTTACTATAATGCTTAGCCATGCTTAGAATGGTCTTCCTTATTATTATGGGCTCATTACAAACATGA
AAATTGATTTTGAAATAATCTGGACAGAACTTTAATACTTGTAATTTTGATAAATAAAATAATGGAAAACATGGATTTTAGGTTTGGGCCTCAAGTGGTG
CACATATGGTGATTACTTGTGTACCGATAGGGGGAGAGTGCGCCCAAACCGACCTAAGGACTTCACTCAATGTCAGTTCATTTCGTATACAGTACAACCA
CATGTGCTAGTATTGGATAGCCCAAGCTTAGTAAACTATTTATGGTTTAGCCTTACATTCTGGTAGGCCGGTGTGTGTGAGTTCGGATAACTCAGAGGAA
CTTCCTATTTACCCCGGTGTGGTAGTTTAGGTGACTAAGTCTGTCCAATACAATGGTATTGTGCCACGTGGGTGGGTTCCCGTTGTGTCCGCCACCACGG
CGTTAAGTTTAAGGCATGGGCCCGCCACTTAACGGTTCTAGGTCATATAATGGGTATGGCTTAGGATGGAGTAACACGTATCGTGCTGGTGTAAGGCTAA
ATCATGAATTTTGGAAAAGCTTTGTTGTGAGTAATAAATCGGGTACTTATGTATCGCGTGCCATGCTCTTGCATGATTATTATTTCGCATCATGTGGGTA
AAGTGTACAAACTCTGCAGAGTTAAAACTAATCGATTAGCCGTGCTCGCGGTCATGAGCGGCGTGTGGATATGTGTTGAGTATAGACTTGTGTTTATTCT
TCTAAATGCTGAAATTTACCTTCAAATTGTGATGAAATTTAAGAATGAACTCCTTGCTGCCATGGATGGCAATGAGGTGTATATTTATACATGACTAATG
ACTACTTTGATGCCCATATATGTCAAGTACTAGCTTGCTGAAATTTATTTGAAAGCAAATCTGATTTGGAAATGTTTTATGCAAATAAAATTTGCTTTAT
GCTAAAAAGAACCATACTATGCCTTTCTTGATTACATGTGCAAGTAGGATGTTAGGCTTGTCTTGGTGCTTGCCAGTACATTATTTTTAATAATGTACTA
ACTCTTATTGTTGAATTAACCTTTTACTTGCAGGTTTTAGATTTAGTCTTTGAGTGATGCGGGTAATCGACTGTTTCTTCTAGGACTTGAACTTAATGGG
GTAAACCCCTAGTCGGTGTGCTTGTGGATTGGGTAGACAAGCTTCCGTTGTTCTCTCATGTGTCTATTTGGCCGGTCGGCCTATGTAATTATTAAGTTGT
TGTAAGTCTTAAGTTTCTTTCATCTTAGTTGTGTTTGCTATGTATAATCATGCTTAAGATGAAAGTGTGGATCTAGTGCACATCCTAAGAATTCACATGA
GTATGAGTTAGAAATATTTGAGAGGTTGTAGATCTTTAGCCATTTTGTCAAGTCTAAATCTCCTGAATGTGTAACACATCTGGTCGCCACCTTCGAGTGG
TTTGACGGGCACATCTCAGGC