CANTATAdb - search

Detailed information on CNT30655371

BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)

Target	Query species	Target species	Query coverage (%)	Target coverage (%)	Identity	Alignment length (nt)	Orientation
CNT30360010	Rosa chinensis	Lactuca sativa	8.37	21.51	84.85	231	forward

Expression of CNT30655371

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (33 aa)
MFSVPCMDKAYVIEYITSIIRINFQSHSFIIIL*

>peptide 2 (33 aa)
MTLFRTLFKIWREVITKLRDISVFIFSYLKVFY*

Sequence

>CNT30655371
TGTTTAGACTTAGTTTTTTTTCTTTACATCTCCCATCTATCTATTTTCTTTAGTTATTCACTAGAGCAATTATGATCTGGAAGTCGATCCGGGGCAAGTG
TTCGGATCTATTATGACATAGCCGGGAGGCGCTTAACGGACCTTTTTAATCTTATAAACCCCTTTTCTTGGCTTTGAATAGACTCAAAAACAATTTTTTG
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