Detailed information on CNT30637929


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30488794Capsicum annuumOlea europaea2.8737.7997.5682reverse complement
CNT30623007Capsicum annuumDaucus carota3.7522.9696.26107reverse complement
CNT30111895Capsicum annuumFicus carica2.8723.0392.6882reverse complement

Expression of CNT30637929

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (30 aa)
KSSTYNQTTTSTNFKPTSTVRPANDSINNN*

>peptide 2 (29 aa)
MNQYIYRLLKFRLTFLVRYFDLVFLVVIG*

>peptide 3 (34 aa)
MNFARSLHGICSMLRVIILVCSVYAYLGNRLKLF*

>peptide 4 (32 aa)
MIRMLVSSLKFYVLILINGFVLMVSHYSWFGS*

>peptide 5 (45 aa)
MKAFHLLLFDGSLIFPEFILILGLILLLMIIIFQSVSLYVLGNIL*

>peptide 6 (34 aa)
MLKLCLDEFCTKFARDLFYVKSNYFGLFCLCVFG*

>peptide 7 (36 aa)
MAFSNEPIRLVASKFKANIDLMAYRNRGVKRRRKMG*

>peptide 8 (37 aa)
MNIIWSGMSLILIFSFACETVLETTMDSLPWHFRTSQ*

>peptide 9 (51 aa)
NLQHTTKRQHRPTSNRLQQSDPPTTLSTTTDRTSSTPTRIQFEPTQLQQQS*

>peptide 10 (55 aa)
MGFIFNLLFLLCVHVFLFIHKIQQLKEEINKFFHFVPICDFTHFYSSNHYDNLRV*

>peptide 11 (77 aa)
IFNIQPNDNIDQLQTDFNSPTRQRLYQQQLIEPHQRRPEFSSNQPSFSNSRDPNLYPAIPAIRNRTASTAQRESVAK*

>peptide 12 (81 aa)
MIRNKMLFCFCVLFFFWCEFYENFDESLSFASLRWKFDFPRIYPNFGPNSSSDDHYFSKCKSLCIREHIIAVVNMISTCHN*

Sequence

>CNT30637929
AAATCTTCAACATACAACCAAACGACAACATCGACCAACTTCAAACCGACTTCAACAGTCCGACCCGCCAACGACTCTATCAACAACAACTGATCGAACC
TCATCAACGCCGACCCGAATTCAGTTCGAACCAACCCAGCTTCAGCAACAGTCGTGACCCAAACCTGTATCCCGCGATTCCAGCAATAAGGAATCGTACG
GCCTCAACAGCTCAGCGTGAATCCGTTGCAAAATAGTACGATTTCGTACAAATTCACCTCATATTTCTATCCTCTTTTTAAAATTCGAATTTTCCTTGAC
AAAATCCCAAGATTATCTCCCTCAATTCTTTCCATCCCATATCAGTTGAGGCACAAGAAGGGTCCCCTAATCTCCTCTATAAAAAGTTCTCTTTGGAGCT
AAAATACCTAAAAATCTCGGAAGGTGGAAAAAACCATTTTGAGAAAAAAAAAAAAACCAGTATATTTTTGTTTGAGTATAGCATTTTCTTCTTTCCGAAA
AAGGTTGGGGGCTGCTCGTAGCTTTCGGAGTCGAGGAAGAATCCTCCGGTGGTGATAGAGTCCGGTGTTAGCTCGTTGCCCCATTTTGCTGCTCCGAAAA
AGGTAAACACCCTTTGCCATTTTTACTTCTGTCATCGTTTCTTCATCCCCTTCTTTATAATGTAATTATAATGTTGTTTGTTTGCTGGGAGTAGCTGTAG
ATGGCTATGATGGCCTTAGGATTAGTTTGTGATTGGTTGTTGCGTTATTTCGTGGAATCAGTGTTCACGTCATAATTTTTGTGCGATTATGTTGAATATA
CGATTCTCTTAATTGATTTTGTTGGTCATCTGTTGGTTTATGGTATGAATCAGTATATATATAGATTGTTAAAATTCCGTCTTACGTTTTTAGTTCGCTA
TTTTGATTTAGTGTTTCTTGTTGTGATAGGCTAACTATAGTCTTAATTATTTGATCTGTGATTTTAGCTTCATTTTGCTTCCCTCGGCTTTGCAATCCGT
TGTCTAAACCTTGATATCATCAGTTAATTATCCACCCATTATTTCGTCTTGGGTACTACTTATGATTCGAATGCTGGTTTCGTCGTTAAAGTTTTATGTA
TTGATTTTGATTAATGGTTTCGTACTGATGGTATCTCATTATAGCTGGTTCGGTAGCTAAAGTTTTATACTTTGTGTTGTCCATAAGTTGCTGATGACTT
TGGCATTTCTTACTTCTGCTATTTTTTGCTAATGAAATAATTTCATATGTTATTACTCATTGGTGATAAAATAAATAAGGACTTGCCACTTTAATTTGTT
GCAGTCCAACGTCCTTTCTTTGAAGAATGTGTGAAAAAGCTTGTTGTGAAATGATGGTATAAATAATGATATGGGTTTTATATTTAATTTGCTATTTCTT
CTCTGTGTGCATGTTTTTCTTTTTATACATAAAATTCAACAGTTGAAAGAGGAAATAAATAAGTTTTTTCACTTTGTGCCAATTTGTGATTTTACTCACT
TTTACAGTTCAAACCATTATGATAATTTAAGAGTTTAAATTGTGTGATAAAAAAGATTTGGTAAGTTTTTCTATATAGTAAGTATAATGTACCTAAGAAA
AATGTTCTTCCTGTGCGTTTAGATTGTGTTTTATTCCACTGTGTGAAACTGGTATGGTTGGGTTCAAAACAGTAATATGTTTGATTACTCATGTTAAAAT
TATGCCTTGATGAATTTTGCACGAAGTTTGCACGGGATTTGTTCTATGTTAAGAGTAATTATTTTGGTCTGTTCTGTCTATGCGTATTTGGGTAACAGGC
TCAAGTTATTTTAGCTTTGAGTTTTGATATTATGATTAGGAATAAAATGTTGTTTTGCTTCTGTGTGCTCTTTTTTTTTTGGTGTGAATTCTACGAGAAT
TTTGATGAAAGCCTTTCATTTGCTTCTCTTCGATGGAAGTTTGATTTTCCCAGAATTTATCCTAATTTTGGGCCTAATTCTTCTTCTGATGATCATTATT
TTTCAAAGTGTAAGTCTTTATGTATTAGGGAACATATTATAGCTGTTGTTAACATGATTTCAACATGTCACAATTAGTGTTCATATCGATAAGAACTTGA
GTGCTTTACAAGGAAGTGCTTTCTTTCTTGGTTTTGTCAAACTTTGCTTGCTCCTCTCCATTTCAAATTTCCTACCAGCTTGAAGTTTTGTTGCTTAAAA
GGATAGTCGTGACGAATCTATGCTAATTTCAGCTTCTCAATAGAACATTGTTTGTGATCAAGTCATATGTTCTAAAACATTATTGAATTTGCAAACTAGC
CTAAATAGTGAGATAAAAGTAAGTTTAACATTTGTTTACATGTTTTAACATTTGTTTACATGTGATATGAATATTATATGGTCTGGAATGAGTCTAATTC
TTATCTTTTCCTTTGCATGTGAAACTGTTTTGGAGACCACAATGGACTCCCTCCCATGGCATTTTCGAACGAGCCAATAAGGCTCGTTGCCTCAAAGTTC
AAGGCAAATATCGACCTTATGGCATACCGAAACCGAGGAGTCAAAAGAAGAAGAAAAATGGGATAAAGTTCCATCGTTGAAGCGACAAAGCGGCTTAAAA
GTCTCATTCCCTTATTATTTTATTTCTTATTGTATTTATTTATTTATTCATTTGTTTAAGTTATTCTTGTATTTGTATTTGGGCCTGGAAGCCAAAGTTG
TACTTAATACAGGTGGAACGAACTCGAGCCAAGGGCTCGAAAACTAAATTAGGACAGGTGAAATCGATCAAAGACCCAATTAGACTAGGACAGGTTACGT
TGATTTGGGCTCAATGGCCTAAATGTTTTACTCTTTTCTCTCTTTCCCCTTTC