Detailed information on CNT30636090


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30226590Capsicum annuumHordeum vulgare1.6720.197.5641forward

Expression of CNT30636090

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (58 aa)
MKFSRTFILILTLLFLNPPLPSPSPLLPLLILLPWPPVLIFKPCRFMNKYNFSFFGFI*

>peptide 2 (81 aa)
MKYTISSGWSYQVVRPCMGADACPVRQNDSLKYCLTPCLLRMFPMVSSLFPPTSLDFDCFGMNLTPYYLHLHVVTISPRFM*

>peptide 3 (38 aa)
HFLFPFPFPKFQSCDHSSLFFSFSHFLICCFSILVLIC*

>peptide 4 (44 aa)
MNMDEIFKNIYFDSYPFVFEPTATFTVTVAAVVNPVAVAAGLDF*

>peptide 5 (36 aa)
MLVYCSLLLVGIYDHYMRGVNIMIPSLPAIRSRDSY*

>peptide 6 (29 aa)
MSLKFWCSSSFSSIKYNVGVLFTSTGRYL*

Sequence

>CNT30636090
CATTTTCTCTTTCCTTTTCCCTTTCCCAAATTTCAGTCGTGTGACCATTCTTCTTTATTTTTCTCTTTCTCTCATTTTCTAATTTGTTGTTTTTCTATCT
TGGTTCTAATTTGTTAATGGTATGTGATGTCCTTAAAGTTTTGGTGTTCTTCAAGTTTCTCATCTATAAAGTATAATGTTGGTGTATTGTTCACTTCTAC
TGGTCGGTATTTATGATCATTATATGCGTGGTGTGAACATTATGATTCCTTCTCTCCCTGCCATCCGCTCTCGAGATTCATATTGATCAATACATCTCCG
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AAAAAAAGTCAGCCCTATATAGGTTTGTTATTAGTAAAATGCTAAGGTCCTATCTATATAGTAAGGGGTCTTAATGTGTTCGATAAGAGCGAAAATAATA
TGGTACTAGCGATTACATGAAGTATACCATCAGTTCTGGTTGGTCTTACCAAGTCGTAAGACCATGTATGGGGGCTGACGCGTGCCCAGTGAGACAAAAT
GATTCCCTCAAATACTGCTTAACTCCGTGTCTGCTGCGGATGTTTCCTATGGTGTCTTCTCTGTTTCCACCTACTTCACTCGACTTTGATTGCTTTGGAA
TGAATTTGACGCCTTACTACCTCCACCTTCATGTGGTTACGATAAGTCCAAGGTTTATGTGAATCATCTGCTGTATATGAGATTATTTGAGTAATCTATG
GCAATACTTTATTGGAAAAAAAAAAATACTATTGCAGCGCTTTTTTCTTCCCTCTCCAATATTGTCAAAAATTAAAGAAATATAAACATTGTGTCCCAAT
TTCACTGATGTTTCATTGTGCTCCGACGACCCAATTTCACTGTGCTCTGACCATATTTCATTGAGCTCTGACTGATTCACTCTCAAATCGACCGCCAAAT
TTGGATCGTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTACATCATCAACTTCACTCTCATCCTTCTAGAAACGTGGGTTCTATGAACATGGATGAAATTTTCAAGA
ACATTTATTTTGATTCTTACCCTTTTGTTTTTGAACCCACCGCTACCTTCACCGTCACCGTTGCTGCCGTTGTTAATCCTGTTGCCGTGGCCGCCGGTCT
TGATTTTTAAACCTTGCAGGTTTATGAATAAGTACAATTTTTCTTTTTTTGGGTTTATCTGACTTTGAATAGGTTTTGATGATGAGTAGATGTTTACTGG
CACATCAATAGAGATGTTTTGTGTTTTATATCTCCTAAAATCACCGTCAGAGCTGATATGTTTGTTATTTTAAACAAATATCTCTGAAATAATTGTCCAT
GGATCAGTTGTGGAAGGCATCAGAGTTTGCCCCTTTGTATTTAGGAAAAAACAATAAGTAGCAGCAGAACAGGGGTTAATTTATTATGATATTTAATTCC
TCTTAAGCTGTTAAGTGATTTGGCAACTTCTTCTGAATTGACTACTGAATTTCCAGGTAAGAATAGTCTATTCATAGGTTTATCTTCTGGCATGTATTTC
CTGAGGAATGCCTAATCTTATACGAAATCTAGGGTCATTCAGTATTTTGCTGATTCATGGATTTTGTGCATAAAGTTGACATTTGGATCAACCTACAATT
GATCTATTGATTCCTTTAGCTCAGACTATCTCTGTGTGGTCTCATGCATTTGGGTCAAGGCTACAAAATCCTGGATTGATTCATTTATCCTGACTTGTGG
GAGTTAATCTTGTTTTGTTGTGTGTGTATATATGAGAATTTTCAGTCATATGTTACCTGGATTCAGGTATGGATATATTTGGAACATTTGTCAGTAAGTG
TCCATTTAGCTGGTCCAAGTTGGCAAGTTTTTAAGTGTATCTCGAAGGATTTGGATGGACCAACACCAAGTTTTCAGTCTAGGTATGTCAAGGCAATTGA
AAGTCCATATCTTTATTTAAAATATGAAGGTTAGCATGGAGACAATGCCTATTATATGGTAGATTTCTCTGCCTTCTTTTTTAATATCTTGAAATATTTC
GCTGTACCTTGGTTCTCTTAGAGATAGTTGTTATGTCATTATAAGGTTACAGGAAATGTCCATCATACATGCAGAATTAAGGTGATAGCTTAACCACCAA
ACAAAAGATGCAGGATTGATGTGACTTTCTGAGTCGTTCTATACAATTATAGGATGTCTTTCTCCTTCAAGTATTTGTTAGGTTTACTTCGCTGAGCTGT
AGGTACCAACCCCTTAAAGGCTTTGTTATAGCAATTGTCATGGAATAGTACCC