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Detailed information on CNT30631225


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30290333Vigna unguiculataTriticum aestivum4.8327.9783.02106reverse complement

Expression of CNT30631225

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (47 aa)
MGMLFWFLGAAWVICHLQGCTQPRIHHTTRKTWVFCFKRCCVLLMNQ*

>peptide 2 (39 aa)
MNMSIQVVLERCEKGTFPLPSLRRCESVSRSIKMVRSVV*

>peptide 3 (36 aa)
MVRGSDFDGHAILVSRCSLGNLPLAGVYSAKDSPHY*

>peptide 4 (33 aa)
MFIRWLNLVSTLGIEIQLWIFSDTWIVVDLFCF*

Sequence

>CNT30631225
AGACACCACCGAAATAAATTTATGAAGAGCATAATGGTCGTTTAAAAGTTATGGAGTGCAAGTTGTAATTTTGGAGGTGCACAAAGAAAAAACCAAGAAG
AGCGGGTGCATTTATCAGAAAACCAACAAACTTTCAAATAGTGAATTAGGGTTCGTCTATTCTCTCTTATATAACCGACCTTGCAACCTTGCTTCATTCA
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ACAACATTAAGTGGTGTGCAGAGTTGAAAGTTGGCTCGCTTCTCAAACTCGCAGGCTGGGTTTTTGAACAAAATTTGATGCGGTGATAAGATGCAAGAGA
GTAGCTGAAGCGGTGCTTTTGTGGCAGCATCTAGATTAGCTGGTGCAGTCTTTCTGGTTTGTTCAAATAACAACTCTTTTCTTGCGGTGCAGTGAAAATT
CTACTGCAGCAATATCAATTGGCAACACTTTCTTTAATTCCCTGGTGCAGTGAAAGGGGTGCAGCTGCCACGAGAAGCAGTTGAGATCAAGTTTCTCAAA
TTCAAGAATTTATATAGATTTGTTAGAGTTAAGTAAACTCAAATTATTGACTTGAATTGTAAACTCATATTTCATGTAACGTTTATTTTAATAGGTAAAT
CTATTTAAATAAAACATTACATAAATTAAATATCAAAAGGAGACGAAGCTTAGAGTATAAAAATTTTATAGTTATCTTATCAGAAAGAAAACTAAGGTAT
ATCAAGATACCAATAATAAAACAGAAAGTAAAAGTGTGATAATTGACCAAATATCTAGGCAACAGAGCATACAAGTGGTACTTGAAAGAATGAGATCTGA
CCACAAGCTTGAATGAACATGAGCATACAAGTGGTACTTGAAAGATGTGAAAAGGGAACCTTTCCTCTCCCCAGCCTAAGAAGATGTGAAAGCGTCTCTC
GCTCTATAAAAATGGTGCGTTCTGTGGTGTGAAGTGGGAGACAAGGAATTTCATAATTGGGGTTTTGAATAAGATGACCTTTTCCTTTTTCATTCTTATT
ACTTTTTCAAATTGAAAAAGTAATAAGAATGAGAGGTGTTAAGGATGTTGTTTAGATTTTAATTCATCTATGTCTTTTATCTTTGAATCACAT