CANTATAdb - search

Detailed information on CNT30625082

BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)

Target	Query species	Target species	Query coverage (%)	Target coverage (%)	Identity	Alignment length (nt)	Orientation
CNT30317123	Daucus carota	Corylus avellana	2.72	31.55	86.15	65	forward

Expression of CNT30625082

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (43 aa)
MLFKKMLLFNNVLIWTNCFHQKLDKAAIIPPLCGPNLFNLFMYV

Sequence

>CNT30625082
GTGGGGTCCAGCACAATTGCAACAATTTCTAACATATAACAATAAGTATAAAGCACACTGCAATAGTTTTTAAATTATCAAATTAAAAGCACCTGTTTGA
ATACAAAAATTTTCTTACATTCCAAAATCAACATCCACAATATACATCCCTACTACTACTTAATGCCAACACTTAACCAAGCATAAAGAATCCGATCATC
ACAAACATTGCAAGTCTTCTTGACCTCCTTTACCTTGAGAAGTGTAAGCAATTGGTAATCCTGTAGTACTCTGCGCCACCAAGAAGAACAACCTCAGCAA
CAATAGCAAGTACAACTGATTAGATGACAAAATTCAGATTAGATGCTATTCGTATATTGCTCAATTGTAGTGGCTTAACAACTGATAGAGAGAAATAATT
ACACTGTATAGTATTTTATTTTGGAGTAGTACCATTTGTTCAGTTCTTATTTGCCTTAATTGTTTTAGCATTAAAATTATCAGTATTCAACTTGCATTAT
ACAAATTCTTTTACTTTTACAAAAACATAAGAGTTATAATCTAAAGGTATCTAAGTTAGTAATATTAATTTTTTCTAATCAGTATTCAGTTTTTGTATTA
TGCAATCTCTTCCCGTAACTTACTGCAATTGATTTTGTTGTATTAAGAACAGATGCAGTAAGAATTAATACTGTAAAGAAAAATGCTTACCAGTTGATTT
GGTACATAAAGATTCCCATCCTTGTACTTCAGCCTAAACGAGTCTTCAATTCCTGTCGCACTACCATTTGAGATCAGATGGGAAAACCAGTCAAGTAAGC
TTGTTGGAGATTATTATAGATCAGAAGAATCAATATATGCTCAATAGCAGAACTCTTTTTGAAACATACAAGTTTGGGAATGAGAATCGGGGATGGACTT
GATTAATTGTATTTGTATTTCTTTATGGTTAATATGCAGTCCCGAGTTCTAAAATATCAAAGATGAAAATCTTCTTTCGGGTTTAAGAGCACACAAATTT
CCTTAAGCCAGATCCTGATTGCGAATGAGTTGCATACAGTATTAAACATGCAGTGTATTCATAAAGGACGACGACGTTCCATATAAACTATAATCCCCGA
TTTTTATTTTTTGGTGTCTTGCAGTACTAAGTGCTTGAACTTCGCATTTAACAAATACACTATACGAAGCTTGCTCAAGTCACCTTAAGCATTTGAATTC
TGTTCTGTCTTGCTCTGCTTACTGGAGTCTACTACCACCCCTAACCACCTTGTTTTCACATTTGCCGCTTACACCACTTTTCAAGACCAATAACAGTTTA
TTTTCGGGCTAGATTTCTCCCGCCAATTCCTAATTAACTACTCTACTAATAGTCTTTTATTAAAATTAAAGATTATAATTTATATCAATCCCCATATACT
TTTCTGTTTGTATAGAGGTTCACTTATTTAAGGACAGAACCTAAAACAAAGATAATTATACCAATGGTAGCCATCTAAATTCATACAAAATGATAGTTGG
TCAGCAAGCAAATGACAAATACTAAAATAAATATGGGACAACATTCCACAGTAGTACCAGAAATTAGACAGCTATTTCTTACCATATTATTTTGAACATA
GAGCTCTCCTTAAAAAATAATCTGCAACCAAATAAAATGATCAAATTAGAGTAGGCAAATAACTCTAATTAGAAGATTAAGAAGGGCAAAAACTAAACAC
AGATTTGAAACTATTTCAGGGGATTTTGAGAAAGGTAGAAGAAGAAGTATAAAGTAGCTTATACCTCCTTAATCAACTTTATCACAATATTACGGAAATC
AACTTAATCATAGTACCCTGTTTTCCAATCATGTTAGATATCAAAACGTAAATGAATATACTAACTTTTAACTTCATACCACCTGGAGATCAACAAACCA
TACAGTGAGATGGATATACATTCATATCCACACAGTACAAAATTAACAAAAGAATAACTTAGTTACATACATATCTGTATACATATACACATGTAAAACA
CAAAATCGACTACAAGTGAGTGAGAAAAGTACCTCCGTCTTAAATTGTAGACCTAATTAAACCCAATCTGAAGCTTCAACCTTGAATCAGAACCCTAATT
GAATCGCTGTTGAAGCTTTAGCCTTAAATCAAAGCCCCTAATCTTGATTTCCTAAACTTACTTGAACCCCTTCAAGCCCCTTATTCTCCAGCCCTAATCG
AAGCCCTTTTCTTGAGCTTTCAGCAGCGGTTGTCTGGACTGATTGAGCCCAAAATGTTATTCAAGAAAATGCTTTTGTTCAACAATGTTTTGATCTGGAC
GAATTGTTTTCACCAAAAATTGGATAAGGCGGCAATAATACCGCCCTTGTGTGGACCAAATCTTTTTAACCTGTTTATGTATGTATC