Detailed information on CNT30615857


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30511835Sesamum indicumSolanum lycopersicum2.9924.4410065reverse complement

Expression of CNT30615857

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (39 aa)
MTTCNKAQANTSRPEEARLRLPDPGHNLPRDGDVVQYDG*

>peptide 2 (49 aa)
KNKKRDKRERQWKERERQEKRREEIRRGGSLRLCSISINIKVISPSNLI*

>peptide 3 (38 aa)
MLLLLCDVAELFNNYRLIGVIEIGSSWLHNEYWSNYWC*

>peptide 4 (68 aa)
MLIMTSLYSLKLILPYITNFLCLAYYKVLGYVYLVIVHFCKHHNFSFWKCIYFLCVKPYPISFFLFSFV

>peptide 5 (63 aa)
MMCYHTGCVTLYSLCCSTELVGSASTESRFVTVSIWYSLDSFNSSLKAFGVMNRKPFRKKDII*

>peptide 6 (35 aa)
MIITHIPTKTSKLLTQYVPQHYTTIPILRLLGRLM*

>peptide 7 (45 aa)
MILVSCCTYLYVCVIYRLIKLYLLSWQLIFRDVLLQETKCNDSSS*

Sequence

>CNT30615857
AAAAATAAAAAGAGAGACAAGAGAGAGAGGCAGTGGAAAGAGAGAGAGAGACAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGATAAGAAGAGGGGGGAGTTTGAGACTTT
GCTCCATTTCCATCAACATTAAAGTAATTTCTCCATCTAATTTGATATGATGTGCTATCATACGGGTTGTGTAACCTTATACTCGTTATGCTGTTCGACT
GAACTCGTTGGCTCCGCGTCCACCGAAAGTCGCTTCGTCACCGTCAGCATTTGGTATTCTCTCGATAGCTTCAATAGTTCACTGAAAGCCTTTGGTGTAA
TGAACCGCAAGCCCTTCAGAAAGAAAGACATAATATAGAATAGTTTAATTAAGATTCAAGTACCCTTGAAAAGACTAAAGGAACGGGGGAATGACTACCT
GTAATAAAGCACAGGCTAATACGAGCCGACCAGAAGAAGCAAGGCTTAGATTACCAGATCCTGGACACAATCTTCCTAGAGATGGAGATGTTGTGCAATA
TGATGGATGATGATGGGGATACTATAGGAGTTATGGGTCGTGTGATATGATGGATGATGATGGGGATATCATCTAAGCAGTGTGTGGTGTGATATGATGG
ATGATTATGGGAATATGTACGAGCTGTGTGCTGTGTGATATGATGGATGATGTAATATCATATGAGCTGTACGCTGTGTAATATAATAATTGACGATGGG
ATATCATACGAGCTGTATGCTATGTGATATCGAGATGAGATGATGTGATGGAGATGATGATAGTCGGGTAGAACCACTGAATATATTCCAGCTAGGCTAA
GCGGGACCACAAAAAACAATTAATAACTAAGAAAATTAAACTATAATGGTATGTGAATCATGTTGTGATTGTTACTTGATTTTGATGTTGGTTTTGCATG
ATTACCAATGGAAAAATGAACTATAATAAATGTGTATTATGTTATGAGTGGTGGTTGACTCTGGTATTGGGTTTGCATGAGTAATGTTATTATTACTATG
TGATGTAGCTGAATTGTTTAACAATTATCGACTGATTGGTGTCATTGAAATTGGTAGTTCGTGGTTACATAATGAATATTGGTCAAATTATTGGTGTTAA
ATGATATTAGTCTCCTGTTGTACGTACCTATATGTGTGTGTGATATATAGACTAATTAAATTATACTTACTAAGTTGGCAACTCATTTTTCGCGATGTAC
TTTTACAGGAGACAAAATGCAATGACTCATCTAGCTAGATTGTAAGCCAGTTGTCAGTCTTATAGGTGGGTTAATAGTGTCATCTTGAGTTGAGAGCTCT
AGTTATATAGATACGAGAAATATTAAATTGTGGATGAATTGGTATCTTATATTTTTTAATAGCAAAAATTTCCACGTTTCTCATTTACATATGGTATAGA
GAAGACCATTGTACCAAGAGTTCGATAAAGTACTTAATTCGCTTGAGGTGTATAACAAATATTGATTATACTAGTTGTCTTAACGGGATAAATATGAATT
TGTTAGGGTAATTAAATATGATTATGGAGGGATGTCCATTGGGATGGTGTTAGTTATGGAGGGGATGTCCTCCTCGGCCTCCCTCTTTCTGCTTTGATTG
AATTTGGTTCTTATAACTAATTCTTATTTAGATATAATTACATTACACGATGTAACCCCTAGCTTATTTATAGAGATCACCCATGTTTTTATGATAATTA
CACATATACCAACTAAAACGTCAAAATTACTTACACAATATGTACCGCAACATTACACAACTATCCCTATTCTTCGGCTATTGGGGAGGTTAATGTAATT
ATGCAAAATACAGAGATAATTTGTGTAAATACGCCATAAATCAGGAGATGTTGAAGCTTATAATTCTGACCTTAGTCGATTCTCTTACTAAATTTTGGTT
ATTGTTCCTTCAGTTGTGGGTTATTAGGTAGTTCTCCACTATTTTAGATGTACTCTCATTTTTTACGATGTTAATTATGACCTCATTATATAGTCTTAAG
CTTATTTTACCTTATATTACTAATTTTTTATGTTTGGCTTATTACAAAGTTTTAGGGTACGTTTATTTGGTCATTGTTCACTTTTGTAAACATCATAATT
TTTCATTTTGGAAATGTATTTATTTTTTATGTGTAAAACCTTATCCTATTTCATTTTTCTTATTTTCATTTGTG