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Detailed information on CNT30610101


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|P48386|CHS1_CAMSI, E-value = 0.0

BLAST vs NONCODE:
NONPOPT000627, E-value = 4e-32

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30700733Gossypium raimondiiQuercus lobata13.6684.5682.02356forward
CNT30381108Gossypium raimondiiManihot esculenta16.8478.6779.95439forward
CNT30405403Gossypium raimondiiBeta vulgaris3.0733.768580forward
CNT30524897Gossypium raimondiiPhaseolus vulgaris13.2356.1981.16345forward
CNT30156272Gossypium raimondiiPistacia vera37.964.0783988forward
CNT30192533Gossypium raimondiiSecale cereale6.8726.884.36179forward
CNT30564019Gossypium raimondiiActinidia chinensis11.5840.7684.44302forward
CNT30466546Gossypium raimondiiSaccharum spontaneum8.0678.9582.38210forward
CNT30647274Gossypium raimondiiRosa chinensis25.5138.2483.46665forward
CNT30680228Gossypium raimondiiTriticum urartu3.820.9782.8399forward
CNT30705527Gossypium raimondiiPrunus avium9.955.7286.82258forward
CNT3030385Gossypium raimondiiTheobroma cacao8.2954.1489.81216forward
CNT3022840Gossypium raimondiiPopulus trichocarpa37.3610081.01974forward
CNT30114123Gossypium raimondiiFicus carica34.656.1380.71902forward

Expression of CNT30610101

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (79 aa)
MSTPLVVQKTRWVILDLGWPHSLMALVAASLPSFGTSTTTISCLASSEEAMYSHTLGFSFKISSVRYMYRFLIIDFSPK*

>peptide 2 (62 aa)
MSNPKKGVPIGYAQWLKCFYQALFYILRNKPRNILKKVKCKPNFTKVTINCTITIWQDRLGC*

>peptide 3 (32 aa)
MEHNSLNSEARSKPKEHSPLQPFSCGLKPIFP*

>peptide 4 (42 aa)
MCFTRNEPNKLQSSFLEPKNNFNLFSSQTIYVANFFSIKVFA*

>peptide 5 (30 aa)
MNHAHLSFPSFIFMAESCMKHKVTSSLYIR*

>peptide 6 (31 aa)
MGFSISGMGSAPIITAAAPSPNNAWPTRLSR*

Sequence

>CNT30610101
TTGGTAGAATAGTTTGCAAAGGAACTTATTATTGCCATAAATTTAATATAAGTTGGTACATGAATTGAATAGGCGTTAAGCTTCCCGCCCACACCAGCAA
AGTCTTCTAGTCTTTAACAATAAACACACAAATTCATAGGATTTAAATAATCTAAAAAAGGAAAAAAGAAGAAGATAAAACTGCAAGCCAGGTGGAGCAC
GACCAATTACTTAAAAGGCATGTTTGTTTAACTTTAAGCAGCAACACTATGGAGCACAACAGTCTCAACAGTGAGGCCAGGTCCAAACCCAAAGAGCACT
CCCCACTCCAACCCTTCTCCTGTGGTCTGAAGCCCATCTTCCCTTGATTTCTTCCTCATCTCATCCAAAATAAATAGAACACAAGCACTTGACATGTTAC
CATACTCTGAAAGAACGTGCCTTGTGGCTCGTAGCTTCTCTGGCTTCAGTGCTAACTTGGCTTCTACCTGATCTAATATTGCTGGACCACCAGGATGAGC
AATCCAAAAAAGGGAGTTCCAATCGGATATGCCCAATGGTTGAAATGCTTCTACCAGGCTCTTTTCTATATTCTTCGAAATAAGCCCCGGAACATCCTTA
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GCTTCTCGATTTCGGGCATGGGGTCTGCCCCGATTATAACAGCTGCGGCACCATCACCAAACAATGCTTGGCCCACAAGACTGTCTAGGTGAGTGTCACT
AGGTCCACGGAAGGTAACAGCGGTAATCTCCGAGCACACAACAAGTACACGAGCACCTTTGTTGTTCTCAGCTAAGTCCTTAGCCACTCGGAGCACCGTC
CCCCCTGCGAAGCAACCTTGTTGGTACATCATGAGGCGCTTAACGGACGGGCGGAGGCCCAAAAGCTTGGTGAGCTGGTAGTCAGCCCCTGGCATGTCCA
CACCACTAGTGGTGCAAAAGACAAGGTGGGTGATCTTGGACTTGGGCTGGCCCCATTCCTTAATGGCCTTGGTGGCTGCTTCTTTGCCTAGCTTTGGCAC
CTCAACTACCACCATATCTTGCCTAGCATCCAGTGAAGAAGCCATGTATTCACATACATTGGGATTCTCTTTCAAAATCTCTTCTGTAAGGTACATGTAT
CGCTTCTTGATCATCGATTTTTCACCTAAATAATCAAACACAATAAACTTACTTTTAAGTCTCCCAATTTAGCATATAAGAGTGTTTTAACTGATTTTTG
GTCCCACTTCACTTGATATGGAAAATATCAGTTTAGGTTCTCCCCTCAAAATCCATTGCTAATTCAGTTTATAATATTACATAATACATACTGTCATTCT
CTATCTCATAAAAGCTTCAATCGTTAGAAGCTTTTAGGTGGGTTATGGGCGGAACAATGGAGTCTTAGGACCTTTATAAGATTCTCTTCTAATAGTTTAT
TAAATAGTTTGTCTAACAAATATATTTATTTTAAAAAATATTATAAATATTAGACTATGCAGATTTATAATTTGAGTAAAAAATTTATTTAAAAGTATAT
TTATAAAAAAATTTAAAAATTATAATTGAAATGATAAAATTAATTTTTTAAATTATAGAGTTATAAGTTAAAATTCCGTAAAAATATTATAATATAAAAT
ATAAAAGACAATAATTTCAAATTAACATTTATTATTCGTCCAAAAAATTAATATTTATATTCTTTGATATAATGCTTGAAACTATCCATAATACTTTCTA
ATCTTTAAATATGAGGATAAATGAACTTTAATGTGCTCGAATCCACATCTTTTTGCATTGGCAACAATGTCAATACCAATCAAGCTAAGACTCAATCAAC
TATATAATATTTGAAATCATAAAAATAATAAATATATAGTATTGTAAAAAAATAAAAAAAAATTATAAACTAAAACAATTAACAACTTACTAATATTTGG
AAAAAAAAACTTATTAATTCACTTGTATAAATTTCAAATTAATAATCAAATCCTTAATCTGTTGGTAGAAAACGTGAAACTAATATTTGAGACAAATTAA
GTCTGTAGAGTTGTATGATTTGAATAAATGTGCTTTACAAGAAATGAACCTAACAAACTTCAATCTAGTTTTTTGGAACCAAAAAACAACTTTAATCTAT
TTTCAAGTCAAACTATATACGTAGCTAACTTTTTTTCCATCAAAGTATTTGCATGAAAATGATATGAACCATGCACATCTATCTTTCCCCTCTTTTATTT
TCATGGCCGAATCATGTATGAAACACAAAGTCACCTCAAGTTTGTATATAAGGTAATTTAGCTTTTAGATCAAAGTAAAAAACTTACACATGCGCTTGAA
TTTCTCTTTCAACTCGGTCTTGTGCTCACTATTTGTGATACGGAAATAGTAGTCAGGGTATGTGCTCTGATCAACACAATTAGGTGGGGTTGATGTGCCG
ATGGCCAACACGGTGGCAGGGCCTTGGGCACGTTGAGCCTTACGAACTTCTTCCACGGTCACCATTCTTTTTCGGATGATCAAAAACAGCCAACGGTGGT
GGGTGTG