Detailed information on CNT30597359


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30201967Fraxinus excelsiorPisum sativum3.1645.586.8191forward
CNT30487428Fraxinus excelsiorOlea europaea21.9346.5383.52631forward
CNT30554303Fraxinus excelsiorOryza glaberrima3.0940.8385.3989forward
CNT3079268Fraxinus excelsiorBrassica juncea3.1633.5886.8191forward
CNT30688492Fraxinus excelsiorTriticum urartu3.1621.0684.6291forward

Expression of CNT30597359

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (39 aa)
SSFYLRPLFFSFFIDFLSNPNLISFLSTKEPKETQKAKI*

>peptide 2 (32 aa)
MGLLVNSTLMFIMSHSFTYESELLIYIFHLQC*

>peptide 3 (62 aa)
MDTMQTLHNLNEAANVKLVRVRVRSNLEDESGSPSVSLFFFALLHWKKGCRKLYVNKPKQDD*

>peptide 4 (49 aa)
MLKYCKRSTAHFLAAAKIFFGVVTPLLLMVMQMVYITLHLEQGQQVEME*

>peptide 5 (43 aa)
MIFYRMQSERPQPPKKQSLSKTHYTKKIAFATHKRQHSVVKCC*

>peptide 6 (42 aa)
MMLKFNGKVEDKQFIYDMLKPLVTDMYDIMVDWIKRWSIASR*

>peptide 7 (70 aa)
QVSIFDLFFFLFLLIFCLTLISSLFSQQRNPKKPRRLRFNPQNFPLPSTLFLLCVCLSLSLSLSLSLSYT*

Sequence

>CNT30597359
CTCAAGTTTCTATCTTCGACCTCTTTTTTTTTCTTTTTTTATTGATTTTTTGTCTAACCCTAATCTCATCTCTTTTCTCTCAACAAAGGAACCCAAAGAA
ACCCAGAAGGCTAAGATTTAATCCTCAAAATTTTCCACTTCCTTCAACCTTATTCCTTTTGTGTGTGTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
CTCTCATACACTTAGCAGTAGATAAACATCAACGATTAAGAAACGGATCATCGTCAATTTGGGCAGTGATGCTATGAGTTCCTTGACCACCTCACTCATA
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ATGTTTAGTAGGCTAAATTTATAAATCTCCATCAATGAAGAGCAACAAGTTAATTACAGGAATTGAAGAGTAAGATGTGATCTTAAAACACGAATTCACT
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AAAATTTTAAGAGTGCCATCTATAAATTTCTATTTTTGGATCTTGAGGACAGTTGATACTGAAATACATACTTATGTTCCTGCTTTGGAGTTTTATATAT
CCAAACTAATCATTAACTCTGAAGCTTGTTATATGTTTCCAGTCAGGCACAAAATTATACATTTTTGTTAGGCACTTGATGTTAGTAAAATTAACTTCAG
ATGTGTGCTACAATTTGTAGGTGAATATGCTATGGTTGAATGTAAACATTCTTGGGACTTCTCAAAAGCCCTTAGGAACTAAGTTGATGCTTTCACAACC
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CGTGGAATGTTGTATAGCTTTGTAAGGATTTTGATGGTAAAAAATTAAAGAAGAAAATGTGGGTTATGATGAAATTGTCATTTTAGAGAAAAGAAGCAAA
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GCTTTGACATATGTTACGGTGAGATTAAAGTTTAGATATCTATTGCATGAATTGAAGATTGCCCTTCCAATAATAATACTTTAGTAGTTTCTTATCATTT
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ATCATGGTGGACTGGATCAAGAGGTGGTCAATAGCGTCCAGATAGAGTTGGTATGGTCACAGTTAACGTTTCATTTACAGTGTGTTGCTCTTTTAGGTAA
GTGGTTATCAATCTTCCTTTTCTTTAGGGTCCATATTTAAGCCCTCTTCTTCTATTTTTAGTTTTCGAGAATGTATTATTTTTTCCCCTTTACTATTTGT
GTTCATTGGAAATGGTTCCATCTAGTTATGTGTATTTAATAGTCTCTCTTCTCTCTCATAGCTTCCTATAACTGTGGTTTAATTGTTTTCAATTTGCAAT
TTAGCTTCGTAACTTCTTATTAAATATGTCTTAACTGTGTTTCGCGAGAAGCCTTATAAGATAGGATTGAAGTTGATGGAGGGTTGTGCTGGTCTGAGAA
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AATATTGCAAAAATTCTTCCCTCAACGGCAACATCGACCTCCGCAACACATGCTAAAATATTGTAAAAGGTCTACCGCACATTTTTTAGCCGCCGCAAAG
ATCTTTTTTGGTGTAGTGACACCACTGTTACTTATGGTGATGCAAATGGTGTATATTACTCTTCATCTAGAACAAGGACAACAGGTAGAGATGGAGTAAG
TGAAACTCAAAGAAAGGCGAGTCTCTTTTTTAAATTTTCTGATGGGCTTGCTTGTTAATTCTACTTTAATGTTCATCATGTCTCATTCTTTCACGTACGA
ATCTGAGTTATTAATTTATATATTTCATCTACAATGCTAGAGGCAAATATGTTAATTGTGCTGTTGTAGGGTCATTCTGCGACTCGAAAATTAAACTCAG
ATGGTAAGATGGACACAATGCAAACCCTACATAATCTTAATGAAGCAGCCAATGTGAAGCTAGTTAGAGTTCGAGTGAGGTCCAACTTGGAGGATGAGAG
TGGCTCACCAAGTGTTTCTTTGTTTTTCTTTGCATTGCTACATTGGAAGAAGGGATGCAGGAAGTTATATGTAAATAAACCAAAACAAGATGATTGAAGT
TGGGGAATTATTTCAAATCGGTTGAATCGATGAAGTTTGTATTTGAAAAGGTGCAAATGTTCTTTGTCAAACCAAAGCTCAATGTACTGCTCAATTTGGT
TGGCTTGCCCTAGGAAATTGTATAACTTGACGTTATTAGTCACGCAACTGTAGGATATGCCATGATATTATGATATCTATATAATTATTTGGTGCATCAT
ATGCGGGTACTATTATACATTTTCATAATCCCTATATTTTGGAATTTTCAATGTTTTTGTTTGTTCTTTTGGTTCAC