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Detailed information on CNT30597133


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONORUT000291, E-value = 0.0

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30689906Oryza meridionalisOryza sativa33.8734.988.52845forward
CNT30554123Oryza meridionalisOryza glaberrima12.0231.7887.33300forward
CNT30110249Oryza meridionalisOryza longistaminata14.9548.8993.57373forward
CNT3099887Oryza meridionalisOryza rufipogon33.3536.4688.34832forward
CNT30116758Oryza meridionalisOryza nivara14.9937.9791.98374forward

Expression of CNT30597133

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (38 aa)
PLKNPRQWRSKCGDRPPSSPPPVAVAIVVSASSVLGAD*

>peptide 2 (67 aa)
PQESQAMAQQVRRSATVFSTSGCRRHCRFRLLRSWCRLSRRRSPGRFLPSPSRSASHRCHQDHGNLR*

>peptide 3 (43 aa)
MLAVMSGMWICVEYRLVFILLNAEIYLQIMLRFENDLLAARWQ*

>peptide 4 (70 aa)
PSRIPGNGAASAEIGHRLLHLRLPSPLSFPPPPFLVPIEPSPFTREVLAVAKPFCKPPLPPRPRQPSLDS*

>peptide 5 (68 aa)
MVVSCVPIGGECAQTDLRTSLNVYSLCLLYIHMCLYGGSWLIKLSTCLTLHSGGRCSIGRGHEGILAY*

>peptide 6 (84 aa)
MRGSWPIKLSTCLTLHSGGRCSIGRGHECTVGYQEELPMCVLNXTLHSGGRCSIGRGHECTVGYQEELPMCVLNLRTSVLFLSV*

Sequence

>CNT30597133
CCCCTCAAGAATCCCAGGCAATGGCGCAGCAAGTGCGGAGATCGGCCACCGTCTTCTCCACCTCCGGTTGCCGTCGCCATTGTCGTTTCCGCCTCCTCCG
TTCTTGGTGCCGATTGAGCCGTCGCCGTTCACCCGGGAGGTTCTTGCCGTCGCCAAGCCGTTCTGCAAGCCACCGCTGCCACCAAGACCACGGCAACCTT
CGCTAGACTCATGATGATTGCTTAAACGGTGAAGAAGTGAATTAGGTGCTGACATTTTCCAGTTGCAAGGCAAGTCCCACCTTCCTCTCTTTGATCACTT
TGAACCTATGTTTTGGAGGTTATTGAAAATGTTTGCAAATCTTGCATATCGATTGTACATTAATACATTAAAATTTTGTAAAACTTGTTAGACAAACTCC
TATTATTTGCATTATCACCTTAACTCCACATATACCCATATCCTTCATTCCTAACCTTAGGAACAATATGACTATGCCACTTTATATATGAGTTTAGATA
TCACTAGATTGCTGTAATGCTTAGCCATGCTTAGAATGGTCTTCCTTGTCATTATGGGCTCATTACAAACATGAAAATTGATTTTNGCTTAGCCATGCTT
AGAATGGTCTTCCTTGTCATTATGGGCTCATTACAAACATGAAAATTGATTTTTAAAATAATCTGGACAAAACTTTAATACTTGTGATTTTGATAAATAA
AATGATGGAAAACATGTATTTTAGGTTTGGGCCTCAAGTGTGCACATATGGTGGTTAGTTGTGTACCGATAGGGGGAGAGTGTGCCCAAACCGACCTAAG
GACCTCACTCAATGTCTATTCATTATGTTTACTATACATCCACATGTGTCTTTATGGGGGATCTTGGCTTATTAAGTTAAGCACTTGTCTGACCTTGCAT
TCGGGAGGCCGTTGTAGTATAGGTAGGGGCCACGAGGGGATTTTGGCCTATTAAGTTAAGCACTTGCCTAACCTTGCATTCGAGTTAAGCACTTGTCTAA
CCTTGCATTCGGGAGGCCGTTGTAGTATAGGTAGGGGTCATGAGGGGATCTTGGCCTATTAAGTTAAGCACTTGTCTAACCTTGCATTCGGGAGGCCGTT
GTAGTATAGGTAGGGGCCACGAGTGTACTGTGGGCTACCAAGAGGAACTACCCATGTGTGTGTTGAACCTNACCTTGCATTCGGGAGGCCGTTGTAGTAT
AGGTAGGGGCCACGAGTGTACTGTGGGCTACCAAGAGGAACTACCCATGTGTGTGTTGAACCTTAGGACGAGTGTACTATTCCTAAGTGTGTGATCGTAG
GATGATAAATTTCATACGTGTGTGATTTCCGTGAGGGGACGAGTGTACTGTTCCGTCTCACGGCATGGGCATCTAAGTGTGTCCAATACAGCGATATTGT
GCCACGTGGTGGGTTCCCGTTGTGTCCGTCACCACGGCCTTAAGTTTAAGGCGTGGGCCCGCTACTTAATGGTTCTAGGTCATATATCGAGTATGGTCTA
GGATGGAGGAACACGTATCGTGCTCATGCAAGGTTAGACAATACTTAATGTAAAAGCCTCGTTGTGACCTATAGACCGTACTCAATGTGTAGAGTACTCA
ATGTGTAGAGTATGGTGGTACCGACGGGTACCGGACAAACTAGAGTTATTCACATCATGTGGGTAAAGCTGTACAAACTCTGCAGAGTCTAAAAACTAAT
CGATTAGCCATGCTCGCGGTCATGAGCGGCATGTGGATATGTGTTGAGTATAGACTTGTGTTTATTCTCCTAAATGCTGAAATTTACCTTCAAATTATGT
TGAGATTTGAGAATGATCTGCTTGCTGCTAGATGGCAATGAGGTGAATATTTATACATGATTAATGCTTACTTTGATGCCCATATGCTAAGTACTAGCTT
GCTGAAATTTATTTGAAATAAAATCTGATTTGAAAGTGTTTTATGCAAACAAAACTTGCTTTATGCTAAAATGAACCATATTATATCTTCCTTGATTATA
TGCCTTGCAAGTAGGGTGTTAGGCTTGTCTTGGTGCTTGCCAGTATATTATTTCTAATAATGTACTGACTCTTGCTGTTGAATTAACCTTTTGCTTGCAG
GTTTTAGACTTAGTCTTTGAGTGATGCGGGTAATCGACTGCTTCTTCTAGGACTTGAACTTAATGGGGTAAACCCCTAGTCGGTGTGCTTGTGGATTGGG
TAGACAAGCTTCCGCTGTTCTATTATTTATTTGGCCAGTCGACCAGTGTAACTAAAGTAGATGTAGATTATAATCGCTTTTATCCTATTTGTGTTTGCTA
TGTATAACCATGCTTAAGATGAAAGTGTGAATCTAGTGCACATCTTGGGAACTAGATTCAAATGAGTATGAGTTAAGAATATTTGAGATGTTGTAAATCT
TTAGCCATTTTTGTCAAATCTCCTGAATGTGTAACACATCTGGTCGCCGCCTTCGAGTGGTTTGACGGGCACATCTCAGGCTGAAGTTGACTGGC