Detailed information on CNT30597053


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|F7J0M4|RGA4R_ORYSJ, E-value = 4e-169

BLAST vs NONCODE: nothing found

Expression of CNT30597053

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (33 aa)
MATGENTKIEQAGLDNMARKAGIVVNKYMLHSF*

>peptide 2 (44 aa)
MCQTWQLDDLYGQNFYLRSSYIECLQKFQFCYLLWEHCNSAPQA*

>peptide 3 (50 aa)
MTGCNLPPDKDELRIVMDDSSVMSGNLPLDKDKSSDVCCHPLRKKGSFVV*

>peptide 4 (37 aa)
MVLHCFLPLLFCFFANSFVKSNLLEAFGADVLDVDAT*

>peptide 5 (41 aa)
MEWMAVVTSTMLLDPVSTGKASLIVLFQYSLWMSSITMKNL*

>peptide 6 (52 aa)
MEVICLFCLLASESLSSRNLPGKTSAYSLGLGSTPQNSEKASGHRSYWCPSG*

>peptide 7 (65 aa)
MYWMLMPHSPFRSLQSSRNDSRFGRAPCWISGSVMVCTMMHKRRRLLSGPCPMTNFSRLGVISLR*

>peptide 8 (56 aa)
MQDELKHHAVSLACLHLSVTARSNRLNDAPVDQLVEVVRSNIQRTSERVCLNKPFS*

>peptide 9 (68 aa)
MTCMGRTFIFVLRTSSVSKNFSFVISFGSIVTVPPRLKYLSSNCLHIFLRCSSFKFSHSSRSKTRSSS*

>peptide 10 (39 aa)
MQLVHSVARYEQIIMLKQKCSQICNQLQILVYLYTTLLL*

Sequence

>CNT30597053
ATATATTCGATTGGATGTAGAGGCAGGTAAAAAAAATACCCTTCTCTAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAATGGAATGTCCTAGTAATATATAGAAT
ATTTTTAGCGTTTTTTGTGCATTAAAATTCAAAAATCGTAAATTCTCATGTGTGAATGTTCGTAATTATGAATCGTCACGGATGACGGGTTGTAACTTAC
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ATTGTGATTACACTGAAATACACATGCTTGCTCTACTGATTATATAATATGCAGCTAGTGCACAGTGTAGCAAGATATGAGCAGATAATAATGTTGAAAC
AGAAGTGCAGTCAAATTTGTAATCAACTACAGATTCTTGTATATCTGTACACCACTCTTTTGCTGTAACTTGGAAAGAGTGGTGTCACCATGATGCAGCT
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TCATTCACAGGGTTCAGCTTGCCTGGTGAAGTCCCATTAGTTTTGAAGTATGGCTCAGTATTGCTGCAAGATTCCCTAGAGGTTTGGCCCATGGAACAGA
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TTTTTTGTTTCTTCGCTAATTCTTTTGTCAAGAGCAACCTCCTTGAGGCATTCGGGGCCGATGTACTGGATGTTGATGCCACATAGCCCATTTAGATCCT
TACAGAGCAGCCGGAATGACTCCAGATTTGGCAGAGCCCCCTGTTGGATTTCTGGCTCGGTCATGGTTTGCACCATGATGCACAAGCGTCGTAGGCTTTT
GAGTGGACCCTGTCCTATGACAAACTTTTCCAGATTAGGTGTAATCAGTTTGAGGTAATGCAAACAGTGAACATTACTTAGGGCAGCAAGAACATCCCTG
TTGAGCTTATCAGAGGATGATAGACACAGCTCAGTAAGACCTTTCAGCAAGGTTACAAATGGAGGTAATATGTTTATTTTGCCTTTTAGCTTCAGAGAGC
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TCTGTAGCTTGCTTATTTTCTGGCCTACATCTTGGAGTTTGAAATTTCCAAATAGATGTGTCAAACATGGCAGCTTGATGACTTGTATGGGCAGAACTTT
TATCTTCGTTCTTCGTACATCGAGTGTCTCCAAAAATTTCAGTTTTGTTATCTCCTTTGGGAGCATTGTAACAGTGCCCCCCAGGCTTAAATACCTGAGC
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CACATTTAGTACTCAGCACTGTTTCTGAACCAGAGCTGCAGGCATTTGCTATGGAATGGATGGCCGTCGTCACCAGCACTATGCTGCTTGATCCTGTATC
TACAGGGAAAGCATCTTTAATAGTACTGTTCCAATATTCCCTCTGGATGTCATCAATTACAATGAAGAACCTATAGAGATGTATTGAGAAATAAGGTAAA
TGGATCAGTGCTTAGTAGACATGGTAATAGCAGTTTTTTTCTTATTATTATTAGTCATGTAAACTTACATAATCCATAGCTTAAACTTACCACACATGTA
GGCTGCATTTGTAACTTTTGGTTTGTCCCTTTTCTTTTGTCTTACATGTGTTCATCTAGGTTATTTACTCTAGATGGTTAGGCATATTCTTTTCTATTAG
TTCTCGGAACCATGAAATAGTGTTACTAATAATTGTCTAATAAGGCAAGACATTCTTGTGCTGATTGCACCAAATATTCTTACATTGTTAATTTGTCCTT
TTCCCTATGCTTAATTATTTAATCTTCACTCTCGATGTGCAATATTCATGTCATCTTAGGTACCTTGGAATTAGTCCATGAGCAGATTCAACTTTAATTT
GTTTTTTTGCCATCGATAAGTCATTTCTGCAGATTGCAACCTTAATTTGTGTTTTAGCCACTGATAAGTCATTTCAGCAGATTGCTTCTTAATTTGATTT
TTGTTTTGCCATTATGAG