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Detailed information on CNT30596845


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30554817Oryza meridionalisOryza glaberrima99.521.9796.81783forward

Expression of CNT30596845

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (37 aa)
DNSRESFFVSFFPDLLASLACVLVFSMSIGLGLEDSG*

>peptide 2 (31 aa)
MLTDPQVCFVLPSAAYESFRFRDVRVDFPVC*

>peptide 3 (29 aa)
MLSCLVKLNPNPYMRSAFFRLYSTVLFGL*

>peptide 4 (31 aa)
MFFFSNPRGFLYFWFDFSSGVFMLGVVFRGI*

Sequence

>CNT30596845
AGACAACTCGAGAGAGAGTTTTTTTGTGAGTTTCTTCCCTGATTTGCTGGCATCATTAGCTTGTGTTTTGGTTTTTTCAATGTCAATAGGGCTAGGTTTA
GAAGATTCGGGTTAATATATGGTGATTGTTTTTGCTCTCAACGTATGGATCTGATTCAGAATCACTTGTTTTAGTTTTGGAATCCGTTTAGGTTTTGGAT
TCCCTAAGTTTTTAGTTATAGTTTGATTCAGTTCAGTCTAGGGTGTTTTGTTACTGGTCCATGGTTTGCAAACGACCAGATTCGATGGTGTTCTATGTTT
TTTTTTTCTAATCCACGAGGGTTTTTGTATTTTTGGTTCGATTTTTCTTCAGGGGTGTTCATGTTGGGGGTTGTATTCAGGGGTATTTGATGGAGTTAAA
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TATCTGAATTCTTATGCATCTGAAGAATTTCGTTTTACATATGCATGCTGACTGATCCCCAAGTATGTTTTGTGTTGCCTTCTGCAGCATATGAATCATT
TCGTTTCAGAGATGTACGGGTTGATTTCCCAGTATGTTGAGTTGCTTGGTTAAATTAAACCCAAACCCCTACATGCGTTCTGCTTTCTTCAGATTGTATT
CTACTGTACTGTTTGGTTTATAAAATTCCTGTACATGTTCTGAACTTTTTGGTGCTGATCTAAATGAGTTAGCAACGAGCCAATACCTGAACTTGGTCCC
CGTTGCTTTGAGAAATTATGGGCTATTGGCTGCACCTGCTCTTTCTTCTCTTCTGTGTTTTTGTTCATTGTCAATCGCTCGTAAAATTGTAAATCTGTTT
GAATTGGCGCTATTTCTGAACTTGGGAACATAACTGGCACTATTTCTGAATTGGGAACAGGGGATAGCACGCTCGTAAATCTATTTGAATTGTCAGTATT
TTTTGAATTTTGGAGCTGGGTATTGCACAGTTTCAGTCGACATGAGCTTTTTAAAATCTCATACTTCAGCAAACTGAAAATAATTTGAAGGGTTTCAATC
TAATGTTGATCTAATGCATTTCAATGGTAGCAAAACCAAGGTCACTTGGGTGCCTGGAGGTATTCACATGCCTGAAATATCTGTATGATTTTTTTTCTTC
TTTATTCTGAATGACCCATCATCCCATCCCAATATTGTTCCCATGTTAATTATGTGTGGAGCTTGTTAGTCAGTTAACTCATTTGCTGTGAAATTTAATC
GGGAGGCTCAACAACAACACCTTGTATGGTCCATTCCCTTCTGCATCAGCTAACTTGTCACATATTGTTGTCATGTGAGTAAATTAATCTCAGTTTTCCC
CTGCTCTTGCTTTGGGCTGCTGTAATTAATCGATCAGTTTGTATTTTTGTCTCACCCTGCAGTTGTGTCATTTATTCGGAGATGCTTTTTCTCGATCTGC
TTTTGCTTGAGTTATATTGAACTGCATAATTTTGAAAGTTGGTCCTTTTAATTAGAGGAAATAAACTTGTCACTGATTTATATATATATTTA