Detailed information on CNT3058255


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30223397Amborella trichopodaHordeum vulgare1.4221.6789.7478forward
CNT30658346Amborella trichopodaTriticum dicoccoides1.821.8187.8899reverse complement
CNT30651680Amborella trichopodaRosa chinensis1.821.3885.8699reverse complement
CNT30721611Amborella trichopodaTriticum spelta1.821.4887.8899forward

Expression of CNT3058255

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (71 aa)
MKLENRTPLFAPVPYFFTPLAQLAARSPCLLLSLSSLLGAPFSLFSLSPSASKSLSNQCEQEQQPLNQSCM*

>peptide 2 (50 aa)
LIGDGYGGDDGIGGTFGGLVVVVSGDSGGGGGGDGGYVAMVVVVVEEQWW*

>peptide 3 (51 aa)
MEWSQSSKFWEICSWIGFSPTVQDSPPLLPMGVRLCLSRSVADHPKTLMVC*

>peptide 4 (47 aa)
MRFKHLFHFIIVKRLNKLYTHNSQVNILISILRQSITKLLISYTILN*

>peptide 5 (50 aa)
MFVYSSLLGCIHIIDIFYDIWIIILFEIGFEWLKLLESLLQINLKAHCLP*

>peptide 6 (36 aa)
MARLIRIMSFGHVISQWYVIPILWFDMLMLHSVFEE*

>peptide 7 (34 aa)
MTAKDYHNNMSQWNPVEEAQFIDLLLKEVKKGGG*

>peptide 8 (38 aa)
MGSVYSVQRQVFTCILQRIGEHIWHGWFGLKPCGRGKK*

>peptide 9 (36 aa)
MINLKCRPLCQLLSVHYYAHHTITLTIEVAAVKNSS*

>peptide 10 (36 aa)
MGAMKFQFTVWNFYLLLLSLDKYFFSLLCFGFPLFI*

>peptide 11 (45 aa)
MLNCGQCILLLIFYVEFYDGFTLYSFGKFTVVLSSGFLSIFSIYV*

>peptide 12 (44 aa)
MVVVIVVVVDLRIEWWWLGDCSGGTRGGEGLSVVVMGWWLVIER*

>peptide 13 (44 aa)
MRHGMEPVLEVLGDMFLDRVFAYCPRFPTTAPNGSPAVSQSQCG*

>peptide 14 (37 aa)
MEDVSLTLNNLPLQNSLENFLVVHVCIFITTWMHPYY*

>peptide 15 (45 aa)
MVWAMNAIFISFYFYFVISCPLLISYKFVLKKPFFQVDVLISFDS*

>peptide 16 (30 aa)
MIEEKSVGVYKGEKMLRGKEGILMASPFAH*

>peptide 17 (32 aa)
MVRIEAMWKGEEIGIDVFLKESRHLKTVFLSI*

>peptide 18 (32 aa)
MAEITGKLASNQLESPLFALSLLNIWLLLDLC*

>peptide 19 (85 aa)
MTECMVSNYGNFYDLERLKRKVKQFVAMYREVRNILRHLGFGWDKANQMVIAEPAIWDQCTAYKGKSLPVYFSELENIFGTDGSD*

>peptide 20 (66 aa)
MLYQYYGLTCLCCIQFLKNEFVRILSLFMGRGANVVIRSENGVGYECYIHIVLFLFRNLMSSFNIL*

>peptide 21 (52 aa)
MLYIYKMFFVFYFLDPSLGLNELDPTKSRSVSGVRSESMRNLVSLGTDLTRI*

>peptide 22 (58 aa)
MPTFECTLLRTPYYYTHHRSSSCEKFQLMGGATLVLHQSTLRVGVAIGSGQSTISNLD*

Sequence

>CNT3058255
GGCTAATTGGCGATGGTTATGGTGGTGATGATGGAATTGGTGGCACATTTGGTGGCTTGGTAGTGGTGGTGAGTGGTGACAGTGGTGGTGGTGGTGGTGG
AGATGGTGGCTATGTGGCAATGGTGGTGGTGGTGGTGGAGGAGCAATGGTGGTAGTGATAGTTGTGGTGGTGGACTTGAGAATTGAGTGGTGGTGGCTAG
GCGATTGTAGTGGTGGAACAAGGGGGGGCGAGGGGTTGTCGGTGGTGGTGATGGGGTGGTGGCTGGTAATAGAGAGATAAATGAGGCATGGAATGGAGCC
AGTCCTCGAAGTTCTGGGAGATATGTTCCTGGATCGGGTTTTCGCCTACTGTCCAAGATTCCCCACCACTGCTCCCAATGGGAGTCCGGCTGTGTCTCAG
TCGCAGTGTGGCTGATCATCCAAAAACATTGATGGTTTGCTAAAAATCCAAAGGGCTCAATATTTCAAAATCAGACAAGATTGATGTCAAATTATTGGTT
GCCAAATTCAAAATTGGTATAGATCGCAATTTCGCCTGTAAATCATATGGTGCTCGAATTTCCCTTGCACAGTCCTATGTCTTGCACTAGCTAAGACTCA
TGATTAACTTGAAGTGTAGACCATTATGCCAACTTTTGAGTGTACACTATTACGCACACCATACTATTACACTCACCATAGAAGTAGCAGCTGTGAAAAA
TTCCAGCTAATGGGGGGAGCAACCCTCGTTCTTCATCAATCCACTTTGAGAGTAGGGGTGGCAATTGGGTCAGGTCAATCCACCATCTCCAATCTGGATT
GAGTCCGGTCCGGGTCGACCCGACCCAGTATAAATATATAAAATATGGAAAAAATAAATGTTATACATATATAAAATGTTTTTTGTATTTTATTTTTTAG
ACCCAAGTTTGGGTCTAAATGAATTGGACCCAACCAAGTCCAGGTCCGTGTCCGGGGTCAGGTCTGAGTCCATGAGGAATCTAGTTAGCTTGGGTACGGA
CCTGACCCGCATTTGAGAAAGAGGGACTTTGTTGCACTAAAAGGCGCGTAAAGGATAAAAGACCCATTTGAGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTCAGAGAG
AGAGAGAGAGAGCCATATCTGATATAAGTTTGAAGAATACGTCACAAACTTATCCTCACAAGCACGTTTGGTTTGCGTGAAATTGTTTTTTAGAAAACAT
TTTCATTCTCTCATGTGGTTAAATGTGAGAATGTTTTTACATCAATTAGTTGCCAATTGGTGTGAAAAGATGCACTAAAATCAATTGGTATTAAAATATC
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CCTCTTTTATTCTCTCTCAACACACTGCACTCCATACTCTCCCTGACGAGGCATTATCCATGTTCACGAGGCCCTTCCCATTCTTCAGTATTAGGTGTAA
GTTATCTATACTACATTATTAAGTCAGAGTTAAGGGGAAAAATAGAAAGGGACCTTAATTCTATCGAGGTTATTGGACACATCCCTAACTCTAAGGGATA
TCTTCTTCTCAATCTCTTTAAATCTTTAGAAAGAGAGAGATGTATGTGGGTGTAATATGTTGAGAGAGAAACATCGAAAAAGGATATCTTCTCAATCTCT
TAAGTCAGAGTTAAGGGGTGAACACGAGTCGCGAAAATAAAAGGGACCTTAATTGTATAGAGGCTGTAGGGCACATCCTAACTCTAAGGGCGTGTTTGAT
AACAGGAAGTTAGTTCCCAGATGATGGAACTTATCTGTCACTATTCATATTTTGTATTTGATTAAAAAAAGGTAAGATAAAAATATAAGTTCATTTTACT
ATTGATGTTCCACTTTTACAGGTAGAAAAAATTTCATAGTAAACCATGAAACTTGAAAATAGAACACCCCTCTTCGCACCTGTGCCATATTTCTTCACCC
CTCTCGCACAGCTAGCCGCTCGCTCGCCCTGTCTCTTGCTCTCTCTCTCTTCTCTTCTTGGAGCTCCCTTCTCTCTGTTCTCTCTCTCACCCTCTGCGAG
CAAGAGCTTGAGCAACCAGTGCGAGCAAGAGCAGCAACCTCTCAATCAGAGTTGTATGTAGATTTTTCAATTTTTTTTCTGTTTTCAGTTTTTTTTTTTT
TAAGAATCCCTGTAAAAAGATTTAGGGCTTTCCATATTTTACAGGGATTCCTTAAAATAATTTGGCGCTTTACCAATATTTCCCAATATTTGAGAAATTG
GGAAAAAATGGAATCCCTGTGAATTCTGCTTTAAAAAAATTTGGGGCTTTAGCAATATTTCTCTGTTGTAAATCTGCTGGATTTTATTCTATCTTCTTGT
TTCTTGTTCCATTTCTTTTCATACACAAGTGACCAAGATACTTGGATTTATTTCATTGATTCATGATATTTGATGCCCTAAATGTATGTAAAAAGTATGC
AACCTTGATTCATATATTTATGTATTGGTGATTCGAGTTTACTGATTCTAGAGAGCTATAATAGTTCTTTATTTTATGGCTTGCAATGGGAGTCAAGATA
ATCTGATTGATTTAATTGATTCATGATATTTGATGCCCCAAATGCATGTAAAAAATCAGGAAGCTTGATTCTTATATTTATGTATTGGTGATTCGAGTTT
ACTGATTCTAGAGGACTACAATAGTTCTTTATTTTGTGGCTTGAAATGGGAGCCATGAAATTTCAGTTTACAGTATGGAACTTTTATCTATTGTTATTGT
CCCTTGATAAATATTTTTTTTCCCTATTGTGTTTTGGATTTCCTTTGTTTATTTAGTGGTTTTTGGTGATGTTCTGTACATAACAAAATTGGGAATGTTC
CTGTATAATCTGATTTATTTCCTTGATTCACAGTGGAATCGATGAAAATATCTCTCCTCTGTACTTTTTCTTCCATTCTTTCTCTGTCTCTACCCTAACC
TACTCCAACATTTTTTCCTATTTCCAGTTCTCTCTCAAACCTTTTCTACATTTGCAACAAGAGATAATGAGGGAAAAAGCTAAGCATGGGCAAAGTATGC
AAGGAGCAATTACAGTGAGAAATTGAACTTTTCATGGAGAGAAATAATTGGGATCCGATTAATTTTGATTTTATGGGTTTTTTAGATTTTTTGAAATGTT
GGTTACAGTGAAACAATCGAGGACTTGTTTACTTTGACAATTGAAGACAACCGTTGTTGTAGGGGAGGGTTAGACAAAAATTCATGACCTTTTTAAATAG
ATGATTGAAGAGAAGAGTGTTGGAGTTTACAAAGGAGAGAAAATGTTAAGAGGTAAAGAAGGCATTTTGATGGCCTCTCCTTTTGCTCACTAATGGAGGA
TGTCTCTCTCACTTTGAACAACCTTCCTCTCCAAAACAGTTTAGAGAATTTTCTTGTAGTGCATGTTTGTATATTCATCACTACTTGGATGCATCCATAT
TATTGATATCTTTTATGATATCTGGATCATTATTTTGTTTGAAATTGGGTTTGAATGGCTGAAATTACTGGAAAGCTTGCTTCAAATCAACTTGAAAGCC
CATTGTTTGCCTTGAGTTTACTCAACATATGGTTGTTGCTTGACTTATGTTGATTTGATCTGTGAGAGGTTACAAACTTCAAGTGTATCTGATAGTATGG
CTAGACTTATTCGAATTATGTCATTTGGCCATGTTATAAGTCAATGGTATGTTATACCAATACTATGGTTTGACATGCTTATGTTGCATTCAGTTTTTGA
AGAATGAGTTTGTTCGTATTCTTTCTTTGTTCATGGGTAGGGGAGCCAACGTAGTAATTAGGAGTGAAAATGGTGTGGGCTATGAATGCTATATTCATAT
CGTTTTATTTTTATTTCGTAATCTCATGTCCTCTTTTAATATCCTATAAATTTGTGTTGAAGAAGCCATTTTTCCAAGTAGATGTACTTATATCTTTTGA
TAGTTAATTACTAGCACATGTTTGCTCTTGAAGGTTGCCTGTGCATTGAGTGTTAAAATCTATTTACATATTTGGTATTATATTGGTTGAATGGAAGGAG
CTTTATTTAATTACAAAATGTTATTTAAAACACTGCATTTCACACATCATATCAATGAAATACATAATTAACAGTATTGTACGCAGAAGAAGGCACTGGT
TATTGTGATTTAGCTTGTTTCAAATTCTATTTTGTTGGTTTTCATGTGAGCATCTATGAATATGAGAACACCTTCGGAACCTTTTGTGTGCTAAATGCTA
AACAGTTCAGCATGCTAAATTGTGGTCAATGCATTCTTCTTCTGATTTTTTATGTTGAATTCTATGATGGTTTTACTTTGTACAGTTTTGGCAAATTCAC
TGTGGTACTTAGTTCTGGCTTTCTAAGCATTTTCTCTATTTATGTTTGAGCTATAATGCCTTGTACTTTTTATTATTTATTTATGTTTAATATTTAGTGC
TATCTAGTTTAAAGAAATCACCTAACGAGGCTTTATTATGACTGCTAAAGACTACCATAACAATATGAGCCAGTGGAACCCTGTAGAGGAGGCCCAATTC
ATTGATCTCTTGTTGAAAGAGGTCAAGAAGGGGGGGGGGTGAGGAAAGGCGCATGGAACTGGATGACAGAGTGTATGGTAAGTAATTATGGGAACTTTTA
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AATCAAATGGTGATTGCCGAACCAGCCATATGGGATCAGTGTACAGCGTACAAAGGCAAGTCTTTACCTGTATACTTCAGCGAATTGGAGAACATATTTG
GCACGGATGGTTCGGATTGAAGCCATGTGGAAGGGGGAAGAAATAGGTATTGATGTCTTCCTCAAGGAATCTCGGCATCTCAAGACTGTCTTCTTAAGCA
TCTAGTCTTTTCTTTCGTTAAAATTCTAATTGTTGTCTAAATATTTTGTTTTTTAATGTTGGGAACATTGTGGGACAAACAACAATGTTGTTTTATTGTT
GAATGAGATATATTTTTATAGGTTATTGTTGAATGGGATGGTTTCTTACTGCTTGCATATGGATGCATTAATTGTGCATGTGTGTTTGTCTGTTGTGCTG
AAGCTATTATAGCACAGTCCAATAAAATCCAGGAAACCAAATCCATAATTGCCATGACCGCCGATAGATATGAGTGTGCACGTGTGTGTGTGAGAGAAAT
AGCGAGAGAGCGAGAGAGTTTGTGTTCGGTTTAAGAAGAAAGTCATCGACTACCTCTTATGAGATTTAAACATCTATTCCATTTCATAATTGTAAAAAGA
CTCAACAAATTGTATACCCACAATAGTCAAGTAAATATATTGATTTCTATTTTAAGACAGTCGATTACGAAACTATTGATTTCGTACACGATATTGAATT
GAGGTTGTGCT