Detailed information on CNT30578362


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONORUT002200, E-value = 9e-157

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30555550Oryza barthiiOryza glaberrima66.8182.9899.371896reverse complement
CNT30108684Oryza barthiiOryza longistaminata52.5486.5498.391491forward
CNT30116079Oryza barthiiOryza nivara20.5459.9897.08583forward
CNT30603695Oryza barthiiOryza punctata9.0935.6494.96258forward

Expression of CNT30578362

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (37 aa)
MLWSCVLWVQWYISGQSRTIRIAVPVVKGGSNNVFRD*

>peptide 2 (34 aa)
MHCNTNLSAYLVMLFSIMSWQAMHMFMLIYVAFI*

>peptide 3 (45 aa)
MPFMQMSFIMPSFVILCTCIFAVWLVEYVICSFLQYSFIRGGVLQ*

>peptide 4 (45 aa)
MEVWFVQPGLVVQMWLGLCNTGVLYGIYLILLKLLHCFTILPNVY*

>peptide 5 (42 aa)
MAKMLNSIFLLDILQRYAPARPCQLIWHTFLQAALTYTFTVD*

>peptide 6 (43 aa)
MISEQRNLLSFLAAAGCIFLLLCCGVVSCGYSGTSLARVELFE*

>peptide 7 (71 aa)
MAQLLVCFPLSAVQGDAYYICIPLFSGSKSAEVLQLHSKGIGFIIESFSDVCNLTNSNVVSLSRRQEPLVS*

>peptide 8 (37 aa)
MTCQQYYPVLFSPLMIELDVNSMSSLSCQAQGGNNPI*

>peptide 9 (40 aa)
MSTPCPHCLARHREATIQSRRDGMGSQLKGAVAAATVGRT*

>peptide 10 (61 aa)
MSSELSMFMLLCMSSDLYIFRSPVYILRYSVIAYYYRWQRCLILFFYWISFSDMPLPGLVS*

>peptide 11 (35 aa)
MLILAIFIHQRRSTSVKVMIRRIRLCSGRVACGVES

>peptide 12 (37 aa)
MIYSWYGGLVCTTGVGCSNVVGPMQYGCVVWYLFNIA*

>peptide 13 (64 aa)
VDVMELTSAGSHLENGTFVSCPLTVKYGTIISVFSPFCGAGRRILHMYPSILWIKECRGPSIAF*

Sequence

>CNT30578362
AGTTGATGTGATGGAGCTAACATCAGCTGGAAGTCACCTTGAAAATGGCACATTTGTGTCTTGCCCATTAACTGTCAAGTATGGCACAATTATTAGTGTG
TTTTCCCCTTTCTGCGGTGCAGGGAGACGCATATTACATATGTATCCCTCTATTCTCTGGATCAAAGAGTGCAGAGGTCCTTCAATTGCATTCTAAGGGG
ATAGGGTTCATAATTGAATCGTTTAGTGATGTTTGCAATCTCACAAACTCAAATGTCGTTAGCCTCTCTAGAAGACAAGAACCATTAGTGTCATAAATTA
TCAGGTTTGGATTTTAGCAGTTCTAGGTTAGATTATAATTCCAGATTAAAGTGAAAATGATGAAAGTTATAAATTAAAGATTTTGAATGAAAACGTTACC
AGATTTTTTTTCTCCAATGGAATGTTAATTGTTATGTGCAATATATACTCTTAATTAAAGTTGTGTGCATAGATGACCTGCCAACAATACTATCCCGTAT
TGTTCAGTCCATTGATGATTGAACTGGATGTCAACTCCATGTCCTCATTGTCTTGCCAGGCACAGGGAGGCAACAATCCAATCTAGGAGAGATGGGATGG
GATCCCAGCTGAAGGGAGCCGTGGCGGCAGCTACGGTTGGGAGGACCTAAGCCCTACAGCCAAGCTCTATAATCAACCCCCTTTTGCTTACTGGCGATAA
GTCAACCAACTTCCAATGATGCAGGTACTGATCCCCTCCTCCCTCCCTCTCCCTCCCTCTTTATCACCACATTAGCCGATTGATCACCAGCTTTTTATTC
TGATTTCTCCAGTGAACTTTGTTCACAAAATAGTGTTTTTTTCATTTCTGATGCTTGTGCCTATCGTGTGACTCCTCCGCCGACATGTACATTGATATCT
GCCCAACTAATTGATGAAATGATCGTTTACATTTTTTTTTGTCCAGTCAATAGTTTCTGATCAGTTTGGAGTAGTCTGTGCCATGTTGCTGTGATAATGC
TACAGGTTAATCCTCCTGGCTCTCTGTACTGAAACAATTTCTCTGGATCTCTTTCCCTTTTGTTTTGGACCTTATACAACCTGCTGATGGCTAATAATGA
CATTCATGAATAATAGATCATATTAAAGCTGTTTGCATGATCTGCTCTTGTCAAATAGTTTTATGCAGTGACAACTCTTATTAACTGATCAGGTTGACTT
CAAGCATTGGGCTAAAAACTAAGATTATGTAAGTTAAATAACATATATGCCGTCATCTTCAATTTAAGTGATATTGTGTCAATCTTCTGATCAACTGTTT
ACATCTTCGGATTATATAGATTCATGTCACCTGTGTATGTCTTCGGAATTATCTATGTTTATGTTACTGTGTATGTCTTCAGATTTATATATATTTAGGT
CACCTGTGTATATCTTGAGATATTCCGTAATTGCATATTATTACAGATGGCAAAGATGCTTAATTCTATTTTTTTACTGGATATCCTTCAGCGATATGCC
CCTGCCCGGCCTTGTCAGCTGATATGGCATACATTCCTCCAGGCTGCACTCACTTACACTTTTACTGTAGATTGATAGGTTAATGTTCCTTTGTCAAGGT
GAACCAATCAGCTAATGATGGTTCATATAGTTCTGATTTGAGTGCAACTATGTATCCACTATGATGTAGAATTATGGGTATTTACAGATGCAATTTAAAA
GGTATGCCACTTAGGAATCGACACTCAGGCACATGCACCTAGGCTTGATGGGTAAGTCTGGCCAATTTACATATGGGGAACACAAATTAATTTAATCAGT
TATTCCAATTTATTCTTCTTTGTTTCTATGCATTGCAATACCAATTTGAGTGCCTATCTTGTCATGCTATTCAGCATAATGTCTTGGCAGGCTATGCATA
TGTTCATGCTTATATATGTAGCATTCATATAAGTAACTATTAATTGGATTGCTTGCTTTGTCTAATGCAGCCTCACCATTTCATTTGTGGCGAGTACCTT
AATTCCATCTTGCCATTATCGAGGGAGTATATCATCTGCACCTAATTCTGTATATAGAGTATTTATTGACTAGGGTCTTGGAAATTTTTGAATTGCTGTC
AGATGTAAGTTCCTCAGATTGATGATTTGATTAGTTTCACAGCTAATACCATTGATCACAGCTAAACACCACTTATAGAAGTTTAATGGATTTTTATCTA
AAAAGGGAAAAAAGGAAGTTAATAACTGAAACTGCATAGTAGTACTATGATCTCTGAACAAAGAAATTTGTTGAGTTTCCTAGCAGCTGCTGGGTGCATT
TTCCTCTTGTTATGTTGTGGAGTTGTGTCTTGTGGGTACAGTGGTACATCTCTGGCCAGAGTAGAACTATTCGAATAGCCGTGCCTGTGGTTAAGGGTGG
GTCTAACAATGTTTTTCGTGATTAGTCTCACATTACTCACTAATAATGATAATATTGTGATAATTAAATTGACTCCTGGTTTGGAATGATATATTCCTGG
TATGGAGGTTTGGTTTGTACAACCGGGGTTGGTTGTTCAAATGTGGTTGGGCCTATGCAATACGGGTGTGTTGTATGGTATTTATTTAATATTGCTTAAA
TTACTCCACTGTTTTACTATTCTTCCAAATGTTTATTAAATGCCGTTTATGCAAATGAGCTTTATTATGCCATCCTTTGTTATCCTGTGCACTTGCATAT
TTGCTGTGTGGCTTGTTGAGTATGTCATATGCTCATTCTTGCAATATTCATTCATCAGAGGAGGAGTACTTCAGTGAAGGTGATGATCAGGAGGATTAGG
CTTTGTTCGGGTCGAGTTGCTTGTGGAGTGGAGTCCCC