« Back to Oryza barthii search


Detailed information on CNT30577239


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Expression of CNT30577239

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (73 aa)
MITGFGGKRVKLSVKMWIQLGRNRLSQNSLHDLISSNMTQRGCLPWTAGCIKTRFTVLIHFQPLLTSEIPYCY*

>peptide 2 (38 aa)
MIGRTALPKDYLLLVVVGGFCKPIVSGSSFIFFSPFSL*

>peptide 3 (35 aa)
MCCNLYPRSRITRSRSECRGSKDELLFEVLINRWA*

Sequence

>CNT30577239
CAAACACTGAGTGTTTTTTTTAGAGAAGGAATTGAAGTTTCAAAGTAACTTGAAAGCGGGTTTCCTGAAAGTTTATGATGGATTTGCTCGGTTTCTTACT
TTAGAAAAACTTGGACAGCTTTTTTTGATGGGGAAGTTTCTGGTTGCTGTGTGTTCAGTCAGTATCTCAATTTTCAGATGATCATGATATGACTTGTGGA
TACTGAAACCAGATAGTTCTGAATTGTTCCAACCAATAAGGTGCTATGGTAAGTGCCATTCTCTTGATTCCTTGTCTTGCCAGATGAGGCTTCTTAACTG
AATATCTGATGGTGCTGCTTTTTTCTATGCTGCTGAATTAACTAGTCGCAGTTTTGAGCAGGTCTTCAGCACATGGTTGGTGTTTAGCCAGGGATAATAA
AGGCCATGTGCTGCAACCTGTACCCTAGGTCGAGGATCACTAGAAGTCGCAGCGAGTGCCGAGGTAGCAAAGATGAACTACTCTTTGAAGTCTTGATCAA
TCGGTGGGCATGATTACTGGTTTTGGCGGCAAGAGAGTGAAGTTATCAGTAAAAATGTGGATTCAGTTAGGAAGAAATCGGCTGTCACAAAATTCTCTGC
ATGATTTGATTAGCTCCAACATGACGCAGCGGGGTTGCTTACCTTGGACAGCTGGATGCATCAAGACCAGGTTTACAGTTCTAATTCATTTCCAACCGTT
GTTAACCTCTGAGATTCCTTACTGTTACTGACTCGATTATCTCTTGATGTGATATGATTTCCTCGTTCTCACAGGCTATGTGTTTTAGACCGAGTGGCTG
ATCTGAGAGGTACTGGATACTCAAATCAGCAACCAAACATCGGGTTTTTGGCAGCTAGGCAAAGGTTGAACGAAACGAACTCTTGATCAGATCGGTGGGC
ATAGCCATCAGATTCAGCAATCAGCACTAGCTTTTCACAACTGTCGCAGCTCAAAAGATGATTGGCAGAACTGCATTACCGAAAGATTACCTGCTGCTGG
TAGTGGTTGGTGGTTTCTGCAAACCCATAGTTTCAGGCTCTAGCTTTATATTTTTTTCCCCCTTCTCTCTTTAGACTGGCTTGACTCTGACGGAAGTAAA
GGGAAATAGTTGCATCAGCACGAACTTTTTTAATTTTTTGAACTTTTTAATTTTAAAAATAAACCCTTCTAAAACATATCTATTATATTATTAAAACAAC
CTTAAAAAGAGGCACCACGTTCGCTGTGGGGGTTAAAAATTCCCACATTAATCAGAAAAAAAGAAAAAGAAAAGAAAAGGAGAGTTCAAGTAGAGCTGTG
GGGGTTAGAAATTCCCACATTAATCGGAGAAAAAGAAAAAAAAAAGAAAAGGAGAGTTCAAGTAGAAATACAATCTAAAAATAGTTGAAATTCGGAATTA
AAAATAAGCAATATTAAAAGAAGTTTCCATGTAAGAACCTAATACGAGATTAATCAAAATTCG