Detailed information on CNT30576263


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30697844Oryza barthiiOryza sativa2.125.195.2125forward
CNT30107843Oryza barthiiOryza longistaminata2.137.6592.8125forward

Expression of CNT30576263

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (43 aa)
MQACGGRRFVAVRAHRGRWSGGRNGGEVDGIVSIGFDVSLKLW*

>peptide 2 (77 aa)
MKAVLHRFDADLHGNFCWSLVKHPKNLRPLLQKVFFHTVKIHFCTRLTYRLPESVCKNYHFSVRVAHPGAHVVCTQK*

>peptide 3 (69 aa)
MDLHIDDGRMTDGPGPEEYMAGAPPSSLSALANLALLICWLVRSFVRSISSPAGRSSCVCQSRPPPAGE*

>peptide 4 (58 aa)
MHIMESPSKFSSFSVNIFGASVVTYKIAVSIVNLQYYELPCVIIRKHRDGIRRFPGNI*

>peptide 5 (57 aa)
MKARTTTSSRRTDPRRRRSNHARPDRSDLIWSKHMHIYLVINLLLVSCFGFSICLTF*

>peptide 6 (50 aa)
MQPLLHHDPSAYMIRSIVLKKYRCTHITYTDRMMMFPVDAVYLSLYRQAS*

>peptide 7 (45 aa)
MSWCFSTISASCMTLILVFCWHACSIACVHSLYRYFKGLVYFLYI*

>peptide 8 (43 aa)
MKCFCYIYIYFYSICNSDKGLVSYYLFAVMRLQSTVCSFRGLT*

>peptide 9 (42 aa)
MLFAGVVGGACLLAGMGDGTVDFVVLWPVNRQVKSPLVLPAA*

>peptide 10 (36 aa)
MHGLAKTWMQLCSSAYQLYNSTIEIYWNYPLTFLYE*

>peptide 11 (37 aa)
MKLIGSQVKYKHIYLDIFTPLNVSSGGGGYSVSPPPH*

>peptide 12 (33 aa)
MVSWILSTTSSSFYHNSDHVEVLFGVEHVWVEH*

>peptide 13 (35 aa)
MEFCPRNLSGMQSWASEHGFALPVPDLTHCHPYCS*

>peptide 14 (38 aa)
MVWLKHGCNYAVQHINSTILQLKFIGIIRLPFSMNRIK*

>peptide 15 (39 aa)
MPTGYPSGMGAGIWSFARETYRACKVGHPSMVLLYPCLT*

>peptide 16 (40 aa)
MNLLFRVEWLFRFIRATIQLYGSINLLLLLLLLLLLYYDD*

>peptide 17 (41 aa)
MEFLSLTAGQRQALFLVLSLVVSSLASPPQMLKVARELRFA*

>peptide 18 (29 aa)
MMTAKGGELAMAGDVGRGRQDSDDGGQGC*

>peptide 19 (32 aa)
MQVSPCKRVLLVRLSIYLQKTAGCGWLQYYNY*

Sequence

>CNT30576263
CAATACTCTATATTTATTTCCACTCGTCAGGTTTGGTCTACCCTAGCCTAAATTAAGCCAGCAACCCAACAGCAAATAGTTGGCCTTTGGGGGCGGGGGG
CGGCCGCCTCTCGACTCCGGCCAGATTCCATGCATCCCCCATGGATCTCCACATCGACGACGGCCGTATGACGGACGGACCGGGACCGGAGGAGTACATG
GCGGGGGCGCCGCCGTCCAGCCTCTCAGCGCTGGCTAATTTGGCGCTTTTAATTTGTTGGTTAGTTCGTTCGTTCGTTCGATCGATCTCTTCTCCGGCCG
GCCGGTCATCCTGTGTGTGCCAAAGCCGCCCTCCGCCTGCAGGCGAATGAAGGCACGGACGACGACGAGCAGCCGCAGGACGGACCCCCGTCGCCGACGT
TCAAATCATGCAAGGCCGGATCGATCGGATCTCATTTGGTCCAAACACATGCATATATATCTAGTAATTAATCTCCTGCTAGTTAGTTGTTTTGGTTTCT
CGATCTGTCTTACCTTTTGATTATATTTGTTTTTTATTATATCTTCCTTGTTCCGTCTAGATCTATCGATCTATACATACGGTTGATTTAGGGTTCAAAG
CAACGGCAAAGCTGCCTATACTGCGGGATTATTTTTTTTTACGCACACAGACAGAGAAGGTTGTGTGTGGGGATCTATCTTGATTATTTTTACGCATCTC
TCACTTAATTTTAGTGAAAAAAAAGGACTGCTGATCGACCCCTACAACATAGAGAAAGGCTTATTATTTGTCTATTTCTATTTAAATAAAATTCTATATA
CGATTTATAATATTGGTTTTGCAACCTGTATTAGATATTTAGATTAGACTGCGTGCTAGTTGTTTATAACAAACAAATTAATGAACTTGCTGTTTAGGGT
TGAGTGGCTATTTAGATTCATTCGAGCTACCATACAACTGTATGGTAGCATAAACTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATATTATGACGAT
TAGTTTGGTCTAATTATCCTCGATATATATCTTAATTTGTGGATAACCTGGGTGTCTTTGCATAGAGGTATGCATGGGTAGTCTCGACATTTCACATGCT
CAGATCTGGGAGTAGGTAGTACACAACCCAACCCCAGCCGTCAGCTCTGTTTAATCTTCTCTCCAGTCCTGCTGCTTCTGCTACAGGCCGGGAGCAAGGC
GTAATGGTTACGTGTATGTGCGGATAAGCAAAGGAGTCAAAATTTCTCAGACTGGAGGAGAATTAGGAGGAGTATCGTACGTACTACCTACGTGTTTGTG
GATTAAACATGCAGGTCTCCCCGTGCAAAAGAGTACTCCTAGTACGTCTTAGTATCTATCTGCAAAAGACTGCTGGTTGTGGTTGGTTGCAGTATTACAA
CTACTAGTACCATCATTACTTTTATTTTTTGTTGGTTAAATATTTTTCTCTGCATTTTCATTTCTCTAGTGTTTGATTGATTGATTGATTTGTTGTTGAT
TTCTCATCTTGCCTTGAAGGTTTTGTTTATTACTATGTCCATCCCACAATATCTGTCCTTCTAGGTAGTTTAGTACTCATATTAGTTGTTCTTATTTCGT
GCTGGCATGATGCAACCGTCCATCTCCAGATCCAGATGCGGTGCACCTACAGATGCAGCCTCTACTACATCATGATCCATCCGCCTACATGATACGGAGT
ATTGTTTTAAAGAAGTATAGATGTACACACATTACATACACAGACCGCATGATGATGTTCCCAGTTGATGCAGTCTACCTGAGTTTGTACAGGCAAGCTA
GCTAGATACAAACCGACGCATATATAAGGTAAATGTGTTACTTGTGTTGTCTACATCTAGTAGAACAAGGGTTGAGCACGTTGATTTGACCAGTGCAAGT
GACTTTTGTACCAATCAGTTTTGTGTATAGAATTTCATTTCTCCCTTCACAAACATAATTTCATTTCTCCCTTCATAACCATCATATTAATTATTAGTAC
CCTATTTCCTTATTTCTGCTTGCAATCTAAGGCTTTAATTAAATTCCGTTAGATGGAAATTCTTGTTTTTGCTTATTGAGGGCATTTGCATTGTGATAGC
CAGGATAGCCTTTAGAACAAAGCAAAATACATTCGAGTATGATGGATTATGTATTAATTATACTAGTATGTCAAAGGGATGAAGTGCTTTTGTTATATAT
ATATATACTTCTACTCCATATGTAACAGTGATAAGGGCTTAGTATCTTACTATTTGTTTGCTGTGATGCGATTGCAAAGCACAGTTTGTAGTTTCCGTGG
GCTGACCTAGTAAGGTAAAAAACAGTTTTCTATTGCAACGCACTAGCTCGTTCATATATAGATTACTAGTATATGAATGTGCGACTCTAACCGTCCCGTA
ACTATATAAAAATATACAACTTATATTTGGTGAACGAAAAAATTGTTGTCAATATAGTCACATCACAAGGGAAGAGTTTGGTGTCAATTAAGTAGTGAGT
TGCGTGATTGTAACTGCCCTGTGATTTATATCATTCAGCTTAGGTTTATACTATTTAGAATGTTATAGATAATGAAATTAATAGGAAGTCAAGTTAAATA
CAAACACATTTATCTTGATATATTTACTCCTTTAAACGTTTCTTCTGGTGGTGGCGGTTACTCTGTCTCACCGCCACCACACTGACATTTCGGCCCCGCA
TAACTTGTACTAAACAACATTATCATGATAACAAATTAATACTGTAACTTAATGCAAATTTACACCTCATGTTAAACTAAATTTGCATAATTTTATTTAT
TTTTGTGACATTTTCACCGTTGCATGAGTTGGTGCTTTTCCACCATCTCTGCCTCTTGCATGACCCTTATCCTTGTTTTCTGTTGGCACGCCTGCTCTAT
AGCTTGTGTACATAGTTTATACAGATATTTTAAGGGATTGGTATATTTTCTTTACATTTGAAAGGATATGCTTTATAAGTTTTAAATTTTAAATTAATCA
TATAGCTATGCATATTATGGAATCACCTTCGAAATTTAGCTCTTTTTCCGTTAACATTTTTGGGGCAAGTGTTGTAACGTATAAAATCGCTGTATCCATT
GTTAATTTACAATATTATGAACTGCCATGTGTAATTATCAGAAAGCATAGGGATGGCATTAGAAGGTTCCCCGGAAATATTTAAATTTTCAGTGAGTGCA
GAATTATTATTTGCTACAAACTGTTCCGTTCTACAATAAGAGAACAAGTTAAATTAATTTCTAAACTGAAAATACAGCACTTTCTGCACACCATCAAGCT
ACTTTATCGGACTATAGTAGTACCTTCCAAACAGCAGTGAAACCACCTTGTCTCGCTTATTTTTTGCTTGTTTATCGGTGGCAAACCTCCTGGAAGGAAA
GCATTATGTGATACTTTCAGTTTCAAACAAAAAAGATCTACGAATTGAATAGATACTTAGATAATATCTACATCTCTTATGTTTTCCCGCTTGTTATAAC
CAAAACTGTTGTGCTGATTAATTAATACTTCTTTGTCATGCACAAGTAATGCCCATACTGAACCATATTGTAGAAAAGAGCTTGTCAGTTTTCGTATCTC
ACTGAAGCATCACTACACAAAATGAACTAAGTTTTTTTGTCGAGTTGATTTTGTAAGAAAAAGATTGTGGAGCATTAGTGCTTTGAGATCCTTGATATTC
TTTACCGCAGTATCTTGTGATTAACTCATTCCAGAACAAGATAATAAATTTTCTTTAAAACTGTGATATACAAAATTGGAAGTTTGATCTGATGAAACCG
TGGTGAATAATCCATTTTGCATCAACATTAGTGTAGTACAGTATATGTTATCATAGCTATGTATGGACTCTGGTTCTTCTAGAAGATCTTAAACTGGCTC
ACAATCACAACGTCAACAATGCATGGTCTGGCTAAAACATGGATGCAATTATGCAGTTCAGCATATCAACTCTACAATTCTACAATTGAAATTTATTGGA
ATTATCCGCTTACCTTTCTCTATGAATAGAATCAAATAATAATTGTTACCAGACGCACTAATTCCTCATTATCTTACACAACAACCCTTTAGTTGAGAAT
GTGTCACTTGCAAGGCTAAGGATCTAATGCAAGCTTGTGGAGGAAGACGATTTGTTGCTGTACGAGCGCACAGAGGAAGGTGGAGCGGTGGCCGTAATGG
AGGGGAGGTGGATGGCATCGTTTCCATAGGGTTCGATGTATCACTGAAGCTTTGGTGATTGGGAGTAGGTGGAGGTAGTGAGCTGCTGTTAGCCTTGGCC
TGTCCGGCCCTCTTCCCCTCCGCGTTCAGCATCTCCCAGGTTGGCCGCTGGTGAGTAGGGGGTTTGCTTCCACCTGCATCGTTGGTTTTGCTTCTTCATA
GTTGGGTTATTCCCGTGTCTTCCTTTTGGAGCTTATCGTCTCCGTATGGAGTTCTTGAGCTTGACAGCGGGTCAACGTCAAGCTCTTTTTCTGGTGCTCT
CCTTGGTTGTGTCTTCTCTGGCTTCACCTCCGCAGATGTTGAAGGTGGCAAGGGAGCTTAGGTTTGCCTAGGCCTCACTCCTATGTTGTTTGCTGGTGTC
GTTGGAGGTGCCTGCTTGTTAGCAGGCATGGGAGACGGCACGGTGGATTTTGTAGTGCTGTGGCCAGTGAACAGGCAGGTCAAAAGCCCCCTTGTGTTGC
CGGCTGCCTAGTGGGCTATTGCCATCATTTGTGACTGAGCCAGCTTCAAAGGCCCAACCTTCTACCCAGTAGGAGTAGATCATATCCAGCTGTGTTGATT
CCTATGGTAAGCTGGATTTTGAGTACAACTTCCAGTTCATTCTATCACAACAGTGACCATGTTGAGGTCCTTTTTGGGGTTGAGCACGTTTGGGTTGAGC
ACTGACTGCCTGTACGACTTCGGTCGGCAGGAATGAAGGCAGTGTTACACAGATTTGATGCAGACCTCCATGGCAATTTTTGTTGGAGCCTGGTGAAGCA
TCCAAAAAATCTACGACCACTACTACAAAAAGTATTTTTCCATACGGTCAAAATCCATTTTTGCACGCGGTTGACCTATCGTCTGCCCGAAAGTGTCTGC
AAAAATTACCATTTCTCCGTGCGGGTGGCGCACCCAGGTGCTCATGTTGTTTGCACACAAAAATAAAAATCCAGAAAAAATAAAAATCTCGAAAAAACAG
ATATCGAAACCCTAGCTAGCTCCCATCCGCCGCCGAGGGCAGCAAGCCAGCGATGACGGGCGACGATGATGACGGCCAAGGGAGGTGAGCTGGCGATGGC
AGGCGACGTCGGCCGAGGGCGACAAGACAGTGACGACGGTGGCCAAGGGTGCTGAGCCAGCGATGGCAGCCGAGGGCAGTGAGCCGATGAGGATAGGCTA
GGCGGAAGGCATGCCCACTGGGTACCCATCGGGCATGGGTGCAGGCATATGGAGTTTTGCCCGCGAAACCTATCGGGCATGCAAAGTTGGGCATCCGAGC
ATGGTTTTGCTCTACCCGTGCCTGACCTGACCCATTGTCATCCCTACTGTTCTTAGTTTAATATAATATATATTATGAGTCTTAAACAAAAAGTACCATT
CTGAAAAAGGATAGGAAGGCCCAGTCCTACAAGAAGGCCCATATTTTCTTGTGGAATAAGTTCACCGGAGGTCCCTCAACTTAACATCGAGATTTTTTTA
GGTTCCTCAACCACAAAACCAGAAATGTTCACCCCTAAACTCATTGAAACCGTTCACCGGAGATCCCTTGGCAGTATTTTTGCCCGGTTTTGCTGACGTG
GCATCCTAGTCAGCGAAAAAAAAATTAAAAAAAATTTGTGGGGCCCACTTGTCAGCTTCACACATCTTTTTTTCTCCTTCTCTTCACTTTTCTTCTTCTC
CTCTTCACTTTTCTCTTCACCGGCGGAGCGCGCGGTAGGCGAGTGCGGCAGTGGAGCGG