CANTATAdb - search

Detailed information on CNT30575087

BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONORUT000299, E-value = 2e-155

Expression of CNT30575087

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (47 aa)
PASLRARAAAGDDIIADVIDAVRRGLAVDRSISAVRFGWIDLGRPFP*

>peptide 2 (54 aa)
MYCSCLFMCCFGVFVLFSLDSDVPRESEFAGEDFEEFQGQQEEEFYSDADGVED*

>peptide 3 (30 aa)
MLMVWRIRCSPGQAACGVESSAPFILFSAA*

>peptide 4 (61 aa)
RRACAPEPPPEMTSSPTSSMPSAVVWPWTDRSRPFVLVGSISAVRSREPSPCARSTANPSR*

Sequence

>CNT30575087
CCGGCGAGCTTGCGCGCCCGAGCCGCCGCCGGAGATGACATCATCGCCGACGTCATCGATGCCGTCCGCCGTGGTCTGGCCGTGGACCGATCGATCTCGG
CCGTTCGTTTTGGTTGGATCGATCTCGGCCGTCCGTTCCCGTGAACCGTCGCCGTGCGCCCGATCCACCGCAAACCCTAGCCGCTGACGCAATAATTCCC
TTTTCCTTTTCAAAAATAATTCATTATTGCGTCATAATTCAATTAAAATCCATATAAGTGTTTTAATCCGATTTAATCTTTAAAAATTCATAACTAATTC
ATCTTAGCTCGGATTTAGTTGGTTCAAGTCTCTAAATTTTTCTAAAATTGAGATCTACATGTTAAAAATATCCACATGTACTGTTCATGCTTGTTTATGT
GCTGTTTTGGTGTTTTTGTTCTTTTCTCTTTAGATTCCGACGTTCCCAGAGAGTCTGAGTTCGCAGGAGAAGATTTTGAAGAGTTCCAAGGCCAGCAAGA
GGAGGAGTTCTACAGTGATGCTGATGGTGTGGAGGATTAGGTGTAGCCCTGGTCAAGCTGCCTGTGGAGTGGAATCGTCTGCGCCGTTTATCTTATTTTC
CGCTGCTTAGATCTTTATTGATTGAGAGGAACTATCTACCTCTGTAATGACATTTTATTCGCTTATTAATTAGAGTAATAATTGTACTCTATTATCAATT
TGTTATTGTGTGCCTCGGCTGATTCCTGGACGAGGGTTCGCGCACATGTAAGCGTTTGGAATTTTGGATAGAAATTCCGGGCGTGACATGCCTCCTC