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Detailed information on CNT30574887


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONORUT002231, E-value = 0.0

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30597213Oryza barthiiOryza meridionalis71.2191.6794.71133reverse complement
CNT3099672Oryza barthiiOryza rufipogon94.9771.5895.91511forward

Expression of CNT30574887

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (38 aa)
MVDEICWTWTGDRAMRGGWFPLMQVAPSRSLRTEHFDI*

>peptide 2 (40 aa)
MLDVLVTYVRIKCGLLWMGLCLMVVLACCAMLVWTLVVHG*

>peptide 3 (50 aa)
MWIIMDGIMFDGGVGMLCHVGMDFGSPWLMMRAPFGLICLYISELYTCCP*

Sequence

>CNT30574887
TAGATTCGGAGAATTCGGAGTACGTGGAGCAAGACTCTGAGGTTGAGTGTGTTTCCACACAGCAGCAAGGCAAGCACCTAAGCATATAGAACCTATGCTT
TCTCTAAAAATGATTTGGTTCCAATCTATACGTATATATATATATATGCATGCATTGCCTAGATATTAATATTGTCGGTTTATGGTGTATGGGTAGAACC
TATTAATGCATTTAGTTCTTGTGATATTGTTGTCCTTATACCCTATTACCACTGGTTGGGATTACTTGGGATGTCTTATTCATTAATGCTTAGCCATGCT
TAGTGCTAATAGAACTATAGGGATGGACAGTGCTATTAATAGTGGTATATAGACAACTTGCATTATTGGGCATAAAACTTGAGCACTTACACTAAATAAT
GGTTGATGAAATATGTTGGACTTGGACGGGTGATAGGGCGATGAGGGGAGGTTGGTTTCCCCTGATGCAAGTAGCCCCATCTAGGTCGTTAAGGACCGAA
CATTTTGACATCTAATCAAGCACCCTATGTACTTACCACATGCCTTATTTGGGACCGGCTTGTTCTTACTAGTTCTACTGTGATCATTTATACTACGTTG
GAGAGTCGTGAGGCAGGTAGCCTTTGGAGGTTCTCGGGTGCCTAGGTTTGGCCGGGGGTGCCTCCCACGTGGCGCGCCCGCCTTGGTCACATCACGCACG
CACGTGACTGAGTCGTCGGGAACCCCAGCGTGGTATAGGTGGTTGGGGTGGGGCTAAGAAAGGGCATGTAATGAGCTTGAATCACTTATGTACCGCACTC
GACGGGGTGTGTAGCATTTGATATTTGTTCATTTCGTGTGGGTCTAGTTGTACACCTTTGATCAGAGTATAATCTATTCGAATAGCCGCGTCCTCGGTTA
TGGACAATGCTTGATGTGTTAGTCACTTATGTTAGAATCAAATGTGGATTATTATGGATGGGATTATGTTTGATGGTGGTGTTGGCATGTTGTGCCATGT
TGGTATGGACTTTGGTAGTCCATGGTTGATGATGAGAGCGCCGTTTGGGCTCATTTGCTTATACATTTCAGAATTATATACTTGCTGTCCATAAATTAAA
ATGATGCTAGAGTTACTTGTCCTTGCTTATTTTACTCATTAATTGCTCAATAAAATTAGCTTTATGCAAATGTTGAACCTAGAGACCCACTATAGGCTAG
AAAGCTTGCATACTTCTCTCTCCCTTATGTATATATAATTTTGGGTAAGACTTGCGAGTACAATCTTGTACTTAACCCGGTGTCTGCAATTTCAGGAGAG
GATTCCGGTTATNAGTTATGCTTCTTGTGTGGTCATTGCTCTGCNGAGGGTGGCGAGGGCAATGAGTGATCTCTTGCAGCTTGGCTCTTGCCCGGTTGGT
TTGCCCTAGTGGGGTTGTGGCACCACCGGTTTTATCTTTTGCCTATGAACTCTAATTGAGACTTCCGCTGCTATATTTATGTGTTGTATGTTGGGATCTC
GGACCCTATTATGTGTCATGTACCTCGCTGCACTTTAACCCTATTATGGTACTTGCTATGTTTATTAATTGCTTGCGATGAAAGTGTGAGG