Detailed information on CNT30574810


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONORUT004434, E-value = 2e-120

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30369461Oryza barthiiOryza glumipatula49.2345.599.021021forward
CNT3099946Oryza barthiiOryza rufipogon47.2529.9599.39980forward

Expression of CNT30574810

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (49 aa)
MIGFPLFMHQEFVLDDQIAEFLCPRSIYFLMRELYGLLGVKINSVSILD*

>peptide 2 (29 aa)
MPFMYGFSLCWSQAARSCGPCYRLNQLIF*

>peptide 3 (30 aa)
RTPSRRLALASPPGPRPGDRAAVDVRRLPP*

>peptide 4 (39 aa)
MHLILLQSLKFLLKNQLQIMYCSFLRSVGPLPNISKYVI*

>peptide 5 (40 aa)
MPLPSNPISFKRQVAAAATRFSTGHVKALHEMRGRLNDGG*

>peptide 6 (43 aa)
MSGTANLQNNQDIFHSHMDHKYASDPFAIPEISLKESIANHVL*

>peptide 7 (44 aa)
MIQSNLWPLTWFSAICHDLLLGFMCLTCSPQIEGKNACPPTRSG*

Sequence

>CNT30574810
TCGGACCCCATCGCGCCGCCTCGCCCTTGCGTCGCCACCCGGACCGCGGCCAGGAGATAGAGCAGCGGTAGACGTGCGGCGTCTTCCTCCTTAATCCGTC
ACCTCGGTTTCTTAGTTCCTCCCACCATGCCCCTCCCTTCCAACCCTATCTCCTTTAAGCGCCAAGTCGCCGCAGCAGCAACGAGGTTCTCAACGGGGCA
TGTTAAGGCTCTGCATGAGATGAGAGGTCGACTCAACGATGGAGGCTGAAAATAAAGCTTGATGTTAAGAACATGCCATTTATGTATGGGTTTAGTTTGT
GTTGGAGCCAAGCTGCCAGATCGTGTGGTCCCTGTTACAGGTTGAATCAACTAATTTTCTGACAGTAGATGTGCTGACGTTCATATACTGCAGTTGAATT
TAACTTCCAAATATTACTGCCAGCATCCGGCCTCCTCAACATCAGATCAGTGTTTCAGGTGTGTGTGTGTCTCATTTAAATTAGTCATCTTTTCCGGTTC
GAAATTTTCGCTTTGCAATTGGTATATATGTTTACATCACACCCTGAAATTTCTCTAATTCAGAAGAACATGTAACCATAGTAAGTATAAAATTTGCAAG
ATATAGATCTTGATGGCCTGGTGCTGCTAGGTGTATGCATTAATTCTGTTGTGCTGGATGTAGTTTGCTTGCCTTTAGGATTATATGATTAGTTAGATGT
ATTTTGTTGGCCTACTGGATGTATGCATTCAGCTCCTGACTCATTCTTGATTTATTTGTGCATGCCGGATCCATGGAAGAATCGGCCACTAAAGTCTAAA
CTCTGAAATAAGGTTTTTGGTATATAGTGGCCTATATATTCTGCACGTCATAGATCTTTCATGTCACAGTATTTATGTAAAGGTTGATTAGTACACAAGT
ACACATACCTTTTTTGTTATCTTGTAGCATACAAAGTTTACACTTAATCACTACACAAAAGCACTTAAGTATAACTTTGCATTATCTTGCAAGTCACCAC
ACTAAACCACTAAACCATCCTATCAAGAGAGAGAGAGAGATAGATAGATAGAGGTGGCGAGGTGCGGCACCGCTTGGATAGATGGAAGCTGTTTCTTTTC
CTCCGCTAATCACACTTGGATACTCTGGTTTATGGCAATAATGAGCAACAGGGCAGCCACGACATCTGTAGGAGCATAAGAATAAAAAGCCCAGTTAATC
ATTGACGTTTGTATTCAACTTATCGATGTCTGGTACTGCTAATCTCCAAAACAATCAAGATATTTTCCATAGCCATATGGATCATAAATATGCATCTGAT
CCTTTTGCAATCCCTGAAATTTCTCTTAAAGAATCAATTGCAAATCATGTATTGTAGTTTTCTGAGGTCCGTTGGTCCATTGCCAAATATTAGCAAATAC
GTTATTTAGTCAGAGTTATGGTATCCTTGAAGGTTCGATGATTGGATTTCCTTTATTCATGCATCAGGAATTTGTGTTGGATGATCAAATTGCAGAATTT
TTATGCCCTAGATCTATATACTTTTTAATGAGAGAGTTGTATGGTCTATTAGGAGTGAAGATCAATTCAGTTTCTATCCTAGATTGAGCAGAGTTAACAT
GGTCCATTTTTTTATCATAAATTCATGTTTTCCTGTCTAATAATTTTTTTGCTACCAACTGCATATTCAAATCAACTGTAATTTGATTGCACCATGAACT
GCATAGCATTAGCATGATCCAATCTAATCTATGGCCTCTAACATGGTTTAGTGCAATCTGTCATGACCTTCTGCTTGGTTTCATGTGCTTGACATGTTCT
CCTCAGATTGAAGGAAAAAACGCATGTCCTCCCACTAGGAGTGGTTAGTGGTTCATTCTTGAGCATACCAGAAGAAACACGTGCGGTACCACGTGATTAT
CACTGGCTTAACTCTTTATGTAATTTTTTGCTTGAACCTTAATCCCACCCCTTCTATGGGGAAATGTAATGCCTTTAAAATATCAAATGTCACTATGACG
TTATATCTTTTTTAATTTGAGTTATCAAGTGTCACCCCGTAGCGTTAGCACGGGCATATTACTAGTGTTTTTAA