Detailed information on CNT30568703


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|P50156|TIP11_ORYSJ, E-value = 2e-39

BLAST vs NONCODE: nothing found

Expression of CNT30568703

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (96 aa)
MIISLTMPLVANRRSRHATVAPSNCAIQYKMPRRSEMWPPMNAPNVTAGLTWPPEMLAATETATKRAKACATAATTRPVGVAAPPEVSLSKAMAEP*

>peptide 2 (63 aa)
MNLLEVSTIRIGPDWYEFKDRTKNLRFKEIQSVCRPKIYGLVLKKLKNSRFESRLIHGLLISW*

>peptide 3 (36 aa)
MRVEMNSASAALSASGCVASANVPTAMRWIGIVGCP*

>peptide 4 (35 aa)
TRQNVCTHDEADCDRGYNSQTALFGIQRGCVYRVN*

>peptide 5 (34 aa)
PPAKMFAPTMKPIAIGAIIPKLPFLGSSAVAYTV*

>peptide 6 (30 aa)
MDCFDSVRFRGSRVFIDSPRIYYNKSQNKL*

Sequence

>CNT30568703
CCACCCGCCAAAATGTTTGCACCCACGATGAAGCCGATTGCGATCGGGGCTATAATTCCCAAACTGCCCTTTTTGGGATCCAGCGCGGTTGCGTATACCG
TGTAAACTAGACCGAAGGTCATCACGATCTCGAACACGAAGGCGTTCCATACGCCTACGCCGGCTGACAATGAAAATGCTGCTGTTGCCTATCAAAATAA
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TCGGTTAATTCACGGTTCGTTTATGAAAATCCATGGACTAGACCGCGAATTACGGTTTTCTAATTTTTCAATCCGTGTCCGGACCATTAATCCACGGACC
CAATAAAAAACCTATGGATTGCTTCGATTCGGTTCGGTTTCGCGGTTCGCGAGTTTTTATTGACAGCCCTAGAATTTACTATAATAAATCACAAAATAAA
TTATGATGCATTTGAGATCTCTATGGTAAGATTTAAAAAAAAAAAAAATCATTTCAAGTAAAATTATTGGGTTTTTTCTCATTTTTCTCAATTTTTTTTT
AAAATGACTAAAATAGACATGGGCTTTAATGCAACTGCCAGAGTAACTGAAATAACTAACTCTATGGGTGTAGAGTGAGACATGATAATCTCACTCACCA
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GATGAACGCGCCGAACGTTACTGCGGGGTTGACGTGGCCGCCGGAGATGTTGGCGGCGACGGAGACCGCCACAAAGAGGGCGAAGGCGTGTGCCACCGCG
GCGACGACGAGGCCGGTTGGCGTGGCGGCGCCCCCGGAGGTGAGCTTGTCGAAGGCCATGGCGGAGCCCTGACCGGCGAAGACGAAGATGAGGGTGGAGA
TGAACTCGGCCAGCGCCGCTTTGAGCGCGTCCGGGTGCGTGGCCTCGGCGAACGTGCCCACTGCGATGCGTTGGATCGGCATAGTCGGTTGTCCGTGAGA
AATTTAGAGAGAGAAAAGGTTTGTTTCACCACTACTGCACACTCTTTTTGTTTGTGT