Detailed information on CNT30564273


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
nothing found

Expression of CNT30564273

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (29 aa)
LSLSLSLFISAKKVRSDPVYVLRSFTLAS*

>peptide 2 (31 aa)
MSIGCKSILSSELRLGENEGSFGKKTCRIMR*

>peptide 3 (31 aa)
MRIRTLKIGNLCGKIVVGTCLIVTEPWFGCF*

>peptide 4 (35 aa)
MEISVPQSLSKSWFICYFSSFLFLGFNGGHAHVSL*

>peptide 5 (37 aa)
MIADCIIFLGRKEICLHVTLLVIFQQKISRILLYLTV*

>peptide 6 (57 aa)
MFIHLTAMFQSLQLQLHIWKSLCLNHYPSLGSFVIFLLFFFWVSMGDMPMFHSKSFN*

>peptide 7 (50 aa)
MRFGNILYKLIFWFFLLPHGQSNIASPHQNCFHLLTLNYNWLLPFTISAR*

>peptide 8 (47 aa)
MELRSHCSNSTPLIHELKLGELRRLLRLQRSFECLSVASLYCPVSYG*

>peptide 9 (45 aa)
MCDRFLYSFFLLWYIDRPYSITFLLLCLSVIFLICPFFTTNYMEL*

>peptide 10 (64 aa)
MVKISLIFMFFSFDPEILLPHLWIKSRWIREKEEKKMELITKKISASKQLFSCIFEALLIKLIS*

>peptide 11 (42 aa)
MINQLPSSMFKLFYFILFDHEFLISWGDFSLEFFYLFSCVVW*

>peptide 12 (42 aa)
MRIRNSNFVFGISFLLEKTCIEREKIVIYLWGQGLQRSFQTL*

>peptide 13 (96 aa)
MMKVIFLFLIFIDCFFFCFFGERSAEIHLKLSQIFGICIPKMAILEKIILGERYDNLFLQISLCAITAVIIQCYMTHREKPRSLIWKPSLTKTTLT*

>peptide 14 (64 aa)
MYSTTIKKYKKEIYKYGYTFTRAYPNCCITWLQLNKRELALPIFVTKVDLCNLCALLGFFSLEI*

>peptide 15 (61 aa)
MCHFCNSRSQAKCVCQEGPKSADVDDPPLKWKLSDTIYRPCRSVIILLEREREREGDDDSA*

Sequence

>CNT30564273
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATTTATTTCGGCCAAAAAAGTTAGATCTGATCCAGTTTATGTGCTTCGATCCTTTACTCTAGCTAGCTAGTACTAGTA
CTAGTATTTTTCTGGTAGGTTGGGAAGTTATCAATATATCTATAAATTGTTTATTGTTCTTTTCAGGTAGTACTATGTTTTGTGAATCTAACTATGTCCT
TTATGAACTTCGTTTCGTTTCATCTCTTCCGATTTAGCTCATCTTCCCAAGAAATCTGACATGGGTACATGATAAATCAACTGCCTTCTTCAATGTTCAA
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GTCTCGCGTTTGAATGCGTATTAGAAACTCAAACTTTGTTTTTGGCATTTCATTCCTCTTAGAGAAAACTTGTATTGAGAGAGAAAAAATTGTTATATAT
CTTTGGGGCCAGGGTTTGCAGAGATCCTTTCAAACTCTGTAGGTGCAAAGATCTTTGTCTCGTGAGTTGCAGTGCGGTGGGAACTAAGTTTTTCCTGGAA
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GATCCTTTGAATGTCTATCGGTTGCAAGTCTATATTGTCCAGTGAGTTACGGCTAGGTGAGAATGAAGGTTCATTTGGAAAAAAAACATGTAGAATTATG
CGGTGACTGCTCCCATTGCACACAGGTGGATTCGTAAATGGAAGCTTGGTGAGAAACGAAGAGCGTAATTGCTGGTTTCGTCAAGCTAATGGAAAAGCAG
ATTGACAAAGTACAAGGACGATCGTTGTGATAATTGGTAGGATTTCATGTTTATTCCAGTTCGCTTCTCTTTATAAAATAAAGGATTTTATCTCTAAACG
AACTCACCGCGTGTATATGGAAAG