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Detailed information on CNT30563764


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT3022534Actinidia chinensisPopulus trichocarpa4.0421.3686.9669reverse complement

Expression of CNT30563764

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (54 aa)
MTEVNPGRSLWSSKTPDKPANSPRRAQNYRVALSVKEVREADAKLQVLGEGPQT*

>peptide 2 (38 aa)
ITTIYLHSLSVEAISITQATSLSFSNAALEENPHRPNP*

>peptide 3 (56 aa)
MRSSRYWVKARRLSSTRLVQLESRSDLDRVMLRLGSRRRRLMGRLSFRRRGSPIAI*

>peptide 4 (30 aa)
MNPISIHKDVIMLALFWLIVGLCQNPCFYL*

>peptide 5 (36 aa)
MECYLLRLKVRERERRGQSYTEIRTILTGTTAASVD*

>peptide 6 (29 aa)
HHNHLSALSLCRSYLYHSGHISLFFKRSP*

Sequence

>CNT30563764
ACATCACAACCATTTATCTGCACTCTCTCTCTGTAGAAGCTATCTCTATCACTCAGGCCACATCTCTCTCTTTTTCAAACGCAGCCCTTGAAGAAAACCC
TCACCGCCCAAACCCTTAAGCCAAGCCAACTCCGTCGCCCAACTCCAACGCCTAAACCCTCACCGCCGCCGACGCTCACCTCCTCGCCCGCAAGTCCATC
CGAATCAGTGCCGATCTCAGTTTTGTGGATGAGATGACCGAAGTTAATCCGGGTCGGAGCCTGTGGAGCTCCAAGACACCAGACAAGCCAGCAAACTCGC
CGCGCCGGGCTCAGAACTACCGTGTTGCGCTATCGGTGAAGGAAGTGAGAGAGGCGGATGCGAAGCTCCAGGTATTGGGTGAAGGCCCGCAGACTTAGCT
CAACCCGGTTGGTTCAGCTGGAGAGCAGATCGGATTTGGATCGGGTGATGCTCCGATTGGGAAGCCGAAGAAGAAGGTTGATGGGTCGATTAAGCTTCCG
GAGAAGAGGTTCTCCCATAGCCATTTAGCACAATTGAAGTTTATCTTACCTGAAGTGATTCGAGCTTCATGGGCGCTGGTGGAAGTACTTCGCGGAGAGT
GGAGGATCGAAGTGATTGAAGAAGGGATTGATCCGTGCGGTTAGCTTGCAAAGGTCTCAGGCACCTGTCGAGTCCTATACATAGCTAATTTGCAAGCTAC
TGTTCCTCCATACCAAAGTCAGTCTTTGTATTCGACGGAGGCACGCCTGCTGTCCAATGTAGGACCGTCATTGCACGCAAGAATGCCCAGGTCAAGATTC
GCAAAATTGTTGAAAAATTGCTCCTCAACCACGTGAGTTTCTTCAACTATGGAGTGTTATTTATTGAGACTGAAAGTGAGAGAGAGAGAGAGAAGAGGAC
AGTCCTATACTGAAATTAGAACCATTTTGACTGGCACTACTGCGGCAAGTGTGGACTAACCTATGTTTGTCAGAAGGCCGGTGGTGATTAATCGTTTTAA
TCTATTTTTAGTTTATGGTTATTTGCATTTCAATATTTGAGATTATGGATTGTTTTAATTTGAGATATCTGTGGTTGAATTTTGATTGGTTTGGTTGCTA
GACAAGGGATGAATTTAAGCATATTTTTAGTTTATGATTATTTGCATTTCAGTATTTGAGATTATGGATTGTCTTTAAAAAAAGATATCTGTGGTTGAAT
TTTGATTGGTTTGTTTGCTAGACAAGGGATGAATTTTGCTTAAATGAACCCAATTTCGATCCATAAGGATGTGATTATGTTAGCCCTGTTTTGGTTAATT
GTTGGCTTATGCCAAAACCCATGTTTTTATCTTTGATGATATGATTGTCTGGCATTTTTTGGTCAATCTTTGGCTTTGACCAAAAAATGAATGATATGCT
TTTCGACTTGGGAGCTATTTATGGGTCATTATCTTCCATATGCATTATCTTGAAGCTGTAGTTGTCCACCTATGATTGGGAGATAATTGGGAATGTTTCA
AGACGGGGGCACCTGTTGTGTTTGCTCAATTCGATTGTAAATTTGGATTAGGAAGAAATGAATCAATTTCCTTTTTCACTATGCTCCTTTTGTTGTTAGT
CTAAACTATAGAGCAACTTGAAGTCTAAATTTTGATTTTTACGAGATATATCCGTTTGGAGGTTGTGTTTAATAAATATGTAATTATATTTGGTGAGATT
GAGAGTAGC