Detailed information on CNT30560459


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q33C46|RPOB_NICTO, E-value = 8e-08

BLAST vs NONCODE: nothing found

Expression of CNT30560459

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (64 aa)
MHKYPSLLRNSSSLLPHLSFSLSLSLSGFRPKKLDLIKFMCFDPCFPRNLSSIFQKMDAYGLND*

>peptide 2 (64 aa)
MDLKSRKSTQTTLYANRTQIFGYKKKEKTLRNHKRERERERENNSFPNQNDSSYANFKSKKIAI*

>peptide 3 (45 aa)
MSVDHFDFSLNFADPPSIRLSLSTLHSVGPSKLPSTVCNRSRDRL*

>peptide 4 (36 aa)
MRLELGTLKRTQQSATITCSFLQTIHMKLLTQKRLK*

>peptide 5 (69 aa)
MFIHLTAMIQSLQLHIWKSVCLHHYPSLGSFVIFLFLFIFGFQWGTCPCFHSKSCTDTNFQISYFVNCN*

>peptide 6 (68 aa)
MTNFSIFDLLHFRLKNLFIPCISLVTIRYTQHCDDINFEKNINFEKCCMSLDFYHHIISLNARDWLYI*

>peptide 7 (62 aa)
MVWLLLTFLIHHPSSCRWTNSDGHLATWSPLNLPLAHPNIHISNNIIRKVYKNIFIFACLYI*

>peptide 8 (54 aa)
MEEIFIFYFKSLFCLLGERSKMRRDPLKLSQIFGICIPNMSNMGEENLRWKVGS*

>peptide 9 (50 aa)
MYLIAHRKIYILPTGVFVCVRIITLKIGNLCGKIIVGTCPIVTEPWFGCF*

>peptide 10 (49 aa)
MDTTKQRKTYSTLPICVIFWSFFLSSHTHGSYLLGLFCHLEDLTLFFEF*

>peptide 11 (88 aa)
MDILQLGPLSISLLHIQISTSPIILSERFTKISSFLHVYTFDSYDSVTSTTYMEICVPPSLSKSWFICYFPFSFYFRVSMGNMPMFSL*

>peptide 12 (70 aa)
MIAPMQTLKVKRSLYRKPRPHKNNLEADSQNKARIRTRERFVLVQSKIGSSKKSLEFQNNGRVQIHILTN*

>peptide 13 (30 aa)
MCHFCISTSQAKVYVTGPMKDLLNADVDDF*

>peptide 14 (31 aa)
MHLNKYTNHLTLLFLDPSHIKNASPSTRKKF*

>peptide 15 (32 aa)
MRYFVGDLTTFYKSQVATRNYYELQYGFRVLE*

Sequence

>CNT30560459
TTGGACTCACCGGTGTTGTCCAAAATTGAACTACAGAGAAGCCTGGTCCTAATTTAAAATTTCAAGGGTGGCTAGTGTAATTTTCCCAAAAAATTGCTAA
TAAAAATTAGGGTTTGGAAATTAAGATGGGCTGCGTTTTTAAACTGCAGTACCAGACAGGATACAGCTAAGCATCAGCCAATAAAAAGTAAAGACTGGTG
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CTACTATCTAGGGAATTAATTTATCAATTAAAATATCGCCCATCTTTAACTAAAATCACGGCATCACAAACCCATTTTAGCTCTAAATTGCTTAATAGCT
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GAGATCATTCGAATTTCGATCTGTCTGTTGCAAGTCTATATTATCTAGTGAGTTACGGCTAGGTGATCAGAATTAAGGTTCATTCGGAAAAAGCATGTAG
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CTGATTTGTCGGACTCAAATTCTACCTGTGATCGGATATCGCTTTCTACACCAATGCTTGGATGGTGGAACACAAAAAAAATTCCCATAAAGAC