Detailed information on CNT30555299


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONORUT004494, E-value = 9e-154

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30693031Oryza glaberrimaOryza sativa11.3710093.33345forward
CNT30578306Oryza glaberrimaOryza barthii36.7469.5697.851115forward
CNT30116283Oryza glaberrimaOryza nivara8.8358.992.91268forward

Expression of CNT30555299

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (51 aa)
MNIVKDLSQLYIASWFNFIMSYRVNVLGYFFELQVSMSQQMQRQWNIFIWC*

>peptide 2 (39 aa)
MFSQCLLLLQTCKGKNISVQKKNDRERHGGRGFIFTNSK*

>peptide 3 (56 aa)
MIYFNKITLTLMIDLGDGCIWSIYIDVTCTCTLTSIYYTPPLNTSMYLANVPSVVK*

>peptide 4 (36 aa)
MGQRRGTYRCQRSLIKQSGFFLLANDLPSQYLFLLQ*

>peptide 5 (86 aa)
MQYPSLLLLYFCVRSYCSRYNVKIFILSAHLENNLHTLTCLVSVCCCFRHAKGKISVYKRKMTEKGMGVGGLFLQIQNKFDQTRNL*

>peptide 6 (69 aa)
TPPPPTGAACFPARVATKRKESWGLLTPPLPPPRLPLKVQIHSCTTPPPPLSPSTHLHRRLPHHCQRPR*

>peptide 7 (99 aa)
DAAASHRSRLLPCSRRDEEEGELGSAHTATATASPPSKGTNPLLHHPSTSSLSLYPPPPPPSTSLPEAKVTALQESDAAALCGWQARGRAPRSKQPSPR*

>peptide 8 (63 aa)
MFWGICRSKLEKFELWSLIASEPLQPLLRVCLQEQVPNTPLSFCKSKFPTLPSRFSCAHFSNC*

>peptide 9 (52 aa)
MDRKGKDGPSLPKVRTGRCARSDLLESANCSGETLFGMQRLEGALCLFLMDL*

>peptide 10 (36 aa)
MRSIERRKMVVDHGAASRNIQVSTIFNQTKWIFLAS*

>peptide 11 (36 aa)
RRRLPPEPPASLLASRRRGRRAGVCSHRHCHRLASL*

>peptide 12 (30 aa)
MGLICPRAELLDRAVHPGKYDTLFADIFTL*

>peptide 13 (30 aa)
MYLLEFNLAFSGSPPAIIYADLLRTKHWIS*

Sequence

>CNT30555299
GACGCCGCCGCCTCCCACCGGAGCCGCCTGCTTCCCTGCTCGCGTCGCGACGAAGAGGAAGGAGAGCTGGGGTCTGCTCACACCGCCACTGCCACCGCCT
CGCCTCCCTCTAAAGGTACAAATCCACTCCTGCACCACCCCTCCACCTCCTCTCTCTCCCTCTACCCACCTCCACCGCCGCCTTCCACATCATTGCCAGA
GGCCAAGGTGACGGCGTTGCAGGAGAGCGATGCGGCTGCACTGTGTGGGTGGCAAGCACGTGGCCGGGCGCCGAGGAGCAAGCAGCCGTCGCCCAGGTAG
CTAGCAGGCAGGACCACAGCACTGCAGCAGTTTCTCGCTGAGCTTGGGATCCTGTTTTGTCTTGTCATAAGCTGATTTGTGATTTGCGATTTGTGATCCC
TGATTTTGTGGATCTGGGAATTGAGAATATGGATAGAAAAGGGAAGGATGGTCCATCCCTGCCAAAGGTGAGGACTGGGCGCTGTGCACGGAGCGACCTT
TTGGAAAGTGCTAATTGCAGTGGGGAGACACTCTTCGGGATGCAGCGGCTGGAGGGGGCATTGTGTTTATTCCTGATGGATTTATAAGATTGTTATTCCA
TTAGTCAATATTGATCTGCATCCTTCTAAGTTATTATATGATGAGAATAGAGTTGAAATGTATTTGAGTTCTTATTTCAGTGCTTTTTATATTAGTATAG
ATAAGATCGTTGTTTTCTACGCAGCATTCCAACTTAAGCAGTAAGTACTTTGGTTGTGTCAGGTTGACTTGGCCAGAAGGGAATAGTCATATTTTGTAAG
AGTGTGATACAAATGTCATTATAGATTGTAGTAACTTTGTGCCTAACAAAATATGCCTAACTTCTGTTTGATGAAATAACTAACTGTGTTTGGCAAGCTT
ATAACCTATGTTTGTGTATGGGTTTAATTTGTCCTAGAGCAGAGCTGCTGGATCGTGCAGTTCACCCTGGTAAATATGATACTTTATTTGCAGATATATT
TACTCTATGAATATTGTTAAAGATTTATCTCAATTATATATAGCAAGCTGGTTCAATTTTATCATGAGTTACAGGGTTAACGTGTTGGGATATTTCTTCG
AACTACAGGTCAGCATGTCTCAGCAGATGCAAAGACAGTGGAACATATTTATTTGGTGCTAATTTTTGTTTGCATCCATGGAGTTAGGTTTATATCTATT
TTCGCATTGCATTTACATGGAATTAGAATGAGGAGTATTGAAAGAAGAAAGATGGTGGTGGATCATGGGGCAGCGTCGAGGAACATACAGGTGTCAACGA
TCTTTAATCAAACAAAGTGGATTTTTCTTGCTAGCTAATGATCTGCCCAGCCAATATCTGTTCTTACTCCAATAAAATGATGCGTTGTAGGAATGTTCTG
GGGCATATGTAGGTCTAAACTTGAAAAGTTTGAACTTTGGTCACTCATTGCTTCTGAACCACTGCAACCTCTACTTAGGGTGTGTTTGCAAGAGCAAGTT
CCCAACACTCCCCTCTCGTTTTGCAAGAGCAAGTTCCCAACACTCCCCTCTCGTTTTTCGTGCGCACACTTTTCAAACTGCTAAACGGTGCGTTTTTTTG
AAAAAAAATTATATATAAAATTTGTTTAAAAAATTCATATTGGTCTATTTTTTTAAAAAAAATTAGCTAATACTAAATTAATCACGTACTAATGGACCGC
TCCGTTTTCCATGCATGGGAGATGGGTTCCCAACACCCACCTCCAAACACAGCCTTAGTGACTTAATCTTCTATATTTGGTTGTAAATTGCTCTTCAATG
TTCTAACATTGGTCGATGACCGAGTTAAAATGCTTTTACAGCTGTACATGTGTATGTGCATTTCAGTTTTAAATCTTTAGAGCCTTTAATGCAGTATCCA
TCCTTGCTTTTGCTTTATTTTTGTGTGAGATCATACTGTAGTAGATATAATGTCAAAATTTTTATTTTGTCGGCTCATCTTGAAAATAACTTACACACGT
TGACATGTTTAGTCAGTGTTTGTTGCTGCTTCAGACATGCAAAGGGAAAAATATCAGTGTACAAAAGAAAAATGACAGAGAAAGGCATGGGGGTAGGGGG
TTTATTTTTACAAATTCAAAATAAATTTGATCAAACAAGAAATCTATAAGTACATACAGAATTGATATTGTAAGCTTGCCAACATGTGAAAAGATAACCA
ATGAGAATTGATATGGGACTTACTATCAACACCTTCAGGAATGATTTATTTCAATAAAATTACATTAACCCTCATGATTGATTTAGGCGATGGATGTATA
TGGTCAATATATATCGACGTGACTTGCACGTGCACGCTCACTAGTATATATTATACTCCACCACTCAATACCTCTATGTACCTCGCAAATGTACCCAGTG
TGGTGAAGTAATGTACCTGCTTGAATTTAATCTGGCTTTCAGCGGCTCACCACCGGCCATCATATACGCCGATCTGCTCCGAACGAAGCATTGGATCTCA
TGAGTAAACACATAACTCAGGCGATGCAGCGATCCAGTGGCCTGATGATTGTGAACACCATGTGTCGAATATACTAGTCCTATTTAGTTATTGTTGGACT
TGAAGTTGTAATAGGTGTTAGGGGGTGGAGTTAGAGTCGGACTCTGTAACCCGTCATCTCTCTTAAATAGAGAGGGGGGCACCATAATGTAACCATGGCG
ACTACAATGTAGCGTAGACACGCAGGGAGACGATGGCGGCGTGGTCATGGACTCGTAGCGGCTAGGTGCTATGTTGGTTGGGGAGGAGCGCCCATAATCA
GAGCCCTGGGGATGTAGGCTTCGGCTGAATCTCATTAACAAATATCGTGTGTTCCTGTATCGTCATCTGGCATGTCTTGGATGATCAACGACTGAAGCGA
TCGGGAAGGTTAGTCATCGTTCCGCTATATCGACTAATTTTTATAACAATGGGAGTAGTACTGTCGGCATAGGCGCCTACGACCCACACCACCGCTACCA
TGCCTTGGTCCGCTTCCTCTTCCTGGGAGCTGCCA