Detailed information on CNT30555174


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30690859Oryza glaberrimaOryza sativa36.8969.9495.151196forward
CNT30596990Oryza glaberrimaOryza meridionalis27.9572.8999.34906forward
CNT30107726Oryza glaberrimaOryza longistaminata35.6653.2295.161156forward

Expression of CNT30555174

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (31 aa)
MPCFIYFFLIYLLDNLTFNCILILVVIFPGY*

>peptide 2 (29 aa)
MQCMSSVDAVQPCIRTIYMRCILCKILNI*

>peptide 3 (71 aa)
STPIYSPHDKGEQKSSHSSSSLFFSFSPSLPHAFPQRRRSHRRSSSRRPLLPASGSCPAAAAGLYRSRDSS*

>peptide 4 (37 aa)
MQGEIRLIDDLTTLWFLFRYTLLLPDNFINHDCIYLD*

>peptide 5 (35 aa)
MVLFISNEGRCIPISSNHTRACTDQSRCHVLFIFS*

>peptide 6 (47 aa)
MVLLLNHEWSCLYLMKADAYLYLLIILEHAQIKVDAMFYLFFLDLSA*

>peptide 7 (83 aa)
VLLYTAHMTKANRKAHILPLLSFSRSPLLSLTLFPSAAAHTAAPPHAGRCSLPPAAAPQPLPACIGPVTPHESTPKLTPASST*

>peptide 8 (44 aa)
MLALTPHSCMFSWRKCKIVDFTTYKKFLVNLRYFIPFHLSPSGL*

Sequence

>CNT30555174
AGTACTCCTATATACAGCCCACATGACAAAGGCGAACAGAAAAGCTCACATTCTTCCTCTTCTCTCTTTTTCTCGTTCTCCCCTTCTCTCCCTCACGCTT
TTCCCCAGCGCCGCCGCTCACACCGCCGCTCCTCCTCACGCCGGCCGCTGCTCCCTGCCTCCGGCAGCTGCCCCGCAGCCGCTGCCGGCCTGTATCGGTC
CCGTGACTCCTCATGAATCTACCCCTAAGCTAACCCCAGCCTCCTCAACCTAAGATGAAACCGGCGGCCAACTCCGGCGAGATAAGGATTTAGGGAAGTT
TCCCAGGCCCCTACCGCTGCTACCACCTCGACTCCTCTCTTCTATCTCCTCCCTGATCTCTAGTGTGTTGTATTGGTAAACTGTTCTTCCCCTTATCCAC
TACTGATTTATGGTTGTGATGCACTGATGATACTTGTAGACTAATCCTAATGGTCAACTTGATGACTCTATGCTATGGATTGTAATTACTAGTTCTAGCA
GGGTTCTAGGTCAATTGATTTGCTAGATTGGATGATGCATGTATGCGAATGCTCACATGTAAACCTATGAATTTTATTACTGAAATTAAAATCACACTAA
TTTGATTATGTCCTTATATATGCTATAGGTAATGGAATTATATAACCCATGAGACCTGATCTTGAATACAAATAAATGTTGACTAATTTACTGCTACTGC
CTATATGTACTGCCTCTTGCCTCTATATGATTTATTTGATTTGAATTATTCATGCAGGGAGAAATCAGACTTATTGATGACCTGACTACGTTATGGTTTT
TATTCAGATATACCTTATTATTACCTGATAATTTCATAAACCACGATTGCATATATTTAGACTGAAGATATATTTGTACATTATAGATGCCATTCTTTTC
TCTAAATATGCTCTGCTCTTCTAGCTGACCTACTATTGATACCTATGATTCTGCTAATGGATTTTAGATGCTCTATTTAGTTTCTACACTGAGAATAGAT
CAATGTCTACCCATTTATACTCTGCCTATTTAACTTGAAATAGTAGCACAATATTGATCTTATCTTAAGCTCTTGAGGTTAAATAGAACAATAATTATTT
CTAATTATGCATGCATTCAAAATTGTCCTATGATGGCTTCACTGAGCATTGATTTAAAGAACTATATACAGATATAATATGATGGCTTCACTGAGCATTG
ATTTAAAGAACTATATACAGATATAATCCTTAACTCAAATGCACTTGTAGATCATCAGAGATAATTCTTGCTGTTAACTATGTAGTGAGATAGCTGATCT
ATACTTGACTTATCCTTTTTAAGAATCCCCTAAATTTAAGATGATACTCTATTGTCCAATTACTCATAAAAACTGTCTTGAGTGCATATGATGTACTCTA
ATTTAAGTGCAGGTTTTGATCTTCCTCAAAGATAGAATGCTTAAGTTTAATTTTTACAAAGATGTATATGCAGTCACACACTCCTACACATACTAGTATA
TGCTCAGATTAAAATATTTATGCCTTGCCTATCTCACTTATGAGTCTATTTCTTGATCCTAGGTCTATATGCACATGATGCTCGCCAAATAGATAAACAA
CAATGGTTCTGTTATTAAATCATGAATGGTCTTGTTTATATCTAATGAAGGCAGATGCATACCTATATCTTCTAATCATACTAGAGCATGCACAGATCAA
AGTAGATGCCATGTTTTATTTATTTTTTCTTGATTTATCTGCTTGACAATCTTACCTTCAACTGTATTCTGATTTTGGTGGTGATATTTCCTGGCTACTG
AATCCTCTTGAGCTTCCCTCAATTAATCTTCCTTTTTGTTAATTAATTTCTTTGCTATTCCTAATTCTTGGCATCCTGCTGGCACTGCTACAGGTTGCTA
CTCCTCCTAGAGTTTGTTTGGCACCTTTTTGAGATCAAATCCCTTGCTTCCTCCTGAGCTTGAGCTGAAACCCCTTCTCCACATGTAAATCAGGTACCTG
TCCTCTTGTCTCTTGTTTTCCAGGTACTTCTTGACTGCTTCTTGCTATCTTTCTCGATCTGGTACTGGTGATTCTCTTCCTCTTGAAGCTCATTCTCCTG
CTTGATTTTTGCTCCATCTTGCTTATTGACCTGAGTTTCTTGCTTCTTCTAAATCTCAAGCAACCATTGCTTCACCTCCTACTCCCTTGTCTCTCTCCCT
CTCTCTGGTTGCTTGACCACGGATGCTATAGTTGAGCTGTGGTGGGGTTGAGGTGTAGAACTTTTAGTTGGTTATCTCTCTTTCTCCCAATCTCCACTGA
TTTCCAGCCGATACTGCTTGCTGTTGCTGGGATCTTACTACTACTATGGCTGCTGTACTACTGGGAGTTGCTAGCTGCAGCTAGGTGTCTATCGTTGCAA
CCAAGGCTGGCTCTACCAGACTCTGGATAATTCACATTGACATGCTTTATCTCAGTGCATTTGGTGCTAGTGATTCACCTGCTTGGGCCACGTATGGCTG
ATGCTAGCTTTGACACCTCACTCTTGCATGTTCAGTTGGAGAAAATGTAAAATTGTTGACTTTACAACTTATAAGAAATTTTTAGTAAATCTGAGATATT
TTATACCTTTTCACTTAAGCCCCTCAGGTTTGTAAAATTAGAAATTACTCTCAGATTAGGGACTGAGTTGTAACTGTTCTAGAATTTAAGATCAGTTTTG
CAAGACTACCAATTACTGTTTGGTTGCGTGACCGTTAACTTATAAGCATTCAAGAATAAAACACTCCTAGAATAAAATTGTATACTCTAATATAGCACAG
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GCATACTGTGTAAGATTTTAAATATATAACTATATGCATGTATGTATGGATGGTTGCAAAACTGTATTGGTATAAATTGTGAATAAAGTGCTATAGTTTC
CATGGTGATTTCTATTGCGCATATGTGCCCCTCTCTTAGTGATGACTAATCCATGCTATAATTCATGTCCAGCAAGGTGGCATGAAACACAACTAAATTA
TCCCACTCCTCACTAGGTTTACTTTAACTAACAATAATTCAATGATGCATATGGATATGACTAAATAAATAAATGACAAGGAAACAATCGAGAAACCATT
TAATATCCAGAATAAAAGAACAATCAATATATTTATAGGTCC