Detailed information on CNT30552519


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONOSAT000352, E-value = 4e-79

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30691176Oryza glaberrimaOryza sativa65.9889.8199.162019forward
CNT3068352Oryza glaberrimaLeersia perrieri7.2927.8884.3223reverse complement
CNT30596312Oryza glaberrimaOryza meridionalis3.7622.7391.3115reverse complement
CNT30106047Oryza glaberrimaOryza longistaminata8.0123.9794.29245forward
CNT30103824Oryza glaberrimaOryza rufipogon7.6851.4291.91235reverse complement

Expression of CNT30552519

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (29 aa)
MHTHQRYILSPLAYKKQTYYEIYIIILRI*

>peptide 2 (48 aa)
MQKQTYRSICPVVYRPSGYTTSIPKYLTPLTFLKMFDHLSYSKNLSNC*

>peptide 3 (29 aa)
MVLATGIYTLQLSSGGRPAPADLPPANLR*

>peptide 4 (32 aa)
MRSMRICKSKHIGAYVRSCTGRLDILPPSQNI*

>peptide 5 (50 aa)
MYYGLNGCLYICTVKNYRVYVCRGRSTLGVAGAQASTVSTRTMRVLRNLH*

>peptide 6 (50 aa)
MHENHHFRVLHFMKCMTDFNPSDSRKFSNKLAGAKWFLRPLCMSFPFPRS*

>peptide 7 (66 aa)
YSLCYIYWPLSGSTCLTCKRANLLYGLSYRDLYPATVVRWSSGAGRLAAGESAMMSVYMAYATVSS*

>peptide 8 (57 aa)
MHENYHFRVLQFMECLCVCVANAQFMDGLATAKMMLRINIIVFLSETNRSSGNTHIN*

>peptide 9 (54 aa)
MVSAAAMHVIPIPQKLILLTVRCKRCKQSAHDTHSQRASCMLLITMEQITPIPF*

>peptide 10 (50 aa)
MLYFLLTARVLPLYCWSVGPSHDPEDRKGVIHDLPLKTINKASLKLMIIN*

Sequence

>CNT30552519
TACAGTTTGTGCTATATATACTGGCCTCTATCCGGGTCAACGTGTCTAACCTGCAAGAGAGCTAATCTCCTATATGGTCTTAGCTACCGGGATCTATACC
CTGCAACTGTCGTCCGGTGGTCGTCCGGCGCCGGCCGACTTGCCGCCGGCGAATCTGCGATGATGTCCGTATATATGGCATATGCTACGGTGAGCAGCTA
GCAGAGCTTGCTGCAGGCAGAGCAGCTACGTACTGTAGCTAGCGAGAGCTGGGCATGAAGAACAGCAGGCGGCCAGCTATATTTATTTCAGCTTAATTCT
CAAAGGGTATATATACTTTGGTGAAGATCGATCGGTGCATGGTTGATTAGAGAGCCAACTGAATGGGATTTCGCTCAGTTTGATCCTCATCACAGTAGGT
GCTTAATTGTGGAAACAGGCATTGTTCAGGCATATATGCCACATTAATTTCATGGGGGAAACGAAGATACTATGCCAAGCCTATTATATATGGTTATCAG
ATATAGTACAAACAACATGAAACAAGCATGAGCTGATATTTGCAATTGAATTTTCTATGAGATCGATGAGAATATGCAAAAGCAAACATATAGGAGCATA
TGTCCGGTCGTGTACCGGCCGTCTGGATATACTACCTCCATCCCAAAATATTTGACGCCGTTGACTTTTTTAAAAATGTTTGACCATTTGTCTTATTCAA
AAAATTTAAGTAATTGTTAATTCTTTTTCTATCATTTGATTTATTGTTAAATATACTTTTATGTATACATATAGTTTTACACATATCACAAAAGTTTTTG
AATAAAATGAACGGTCAAACATGTTTAAAAAAGTCAACGGTGTCAAACATTTAGGGAAGGAGGGAGTATATATGTAAACAGAAGCATGGTTCCTACATGC
ATACTCATCAGAGATATATACTCTCTCCATTGGCTTATAAAAAACAAACCTATTATGAGATATACATCATAATACTACGAATCTGAACATGAGCAGTTTG
TTTTTCATGGGATGAAGGAGGGAGTATGAAAAGCTGGCTTGCTTAATTGTGCACCATGCAGATCAAGAGCAGGGAATGCAAGAAAATGCAGCATATGGTA
TGTAAAATGCACGATGCTGGTGAGTAATGTTTTAATGCCCCTTATTTGTTACTTTGGTTAATTAATTTCTACTTAATTTTATCCAGTTTTGCCTGATCAG
TACCCTACTTTAATTGTTTCACTATATAATTTGCACCCGGTTATTACTATATTGTTGTAGTGTGTCTATCTTACCATTAATAAGATACTCCCTCCGTCCC
TAAATATTTGACGCCGTTGACTTTTTTAAACATATTTGACCTTTCATCTTATTCAAAAAATTTAAGTAATTATTAATTTCTTTTCTATCATTTGATTTAT
TGTTAAATATACTTTTATGTATACATATAGTTTTACATATTTCATAAAAGTTTTTGAATAAGACGAACGGTCAAATATGTTTTAAAAAGTCAACGGCGTT
AAACATTTAGACGGAGGGAGTAAGAAGTATAAGGCTAGTTTTTGTAACATATATAGGGTATCCACTATATATCCCACTATTCCTTTGCAATAGTACTGAA
CTGCTATGCTTATACTAGGACATTAATTACTTTGGTTACACAGTTGGGAGGTGTCAGTTTAGTCCAGTGGCTGTAGCACAATGTTGTCTTTTGAGGTGAT
TTTTTTCATCAAGTTTATTTTGCATGATACTCCCTGATCATTAAGATTTCTTAGCAACATTTATGAAACCACATTAAAAAAAGGACGAACGCATAGGCAG
ATATATAGCCCGTGCTTCACTTGAAGATTTGTCATTCATGCCTCAATTTTCACTAGCTAACACAGAACGTTTATGTGTACAATAATCCATCTCTCTTTTA
TGGTTTTTATGTGTGTGACCACGTTCTTACTAGATGCACGAAAATTATCATTTTAGAGTTTTACAGTTTATGGAATGCTTGTGTGTGTGTGTTGCAAATG
CTCAGTTTATGGATGGTCTAGCAACAGCTAAAATGATGCTACGGATTAATATTATTGTTTTTCTATCTGAAACAAATAGATCATCAGGCAATACACACAT
CAATTGAGGAACAACAGCTAGCACACAACTTATTTCATGACCACGTTCTTAATTAGTTTCTTACTGAATGCATGAAAACCATCATTTTAGAGTTTTACAC
TTTATGAAATGCATGACAGATTTCAATCCTAGTGATAGTAGAAAATTTTCAAATAAGCTAGCTGGTGCAAAATGGTTTCTGCGGCCGCTATGCATGTCAT
TCCCATTCCCCAGAAGTTGATATTGTTAACTGTTAGGTGCAAACGTTGCAAGCAAAGCGCGCATGACACACACAGCCAGAGGGCTTCATGCATGTTATTA
ATTACGATGGAACAAATTACTCCGATACCATTTTAGCGCATGAAAAGATGGTTTTTGCTAACCAGCCATCTTAAAATGGATTCATTTGCAATTGAACAGT
ATAAATTTACATATTAATTGTATTGTCTTATGCTCTACTTCCTTCTCACGGCGAGAGTCCTGCCACTATACTGCTGGTCAGTCGGACCGAGCCATGATCC
GGAAGACCGGAAGGGAGTCATTCATGATCTCCCTCTTAAAACAATTAATAAGGCTAGCTTGAAGCTTATGATCATTAATTAACCTACGATCCGTCTAGCT
ATACTAAGCTACTCTTCGCTAATCTGCTTAACAACTTTCAGGAAGTTTTTTTCAAGTATGTACTATGGATTGAATGGCTGCTTATACATATGTACTGTGA
AGAATTACCGTGTATATGTATGCAGGGGCAGATCTACTTTGGGGGTGGCGGGGGCTCAAGCCTCTACTGTTAGTACCAGGACTATGAGAGTTCTACGAAA
CCTCCACTAAATTTTTTATTTTGCCATACGTATATGAGAAGAGGGTTATAATTTTATTTAATTAGTTTGTTCAGATTCCTTGTTATTTTTTCATGGATCT
ACCACCGTGTTTATGAATAAATTTTGGTACTCCTACCTATTATTGCCAAATCAGACCATG