CANTATAdb - search

Detailed information on CNT30541468

BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|A4QL94|ATPI_LEPVR, E-value = 4e-151

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)

Target	Query species	Target species	Query coverage (%)	Target coverage (%)	Identity	Alignment length (nt)	Orientation
CNT30710758	Brassica napus	Glycine max	5.84	66.89	89.5	200	forward
CNT30353938	Brassica napus	Eragrostis tef	11.6	68.33	81.61	397	forward
CNT30364459	Brassica napus	Sorghum bicolor	3.89	32.52	81.2	133	forward
CNT30371010	Brassica napus	Oryza glumipatula	15.08	56.46	81.01	516	forward

Expression of CNT30541468

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (38 aa)
LRIVSVATAVLPVCLSPIINSRWPRPIGIMESIAISPV*

>peptide 2 (51 aa)
MTGIGTTKGTKETRTTTTNSSANIFPKSRKLSDRGFVKSSKMLMGKRIGVG*

>peptide 3 (52 aa)
MNSRTNSKKFWPPVGMVCGLRTARAAEPNKIAITTQEVIRTCAWTWNPPICQ*

>peptide 4 (29 aa)
MVTMSIVLILFWKKKKNNAYHNRKERANQ*

>peptide 5 (30 aa)
MIKHSYCPLTEIRTLNYFDSRPPLFFYLFT*

Sequence

>CNT30541468
ATTGAGAATTGTATCTGTGGCTACTGCTGTTTTACCGGTCTGTCTGTCACCAATAATTAATTCCCGCTGGCCGCGTCCTATAGGGATCATGGAATCAATA
GCAATAAGTCCTGTTTGAAGAGGCTCATATACAGAACGTCTCGAAATAATACCTGGGGCAGGAGATTCAATTAACCGAGATTCAGAAGCTGAAATCTTAC
CTCGACCATCAATAGGGTTAGCCAAGGCGTTTATAACACGCCCCAAATAAGCCTCACTCACGGGTATCTGAGCAATTTTTCCCGTAGCTTTGACTGAACT
TCCTTCTTGGATCATCAAACCGTCACCCATTAATACAACACCAACATTATTTGATTCTAAATTAAGGGCAATACCTATAGTACCCTCCTCAAATTCTACT
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ATTGCTCAATACGTTCACGGATAATATTACTAATTTCATCGGCTTTAATGGTTACCATGAGTATTGTCCTAATTCTTTTTTGGAAGAAAAAAAAAAATAA
TGCCTATCATAATCGTAAGGAAAGAGCTAATCAGTAATTTCTTTCATCGTACCAAACATACCAATATTTGCATTAATAGTACGTAAATGTAACTCATTAC
TCAAACAACTATTTAGGGTTCCTATAGCTCCCTGTAAAGCTTGTTGGAAAACCCGTTCACGGACTTGATTAATTGTTCTTTGTTGCTCAAAAAGAATGGT
TTCGTTTTTGTAATTTTCTAATTGTTTCAAAGTCCTAGAAGTTGAATTAATCAAATTTACTTTTTCTCGTTCGATTTCAGAGTATCCATTTACGCGAAAC
TGATCCGCCTCCATTTCTACTTTACGCAGGCGAGCTCGGGCGTTTTCTAATTGTTGAATAGCTCCTTCACGTAGTTCTTCTGAATTTCGAATAGTATTTA
ATATCCTCTGCTTTCGGTTATCTAATAAATCATTTAACACTCCCTTTCCAAAAAAGATCAATACACCGAAGACTACACTTAGATTTATTGGATTTGTTGC
TAAAATATCGGTATTAAACCCGAAACTCCCGGCGGATGGCCAGTGACCCAAGTAAACGAAAGAATCGGTTAAATTTTTCATATAATCTCCTCTTCTAGCT
AAACTATAAAAAAAAAGAACTCTGTCCTTTTTTTTTTTTATTCTTTGTTTTTTTGAATAAAAAGAAAATTTCGTTTAATAATTTATAATTTAATTTACCT
ATTTGGATATTTATAAACAGAATCAAAAACCTATTCTATTTACAAATTTATTTTCCAAAAATTTTTAATTTTCAATAATAATAATGAGACTTAATTAAAA
TTAAGCTAGAATTTGAGACCAATTTTATATCAATTTTAAAAAACCTAAACCTCCTTTTTGCGCAACACTCCTTAAAAAAAAATTTCCATTAAACTAAAAA
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AACTAGGCCATAAATTGTTAAAGCTTCCATAAAAGCCAAACTAAGCAATAAAGTACCTCGTATTTTTCCTTCTGCCTCAGGTTGTCTCGCGATACCTTCG
ACAGCTTGACCCGCAGCTGTACCTTGACCAACCCCAGGTCCAATAGAAGCAAGCCCAACAGCCAACCCAGCAGCAATAACCGAAGCAGCAGAAACCAGTG
GATTCATGATAAGTTCCTCACACCAAAATAAAGAAATAGTTAATGATACAATCATCCAACGACTTAGGACTTAATTATAATTAAGTCATCGCTAAGATTC
ATCCAGCCAAAATAACCAAAAACTTGATAAGAATTACTTTGATATTAGTTCCTATCCACGGGATTTTGAAAAATGCATAATATATATATATACGACTTTT
TTATGCCGTTTCTTTTTTGTGAACCATTCTTTTCTTTTAATTCTTCGTTCTTTTTTTGATCGTTTTTTTCAGCCAATTCACAGATAAAAAGTAAGAACTT
ATAATCGAATCGTTATCTAAATAGAAATTCACAAAAATAGTGGGGCAGATTATATAGATCTTTAACTTATATATACCTAGTCAATATCAAATATGACATA
TACAAGTGTTTCTTACATAACGTAAACCAACTATTCGATAATTGGGCTAACCTAAATTTGAAAAAAAAAAATAGTTAATGATGACCCTCCATGGATTCAC
CTATATAAGCCGCAGCTAAAGTGGCAAAAATGAGAGCTTGAATCCCGCTTGTAAATAATCCAAGGAACATGACAGGTATAGGAACCACTAAAGGTACTAA
AGAAACAAGAACAACAACTACTAATTCATCGGCTAATATATTTCCGAAAAGTCGAAAACTCAGTGATAGGGGTTTTGTAAAATCTTCTAAGATGTTAATG
GGTAAAAGAATTGGAGTTGGTTGAATGTATTTACTGAAATACCCTAATCCTTTTTTGCTAAGACCCGCATAAAAATATGCTACTGATGTGAGTAAAGCTA
AAGCAACCGTCGTATTTATATCATTCGTTGGTGCTGCTAACTCCCCTTGAGGTAACTGGATAATTTTCCACGGTAAAAGGGCTCCTGACCAGTTAGAAAC
AAAAATAAATAAAAACAGGGTTCCAATAAAGGGAACCCATGGACCGTATTCTTCTCCAATCTGGGTTTGACTCACATCTCGAATGAATTCAAGGACAAAT
TCAAAGAAGTTTTGGCCGCCAGTTGGAATGGTTTGTGGATTGCGAACCGCTAGAGCTGCGGAACCTAATAAGATAGCAATTACAACCCAAGAAGTAATAA
GGACTTGCGCATGGACTTGGAACCCCCCTATTTGCCAATAGAAATGTTGGCCTACTTCTACACCAGATATCTCATATAACCCTTCTTTTATTAGTGTATT
GATGGAACATGATAAAACATTCATATTGCCCTCTGACAGAAATAAGAACTTTAAATTATTTTGATTCAAGACCCCCCCTTTTTTTTTACTTATTTACTTG
AATTTTTATTTTAGTTTTGGATACCAACTAAACGAATCACACAATATACCCAGTTTTTTATCTCTTTTTCTTTTGTATGATTCAGGAATAGTAACCGATT
TTATAAATCGAAATACAGGGAGCCCCTCCCTCAAAAAAAATTGATTTATTTATCTTATTATTAATCAAGAATTTTGTATATAGCTAGAACGACCCTCACA
AATTGCGAATACTAATTTGTTA