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Detailed information on CNT30541460


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|A4QL94|ATPI_LEPVR, E-value = 4e-153

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30121210Brassica napusCitrus clementina20.0214.5886.8568forward

Expression of CNT30541460

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (30 aa)
MIKHSYCPLTEIRTLNYFDSRPPLFFYLFT*

>peptide 2 (51 aa)
MTGIGTTKGTKETRTTTTNSSANIFPKSRKLSDRGFVKSSKMLMGKRIGVG*

>peptide 3 (52 aa)
MNSRTNSKKFWPPVGMVCGLRTARAAEPNKIAITTQEVIRTCAWTWNPPICQ*

Sequence

>CNT30541460
ATGAGTATTGTCCTAATTCTTTTTTGGAAGAAAAAAAAAAATAATGCCTATCATAATCGTAAGGAAAGAGCTAATCAGTAATTTCTTTCATCGTACCAAA
CATACCAATATTTGCATTAATAGTACGTAAATGTAACTCATTACTCAAACAACTATTTAGGGTTCCTATAGCTCCCTGTAAAGCTTGTTGGAAAACCCGT
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TCCAATCTGGGTTTGACTCACATCTCGAATGAATTCAAGGACAAATTCAAAGAAGTTTTGGCCGCCAGTTGGAATGGTTTGTGGATTGCGAACCGCTAGA
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TTTTTATCTCTTTTTCTTTTGTATGATTCAGGAATAGTAACCGATTTTATAAATCGAAATACAGGGAGCCCCTCCCTCAAAAAAAATTGATTTATTTATC
TTATTATTAATCAAGAATTTTGTATATAGCTAGAACG