Detailed information on CNT3054145


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30281672Amborella trichopodaChenopodium quinoa1.0921.5290.251forward

Expression of CNT3054145

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (39 aa)
CLEPMLGTNRTRDEKGANTVILVFSRAFPWFPMRQRVIS*

>peptide 2 (62 aa)
MTNEHFLKYSLHGNESIFLRNHLSITSSISLFFPCIDGPGHEGSFHLSKTAAAKSNTKKTLI*

>peptide 3 (52 aa)
MFSWPFNRCHFFKLKTSNPGGKKKSRHCTLDYAEISGNHSNRILILSSPGLI*

>peptide 4 (46 aa)
MGVFVGSFWHWRYWYTKVDHCLKYKDFDFPIITIFKYGTDINFPKY*

>peptide 5 (45 aa)
MFPSSLGPVSNVIKQKFRCLFLSLNSTFRCHFPSLTACLLIRKTR*

>peptide 6 (42 aa)
MNELIWTEKLTMSLISYFFNNASSFPFYKARLQPKFSPNLQI*

>peptide 7 (39 aa)
MDKMWFFCLCRYTMGSDSHVLYFRNLDILLESFYIEIVL*

>peptide 8 (30 aa)
MVNHHKRVICGTFIFGMSLWCKSKLAIKKY*

>peptide 9 (30 aa)
MNMPWCRVGKFSIYGAQERWGLGKSNGHQV*

>peptide 10 (32 aa)
MNISAYLTRIQAFKTSILKLIFQTQHVSTTFR*

>peptide 11 (32 aa)
MLYRCVVSERSILKLTFLTLVSVLDIYICIHF*

>peptide 12 (32 aa)
MWAKTYLLCSAKAVRSNCVPSCNQGRLAHTVS*

>peptide 13 (39 aa)
MTLKFLTLPPLSRRNGQLSEILMRKASKEYGVSFMFVCG*

>peptide 14 (31 aa)
MQWYTIMMFAPLEWFFYFEAPYAFILFYLLF*

>peptide 15 (31 aa)
MEREPKILKKNSVIHSLKPVSMLCDFTISHM*

>peptide 16 (31 aa)
MQVPFLSTKPVYNQNSVQTFKFKGVNKTPIF*

>peptide 17 (32 aa)
MAIEKESNQIVLFLNVSIVLFLNLSDLCSYGT*

Sequence

>CNT3054145
TGTTTAGAGCCTATGCTCGGTACAAACCGCACTCGAGATGAGAAAGGCGCTAATACCGTAATTTTGGTGTTCTCCCGGGCGTTTCCCTGGTTCCCCATGC
GCCAGAGGGTAATTTCGTAACTTTGTCTCTCATATAATTTACAGTTTTTAACGCATATTTTCGCGCGTTTTAACAAATGAATGTTGGTCTCGTATCGAAA
TAAATAACCATGAAGGATGTTTTCCTGGCCCTTTAATCGCTGCCATTTCTTTAAACTTAAAACCTCAAATCCTGGGGGAAAAAAAAAAAGCAGACATTGT
ACCCTAGATTATGCAGAGATATCAGGAAATCATTCAAATCGCATTTTGATTCTTTCGTCTCCGGGTCTGATTTGATTGGAATCAAGAGAAACACAGAGTT
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AAGCTTGACAAGGCCTATGAATTTGAAGTTAAAATATAGAAGGGTAGATGATTGAACAACTGTGATGTTTTGATGTAATGACAAGAAAACCTTAAAAAGC
AGAAGACTGGAATCAGGTTCAAAATAACAAGGATTAGAACAAACTTTGCAGTTAAGGAACTAAAATACTATAAGAATATGGTATATAAGCTAAGATACTA
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GTTTCATAGGATCCTTGGTCCTATAAGAGAAAGATGTTCCCCTCTAAGATTTCTCAAGGTTGGGTTCTCTTGTCATTTTAAAAAAAGCTTTGGGGTGGTC
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TTTTTGTCTCTGCAATTTCCAAGACTAATTCGGTTCTAAACTAAGCACCCAACCCACCTTTTGCCCTGCTTATGTTCCCGAGTTCCCTTGGGCCTGTCTC
TAACGTCATTAAACAAAAGTTCAGATGTCTCTTTCTTTCTCTCAACAGCACTTTTAGATGTCACTTTCCCTCTCTAACCGCATGCCTTCTGATTAGGAAA
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TCTATTTATGGAGCCCAAGAAAGATGGGGCTTGGGCAAATCTAACGGGCACCAAGTTTGAAATGCAGAGGGCTAAAAAAAACTGACCATGAACTTGACTC
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CTTGTTGGAATCCTTTTATATTGAAATCGTGCTATAAAAGTACTTAATGTCACCTAAAATCTCACTTCGCCTTTTTTTTTGAAATGTTGTATAGATGTGT
CGTGTCTGAAAGGTCAATTTTGAAATTGACGTTTCTGACACTTGTTTCTGTGTTAGATATTTACATTTGTATCCATTTTTAGGAAACACATTTTTATAGT
TGTGTCACAAAGATATGAATATAAGTGCGTATTTGACACGGATACAAGCGTTCAAAACGTCAATATTAAAATTGATTTTTCAAACGCAACATGTCTCTAC
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CTTCAAGAGTAAAGTTTAACCAAAAACTGACTGGATTTACCAAGTCCACGGCATTTCTTTAGTGTGTCTACAATGACTACGAAAGTAATAGGAGTATCCG
TGGACAAAAAAGATCTCTATGGCTATTGAGAAAGAATCAAATCAGATAGTTCTATTTCTCAATGTTTCTATAGTTCTATTTCTCAATCTTTCTGACTTGT
GCTCCTATGGAACGTGAGCCAAAAATATTGAAAAAAAATTCAGTCATTCATTCTTTAAAACCAGTATCCATGTTATGTGATTTTACAATATCGCATATGT
GAAATTTAAACCTAATATTTCTTGAGCTTGTGTGAACTGGACAAGATTATTGGTGACAGGACAGTTTGGTGGAAAACTCAACTGAATTTAAGACAAACAA
ATCGCCCAGATCTAAGAAAACTCTCTCTCTCTCTCCCTTGTGCATGACCTTGAAGTTTCTCACACTACCCCCTCTCTCTCGAAGAAACGGCCAACTGAGT
GAAATATTAATGCGGAAGGCCTCAAAAGAATACGGTGTGTCGTTTATGTTTGTTTGTGGGTGAATGACAAATGAACATTTCTTAAAATACTCTCTGCATG
GCAATGAAAGCATTTTTTTAAGAAACCATCTCTCTATAACTTCCTCTATTTCTCTCTTTTTTCCATGCATCGATGGTCCCGGCCATGAGGGGAGTTTCCA
TCTTTCCAAGACGGCGGCTGCAAAATCCAACACCAAGAAAACCCTAATTTAAAGGCACGCGTGACTTCAAGGTGTCTCAAGGCTTGGCAGCATAGAAACC
GGGTCCATACCAATACACCTCTATGAAAGAAGGCACCAAAACGTGGTGAAAAGTTTGCATGGTGAACCACCACAAACGTGTTATCTGTGGAACGTTTATA
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TAAAAACAGTGAATCGGTCAAGAATTGGTTTGGATAAGTAATCAATGTTTTTACTATAGCAAAACGGTGTTTTCACTATAGCAAATTGCCGGTTCTCTTT
TAGACCAAGACAGTTTTTGATATATTGATAGAATTGGCACGTGGTGATAGATTCTTGGGTCGAAAAGGACGATTTTGTGCCGACCTGACGATTTTTAAAT
CATTGATAATTATGGATTGGTCCAAATTTGTGGAAAATATATGCAGTGGTATACTATTATGATGTTTGCACCATTGGAATGGTTCTTTTATTTTGAAGCA
CCTTACGCTTTTATTTTATTTTATTTGCTATTTTGACCCTTGGTCTGATAATGAAAGCATTGGACTGATTTTTGCATCCTCAGACATTTCTATGCTTTAT
ATTTTATTTTAAAGTGCATAGTTTGATGTTGGAGACATTGAACCGAAATTTTCTTAAAATAACACAAAATTGGATGGTCTGATATCTCTAATGTCAGACC
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TGTGAGCACTCTCATGCTTTTTCAAAATTGAAAGTCTATCTAAGCTTCTAGATTTTAAGAAAATTTCCCCAAATTTTAAAAGTTTTTGTGGTAGAGTGGG
GCTTGACAACCTAGGACATAAAAAGCTTGAATGGCGTCATGGGAGTATTCGTTGGGTCGTTTTGGCATTGGAGATATTGGTATACAAAGGTTGACCATTG
TCTAAAATACAAAGATTTTGACTTTCCTATAATTACCATATTTAAATATGGTACAGACATAAATTTTCCAAAATATTAACAGGTTCAGGGGGATTGTTTT
CGAACCTTTTTTTATGGATGTGGATGTTTTATGTGTACAGACATAATATCCACATTCACTCGATGAGGTTGAATGCGG