Detailed information on CNT30537475


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|P93295|M310_ARATH, E-value = 9e-31

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT3018229Eucalyptus grandisZea mays1.8833.9388.1676reverse complement
CNT30100515Eucalyptus grandisOryza rufipogon1.8829.9290.7976reverse complement

Expression of CNT30537475

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (51 aa)
MRAWISVCRADFAGKSQDLVVAIMNEDVEKSGTFAAEMSGVDCCGNGSERL*

>peptide 2 (45 aa)
MDLLITLNINRLHQISYVHLHLKTNEFAVFRSKSTHGLSNLSSIT*

>peptide 3 (31 aa)
MLLSRSTIKKALFKFLITSIIITNLLKLIKSV

>peptide 4 (41 aa)
MHRWNKLAFVAKALWQTNQRKGRILGGSFIAQIAFHSDLGG*

>peptide 5 (30 aa)
MHYTFDYWVSHTQRMFLVIHMISSNDISLE*

>peptide 6 (35 aa)
MIGMLLLKYKAVAWLPNLPQQSCNHLQIRTGTPFF*

>peptide 7 (38 aa)
MVIMEGSVVFSTINIGHALPEMQKCFATLQQFAAHMAS*

>peptide 8 (47 aa)
MEIRELRRRFCNEGTHLPWSLDRVVKSIHQHHTVRFNEKMILILPFS*

Sequence

>CNT30537475
CACAGCTAGGTTATGGAAATTAGAGAGCTTCGCCGCCGCTTCTGCAATGAGGGAACGCACCTCCCATGGAGTCTCGATCGGGTCGTGAAGAGCATTCACC
AACACCATACAGTCCGATTCAATGAGAAAATGATCCTCATACTTCCCTTCTCGTGACAAATGATCAAGGGTAAGGATGAGAGCTTGGATCTCGGTCTGCA
GAGCTGATTTCGCTGGAAAATCACAGGATCTGGTGGTCGCCATAATGAATGAGGATGTAGAGAAAAGCGGGACGTTCGCTGCAGAGATGAGCGGGGTTGA
TTGCTGCGGCAACGGATCAGAGAGATTGTAAGCGTGAACCTGGGCAGAAGCCATGTGAATAACCTGAAGATGATCGGGATGCTGTTGCTGAAATACAAAG
CGGTTGCGTGGCTTCCAAATTTGCCACAACAGAGCTGCAATCATTTGCAGATCAGGACAGGTACGCCGTTCTTCTAGCTGAGCGACTAACCACACATCTA
TCCGTGTAATTGATTGCTGAGTGATGGGAATGTTAATCTGTGGATGAGACCATAGATGTTGCGCCCATGGACATAGTAGGAAGAGGTGTTCTGTAGTTTC
TGGGATAAAGTTTGAACAGATGGGGCAATAGGAATCTGTAGTGATGCATCGCTGGAATAAATTGGCTTTCGTAGCTAAAGCGTTATGGCAGACCAACCAG
AGGAAAGGTCGGATTTTAGGGGGAAGCTTCATAGCCCAAATAGCTTTCCACAGTGATTTGGGTGGGTGATAGGACGAAGATGCTATATTTTGTTGAGTAG
TAGGAGTTGCATTCCTAAGGGTATGATATCCTTTTTTTCACCGAACATGTACCATTTGTAGTACCTGTCCAGATAATTCTATCAGAAGTATATTGAGGAC
GAACCTGGATGTTAAGTATTTCTTGGACTGTGGAATCATCAAAATGTTGGTGCAGAAGAGGAACGTTCCAATTGTGACTATCCAGGTCCATTAATTCGGT
AACAAATAATGGGTCATTCCGATTAGCCAGGCCCCCGATAACTCCTCTCGGAAGCCATCGATCCTGTCTGACTTGAATAGACTGTCCATTGCCTACTGAC
CAGCGAAGATGAGGTAAAATAGACTCCCTCCCAACTAGAATACTGCGCCATCCCCAGGAAGGTCTTGATCCCCTTTTAGCATGATTAAAATCAGTAGAGT
GAAAGTAAAGCCCTTTAAAAAGTGTACTCCATAGCGCCGTTGGGTTTTGAACTAATCGCCATGCTTGTTTCCCAAGCATGGCTTTATTAAAATCTTGAAG
ATCCCTAAAGCCGAGGCCCCCACTCTGTTTGCTACGCTTAAGAACAGGCCAACTTTTCCAGTGAATACCTGCTTTAGTACTATCTTTCTGCCACCAAAAC
CTCGCAACTTTCTGTTCAATGGATCGACAAATAGAAGTAGGAATTCTAAAAATGGACATGGCATATTGAGGTATCGCTTGTACAACAGATTTAAGTAATA
TTTCCTTTCCACCCTTAGACAACAGACTTTCTTTCCATCCCTCTAGTTTGGCATTCACCCTCCCCAAAATCCAAGTTTTATTAAAGTTAATCTTATAGTT
TTCCTACTATTTTTTGAAAAGTTTCTGCTTTTATCATGTCCTAGGCAATTTGACATGATAAAAGCAGAAACAATTTTCGAGCAAATAATGCAAACATATA
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ATGATATAAGTCTTGAATAATTATAACATTAGTTTTATGGACTGCTATTATGCTTTAATGTTATGCATGTTGATTGCATTAATTCAGGTGGGATCATGTG
TGTGAATTGAAACCACATATAACGTTCATTAACGTGTTCATCCTTCTAGGCAACTGTTTGTTTAATTTCCGTTTGCTTTATAATATGATATGACAATTTT
AACATGTTTCATGTTTTCTTTTTAAGTATTTTGCATAAATATCCAAACCCTATAAAATAATGGGTTAATATCATGAAAAACCCCAAAATAATACATCTAT
AGCAAATTTACCTCAAACAATTTTTTTTACTACTAAAAACCCTAAATTGATACATCTGTGATAAATTTGTCATTCATTAATTTTTGTTAAATTTTTGTGT
TTGCTAAGTTGCATGACACGTGGTATTTGACGGGCATACTAATTCGGGATTTTACCCTCCGTTTTTTATATGCATATTAGTTTGTAATTTATCGTGGTAT
TAATTCAATTTAACGAAAACTAATATAGTATAAATTTGTCACAAATGTACTGATTTGAGTTTTTTTGTTGTGAAACTTAATCTGAGTAAATTGTCACAAG
TGTATCAGTTTCAACAATAAAAAGTTATGAAGAAAATCACGATTAATTTGTAAAAAGGTATAGCCCTTTTAGTACTCAGTCACGAAAGGGCAAGTGTCAA
TAGAAGTTTAACTTCAAATGCTTTTTGGGGTGATCTTGTTGATTATTCGATAAACTGAGTTAAATATTTCTCAACCAATGAAATGATTAAAGGGGAACGA
TTCCACAATAGTTTCAAGACTTGTTTAAGAGAATATGACTAATACTCACTTACTCATTAATTTCATTCCAGTAAACATTGACCACCTTTAGAAAGGTGTC
ATATAATAAAAAGGAGTCGCCGGTTTGAGTTGCTCCTATCGCTGCCATGACTCAACCAACAATTTTCCACTCACATTTCTTAACACACGCATTCAAAAAG
GCCATCTATGAACACAACATGTGAAACGAAATCTAATAAGATACTCGCACTATATATACACACACACATATATGTATGGATCTACTGATAACTTTAAATA
TCAACAGGCTACATCAAATATCATATGTACATTTACACCTAAAAACTAACGAATTTGCTGTTTTTAGGTCCAAATCAACCCATGGCTTATCAAACCTCTC
TTCAATAACTTGACTGTCAACCGTAGGGATAATAGTGCTGAGAGGGAAAAAAGAGACAAATCCGTAAGCCCAAAATTGTTCAAATGATATGTACAGCGAT
TGGAGCTAACGAAGCTAAAGGGTAAGTTAATAACTATTCGCTGGCAAATTGAACCCAAGCATAGACGAAAGTAGGATTTCACGCCCTCACCTTGATGATG
ACAAGACAATCATTCAAAAGGACGATTTAGAGGCAAAAGATGGTTATAATGGAAGGATCTGTAGTCTTCTCCACCATTAATATCGGTCATGCACTGCCCG
AGATGCAAAAATGTTTCGCGACATTACAGCAATTCGCTGCTCACATGGCCTCTTAACCATTAGTACAAGCTCGAGAGCGTGAACAAAGATTAAATTTAGC
GTATAAGCAGCGAACAGCCGGGATGTCTTGAACGCCATGAGAATAGTGATTAGAGCTGTTTGCGTTTCGTGCTTTTTATAGCGAGAGGATTTGGTCGCAG
AGCTAGAGTGAAAACTTTGACAATTTGTAGATGTGGACAAGTCATTTACTTCCTGATTCGAGCAAATCCCGCATTTAAACCAGGTAAAAAAAAATTGCAA
TAAGTATAAGATTAATAGCTTACCTTTCCGTGATATGTAGTGTGATTTGTCGAGTAATGGCTTCATATATGAGCAAAACCACCATTTACGGTATATGTCA
ACAAATTAGCTAAATATATGGGTCGCATTTATGCACTTGAGTTTCCATGATATGTAGTACGATTTGTTGCATAATGGTATCATATGAATTCGGGCCCGTT
CAGTGACACGAAATAAGGACAAGAAATGATATTTGAGAATTTTCTTACCTATGCCTATAATTTTCATGAAAATTTGTAAATTATATTTTAAGTTATATCT
CCTCCTTTTTCATTAGAGTAGCATAAATAATACATTAGGTCTATGAAATGTTGCTATCTAGATCCACCATAAAAAAAGCATTATTTAAATTTCTAATCAC
ATCTATTATAATTACTAATCTTCTTAAGCTGATAAAATCAGTC