« Back to Eucalyptus grandis search


Detailed information on CNT30532219


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|P0CG85|UBI1P_NICSY, E-value = 0.0

BLAST vs NONCODE:
NONMEST001181, E-value = 0.0

Expression of CNT30532219

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (40 aa)
MVSELSTSRVMVLPVRVFTKICMPPLRRSTKWSVDSFWML*

>peptide 2 (50 aa)
MPSLSWIFAFTLSMVSELSTSKVMVFPVRVLTKICIPPRRRRTRWRVDSF*

>peptide 3 (48 aa)
MECGLLLNVIISQGAPILELLACKDEPLLVWGNPLLVLDLGLYIVDCV*

>peptide 4 (48 aa)
MECGLLLDVIISQGASILKLLPSKDEPLLVWGDSLLILNLGLNIVNCV*

>peptide 5 (31 aa)
MVSELSTSKVIVFPVRVLTKICIPPLKRRTK*

>peptide 6 (31 aa)
MVSELSTSKVIVLPVRVFTKICMPPLRRRTK*

>peptide 7 (37 aa)
MSLCWSGGIPSLSWILAFTLSIVSELSTSRVIVLPVRV

Sequence

>CNT30532219
CAATCCATCAGAAGACATCATAACTTTAAAATGGCCAACCAACCTAATAGACAGAAAAACTTGACTTCATGAAAAACCCTTCGGTGACATGAAAACTCAG
AAACCACCACGGAGACGGAGGACCAAGTGCAGAGTCGACTCTTTCTGGATGTTATAGTCAGCCAGAGTCCTCCCGTCTTCGAGTTGCTTCCCCGCAAAAA
TCAGCCTCTGCTGATCTGGCGGGATGCCTTCCTTATCCTGGATCTTTGCCTTCACGTTGTCGATGGTGTCTGAACTCTCCACCTCCAAAGTGATGGTCTT
TCCGGTCAGGGTCTTGACAAAGATCTGCATCCCACCACGCAGACGAAGGACGAGATGGAGAGTTGACTCCTTTTGAATATTGTAATCAGCCAGTGTCCTG
CCATCCTCAAGTTGCTTCCCTGCAAAAATCAACCGCTGTTGGTCTGGGGGGATTCCCTCCTTGTCCTGTATCTTTGCTTTGACATTATCGATCGTGTCAG
AGCTCTCCACCTCCAAGGTGATAGTCTTGCCAGTAAGGGTCTTTACAAAAATCTGCATGCCTCCCCTAAGACGCAGAACCAAGTGAAGAGTCGATTCTTT
CTGGATGTTATAATCTGCCAGAGTCCTGCCATCTTCTAGCTGCTTCCCAGCAAAAATGAGCCTCTGCTGATCTGGGGGAATGCCTTCCTTGTCCTGAATT
TTCGCTTTGACATTGTCGATGGTGTCAGAGCTCTCAACTTCCAAAGTGATAGTCTTGCCGGTAAGGGTCTTCACAAAAATCTGCATGCCTCCCCTCAGAC
GCAGAACCAAGTGAAGAGTCGACTCTTTCTGGATGTTATAATCTGCCAGAGTCCTACCATCCTCTAGCTGTTTCCCAGCAAAAATAAGCCTCTGCTGATC
CGGGGGAATGCCTTCCTTGTCCTGAATTTTCGCTTTGACATTGTCGATGGTATCAGAGCTCTCCACTTCCAAAGTGATTGTCTTTCCAGTAAGGGTCTTG
ACAAAGATTTGCATTCCTCCTCTCAAACGTAGGACCAAGTGAAGGGTGGATTCCTTCTGGATGTTGTAGTCTGCAAGCGTCCGGCCATCCTCAAGTTGCT
TGCCAGCAAAGATCAACCGCTGCTGGTCTGGGGGAATCCCTTCTTTGTCCTGAATTTTGGCCTTCACATTGTCAATGGTATCAGAACTCTCCACCTCAAG
AGTAATGGTCTTGCCAGTGAGGGTCTTCACAAAGATCTGCATGCCACCTCTCAGACGAAGCACCAAATGGAGTGTGGACTCCTTCTGGATGTTATAATCA
GCCAAGGTGCGTCCATCCTCAAGCTGCTTCCCAGCAAAGATGAGCCTCTGCTGGTCTGGGGGGATTCCCTCCTTATCTTGAATCTTGGCCTTAACATTGT
CAATTGTGTCTGAGCTTTCGACCTCAAGGGTAATGGTCTTGCCAGTGAGGGTCTTCACAAAGATCTGCATGCCACCTCTCAGACGAAGCACCAAATGGAG
TGTGGACTCCTTCTGAATGTTATAATCAGCCAGGGTGCGCCCATCCTCGAGCTGCTTGCCTGCAAAGATGAGCCTTTGCTGGTCTGGGGGAATCCCCTCC
TTGTCTTGGATCTTGGCCTTTACATTGTCGATTGTGTCTGAACTCTCAACCTCTAGGGTGATAGTCTTGCCAGTAAGAGTTT