Detailed information on CNT30521305


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30471944Setaria italicaSaccharum spontaneum4.738.2489.14221forward
CNT3017620Setaria italicaZea mays1.1323.2594.3453forward
CNT30339781Setaria italicaEragrostis tef4.8357.4786.34227forward

Expression of CNT30521305

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (32 aa)
MPHGLTSPGDALGAAPRVSHSQVVKITGMLFA*

>peptide 2 (41 aa)
MCTSFDVCCLLARMFECVDTVQQLMKLFIVTSRAYGLSLKV*

>peptide 3 (90 aa)
MVARSIAPGRPFRPAYPVRQPEGDDFALPILVGGVGPALLRQRLRSPPTKHRLVDRCRHRAHSCGFVTATRRYGVAPRGCLTGSHHPVML*

>peptide 4 (73 aa)
RALISATAAPHRKRSGGNARSPPRPPPPPRYSSSRVAGDRFGLRLSERLVCALPSSPLPPSLCARVVPIRRRI*

>peptide 5 (29 aa)
MCVQMHERGWIPPDRMLQKKTLYICGYSH*

>peptide 6 (42 aa)
AHSSAPPPRRTESEAGGMRDRLRAHPLLPATPPPVSPAIDSA*

>peptide 7 (43 aa)
MTQLNHWESSYFPMSVSCISLVVCLGQRRFQLYYLLLLLLSAL*

>peptide 8 (29 aa)
MKEGGYHQIVCCKKKPSIFVDIPTNLLII*

>peptide 9 (31 aa)
MLLSRNISYALSWWFPATCIALYFLLKKVLI*

>peptide 10 (30 aa)
MRHESKGLAVELGKRTIRKEVLTDYRIWMG*

>peptide 11 (34 aa)
MIRIVTASICAHVTADTRRQLNKCATNQKDLQLS*

>peptide 12 (69 aa)
RTHQRHRRAAPKAKRGECAIASAPTPSSPLLLLPCRRRSIRPEAERAIGMCSPLLPTSPFSVRARGADS*

>peptide 13 (63 aa)
MFVFQDGEHLPFVYLWQLAGWLAILIRNCYFSSPTRSTLQALNVSANWLRIGLPIIAKIIAQL*

>peptide 14 (39 aa)
MSFSPGRALLLLCCYFHVLLFLLLFHTSFLLSVQLTCSF*

>peptide 15 (54 aa)
MQIVSPSLAPHLSPHIQYVIYCSRPLLTTSSPVLYLTNKPNSCYRQVKFCYLKN*

>peptide 16 (58 aa)
MMMLGGCQCTTVGNVETAYYNVTKCLFHLEEHCCSSVAIFMSCYFYFSFILLFCFLFN*

>peptide 17 (47 aa)
MVTHCVTSLWGKSPGQSSQLGSGGKRGGTICSYSRTESIFLLFISGS*

>peptide 18 (51 aa)
MWVRWNGLIDWQKVEVQLVDGRLARVRTPSDRPATFAADRSSGRSIRERAT*

>peptide 19 (35 aa)
MIPVCRTGMCCFVYELIAHFYLNTDLVDCDVRSNA*

>peptide 20 (37 aa)
MQLLPFYVFNLDGKGFNLQSIKAPFGYYYCFLVFVGL*

Sequence

>CNT30521305
CGCGCACTCATCAGCGCCACCGCCGCGCCGCACCGAAAGCGAAGCGGGGGGAATGCGCGATCGCCTCCGCGCCCACCCCCTCCTCCCCGCTACTCCTCCT
CCCGTGTCGCCGGCGATCGATTCGGCCTGAGGCTGAGCGAGCGATTGGTATGTGCTCTCCCCTCCTCCCCACTTCCCCCTTCTCTGTGCGCGCGCGTGGT
GCCGATTCGTAGACGCATTTAGAAATCCCCAACCCAACCGATGGTGGCGCGCAGCATTGCGCCGGGGCGGCCGTTTCGACCCGCCTACCCGGTTCGCCAA
CCGGAGGGAGACGATTTCGCGTTGCCCATTTTAGTGGGCGGGGTCGGTCCCGCATTGCTGCGGCAGCGGCTTCGCTCACCGCCGACGAAGCATCGATTGG
TTGATCGCTGCAGGCATCGCGCTCATTCCTGCGGTTTTGTTACAGCCACACGTAGATATGGTGTAGCACCGCGCGGATGCCTCACGGGCTCACATCACCC
GGTGATGCTTTAGGTGCCGCTCCCCGGGTGTCGCATTCCCAGGTCGTCAAAATCACCGGAATGTTGTTTGCGTGATTTCCGTGCAACATGTTGTACTCGC
TGATCAAATCCTGAAAGCTTCGCATATGGACTTATGCCTGTTCGATTTTAGCAATGAACCCAGCTTGTAGTGCCATGGCGTCTAGGTCTGCAGCTCATTG
ATACATTTTTCAGACCAGGCCATCTGCTGTACTGGACAGCTATAAAACACCCTGTATAGAACGCTACTCACCAAGTCAAAACTGATTGATGTTATGTCTG
AGAAGTGAAGGCTGAATTTTATTCTCCTGGATTGTAGTTTATACTATCCTAACAGGAACATTGTGTTACTACATCCTTGTGATTGAATTGTAGTTAGCAT
GCAAATTGTGTCACCTTCCCTAGCACCTCACCTGTCTCCACACATTCAGTATGTAATTTATTGTTCCAGGCCATTGCTCACAACATCAAGCCCTGTCTTA
TATCTGACAAACAAACCAAATAGTTGCTATAGACAAGTAAAATTTTGTTACTTGAAAAACTAAAGAATTCTCCCGAGCAGATGTAGAGACAGGGCTTGGG
CTGCCAGGGCTTCAGCCTGTAGCCTAGGTCCAAAATTCCATGGAAGCCTACTTTATGGAATTTAGGGGGGCAACAAGGGTACAAAGACTCTGATTCAGCT
CCTTGCTCAGCCCATACTTTTGCTTCTCCTCTGCTTCCTAAAGGAACAGGGCCCAATAAAATTACCTGCAGTTGTGACGTGTACATGTGATTTGATACTA
TCATCTACTTTTACATGGCAAAAATCCAAATACCTTAATGCTCTCTGGGACCCATCTGTGTATCACAAAGACTTACCACCTCTTTGCTGGCACAGTAATT
GCTAAGTCAGTATAACATTTTTCTCCACTGTGCATATGATTGCAGCTGATTGGATCGCCTAAACAAGCAAAGCAGAAATTCAATGGCCACTGTTTCAGCC
CTTACTAGTTACTACTGATCTTATTTCAAATACATTGTGTGATTAGAAACTAGCTGATTTGATTATGAATATCCATCTCTTTCTCTAAGTCAAATCTCTG
AAGCCATACTGATCCAATCAGATTTTACAGATGCTCAGGATGTTTATTGCTGTGGATGCACGATATCTGCTTCATTAGAACATCTCCTGGATGAATTTAT
TTGTTAGGTTCAACTATAAACTACAGATTTTGTTCAGAATTGGTGTGACCTTGCATTTCAATTACCATTATTAATTAGCTAAAAACCCTCAATAGAAGGC
TGTGCAAGCCTGCGGAACACCTTTTTTTTCCAGTATGCAGTTGCTTCCATTCTATGTATTCAACCTTGATGGAAAAGGATTTAACTTACAAAGCATAAAA
GCACCATTTGGCTACTACTATTGCTTCTTAGTTTTTGTTGGATTATGATTCCAGTTTGCAGAACGGGAATGTGTTGTTTCGTTTATGAACTTATTGCACA
TTTTTACCTCAATACAGACCTAGTGGACTGTGATGTGCGTTCAAATGCATGAAAGAGGGTGGATACCACCAGATCGTATGCTGCAAAAAAAAACCCTCTA
TATTTGTGGATATTCCCACTAACCTTTTGATCATCTGAATATGTAATTTAATCTAGCAATCAGATACATATTCTGATAAGTGATAATATTGTTTTTCATT
TGATACTCCTGTTTGGGTTTATCATTTTTCATACTGTGTTTGATAGGATAGCATATATCAATGACACAGTTAAATCATTGGGAATCTTCATATTTTCCCA
TGTCTGTATCTTGCATTTCATTGGTAGTCTGCCTTGGCCAAAGGCGCTTCCAACTATATTATCTGCTTCTTTTGCTCCTTTCCGCCTTATAGCTTTAGGT
CATCCCTTTTGATTTAGTGGACCTAATTCAAATTCAGTGGCAGAAACATAATTTCTCTTTTTAATAACATCAATTTAGCTCTTGAAATTTAGGTGCTCTC
CCTCTCCCTGGTTATTACTGTGATTCATGTGACCATGGTAACGACTTAATTGTTGTGGGCTCCACAAGTACTTATGTACTATGGAGAGATTGCTACTTAC
ATAGTTGCTGATCTTGCAGGTAATTGTTGAAATGTGTACGAGCTTTGACGTCTGTTGCCTGTTGGCACGCATGTTTGAGTGTGTGGACACAGTTCAACAA
TTGATGAAACTATTTATAGTCACATCTCGTGCATACGGCCTGTCTCTAAAGGTGTAAAGGGCTAATGGTGTACTTTTTGAGTGTTAAAAGTAATAGAACT
TAATTCGACAGCTGCAGGCCCAACATTGAGTACCTTCTTGCTTACAAATGCTTTCCAAGTATGGTTTCATATGTTTATCATCATGCTGATGTCATATAGA
GGCAACAAACTTTCAGAATGTTATTAAGCAGGAATATATCTTATGCCTTGTCTTGGTGGTTTCCTGCTACCTGTATAGCACTTTATTTTCTTCTAAAAAA
GGTTCTCATATGATTTTGAATTGTTTACTTTGCCTTATGTTCACATTTTCAGCTAACTAAAGCAGTTTTATCCAAATGAATTTTTAATTAAGAAAAAATG
ATTCAATTGTGTTATGGATTGTGCCAGATGGAATCACTGAACTATTACTTTTTTTCCGCTATTCCATTGGACCACTAATTAGCATCAACCTATGATACCC
TAGATTCTAACTCATGTTTATGTGGTTTGATTAATTTTTTGATATTGTTCCACTTTTCTGTTATCTTCCACTCACTAATGATGATGTTAGGTGGATGCCA
GTGTACTACTGTTGGCAATGTTGAGACTGCATATTACAATGTAACTAAATGTCTTTTTCACCTGGAAGAGCACTGCTGCTCCTCTGTTGCTATTTTCATG
TCTTGCTATTTCTACTTCTCTTTCATACTTCTTTTTTGCTTTCTGTTCAACTGACATGTTCATTTTGAGACACCCAGATACATCCAATAATGCAGCTTAT
TTGTCCGAGTAGACACAGGATACAAACAAAAATAATTGAAGTGCATATACCCATAAGTTGATACATCATGGTAACTCACTGTGTCACTTCTCTCTGGGGA
AAAAGCCCTGGTCAATCATCACAGTTGGGGTCCGGGGGGAAAAGAGGTGGCACCATATGTTCGTATTCCAGGACGGAGAGCATCTTCCTTTTGTTTATCT
CTGGCAGCTAGCAGGCTGGCTAGCAATTCTAATCAGAAATTGTTACTTCTCCAGTCCAACAAGAAGCACGTTGCAGGCTCTGAATGTGTCCGCAAATTGG
TTAAGAATTGGGCTTCCCATAATTGCAAAGATAATCGCACAGCTTTGAATACAAAAAGGGTCCAGTGCAGGAGACAAATTTCTTGGAGCATAGTATTGGA
AACGAGCTGGTCAATGCACATATTATTGTTGGTATCCTTTTCTTGTCTGACGAAAGAGCGTTTTTATCCATGATTCCATGATTAGGATTGTAACGGCATC
CATCTGTGCCCATGTGACGGCGGATACTCGTCGCCAATTAAACAAATGCGCCACGAATCAAAAGGACTTGCAGTTGAGCTAGGAAAAAGGACCATCAGGA
AAGAAGTGCTCACTGACTACAGAATCTGGATGGGATGACCCTAATCAGAAGGAGGCGGCATTATTTTGAGTGGTGATAAGAGAAGGGAAGGCTGGCGGCA
GCAGCATGGCAATTAGCAAGGCTGGCACTAGAAGATCACGGGGAAGGCAAGTTTGACAAAGGAGGCATCTTTTCTGGGGTCCCCAGGAAGCATAGGCCCA
CCCCTCCCTAATCCCTACGGTGCACACGATACTTGAGCATGTGGGTGAGATGGAACGGACTCATTGATTGGCAAAAGGTCGAGGTGCAACTCGTGGACGG
CCGGCTTGCTCGGGTCAGAACACCATCGGATCGTCCAGCGACTTTTGCAGCCGACAGATCAAGTGGCCGATCGATTAGAGAGAGAGCGACGTAGTGATGA
ATTGATCAACTAGCGTGCCTGTGAAAATCACACCGAGATCTCCCAACTATCTAGCTCTGTCCTTTACCTTCCTAATGTGGTACAATTTGGCATAAAGTAT
TACTACCATCTCGCCGGATTTTTATGTTAAAAAAAGAGAGAGAAGAAGCCGATTAACTGGTGGCGAAACGTACGATCGATACGTGCCGCTCTCTGGACCT
CGTC