Detailed information on CNT30514234


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9LHJ8|SAP5_ARATH, E-value = 2e-53

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30672179Juglans regiaSetaria viridis3.1625.684.8886forward
CNT30533125Juglans regiaEucalyptus grandis4.7424.8182.17129forward
CNT30572839Juglans regiaVitis vinifera5.1856.485.11141forward

Expression of CNT30514234

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (29 aa)
MTKSPQTIRPICIRLPAGTWKSSPNKTDL*

>peptide 2 (64 aa)
QAFHVTRRTYTDAHATTQTQVGPPLSYLLSPRHNLVMLLCTKFAPRLLDSDQALLPTHLLPFRV*

>peptide 3 (79 aa)
AGFSCHSKDIHGCPRHNTDSGGSSSLLSLITTPQLGYAIMHQVCTTAVGFRSGVAPHPFASLSSLTSNRIWCLVMSYTL*

>peptide 4 (47 aa)
MAVCVPVLGAEQLSAAASEPGQPDLPSAPRAPIYLRSRSIQRRRRCF*

>peptide 5 (55 aa)
MNKLQPAYSQRLQLVLPFSFQPHTRPIPIRPDRFQLAYRQPNSSRENNEIITTNT*

>peptide 6 (38 aa)
MSRASFTFLHLLYISRSLRWCLIILPLFNERKSDKIKS*

>peptide 7 (43 aa)
MTSLFSLSSFLSSPLSPQDKNPKSPLPQSTKTRAIGCEESSRV*

>peptide 8 (33 aa)
MLLVAGFPVTPQLLTQRGMVSGTLNSVSSFSVF*

>peptide 9 (34 aa)
MSPVYTLYVIKGREGEMGLFWLAFIFSSFFKMQW*

>peptide 10 (90 aa)
GRLFMSLEGHTRMPTPQHRLRWVLLSLISYHHATTWLCYYAPSLHHGCWIQIRRCSPPICFPFEFNFKPDMVFSYVLHPLIISRHVVDLR*

Sequence

>CNT30514234
GGCAGGCTTTTCATGTCACTCGAAGGACATACACGGATGCCCACGCCACAACACAGACTCAGGTGGGTCCTCCTCTCTCTTATCTCTTATCACCACGCCA
CAACTTGGTTATGCTATTATGCACCAAGTTTGCACCACGGCTGTTGGATTCAGATCAGGCGTTGCTCCCCACCCATTTGCTTCCCTTTCGAGTTTAACTT
CAAACCGGATATGGTGTTTAGTTATGTCTTACACCCTTTAATTATAAGCCGACACGTAGTCGATTTACGTTAAAATAAGTGGGTGCGACTGTTGAGAATG
ACATCTCTCTTTTCCCTTTCAAGTTTCCTCTCCTCTCCTCTCTCCCCTCAAGACAAGAACCCGAAAAGCCCTCTCCCTCAGTCGACAAAGACCAGAGCCA
TAGGCTGCGAGGAATCGTCTAGAGTGTGAGGAGCGTAAAGGCAGGAGTTGATGTCAAGAGCTAGCTTCACTTTCCTCCATCTGCTCTACATTTCTCGCTC
TCTGAGATGGTGTCTAATAATACTTCCTCTCTTCAATGAGAGAAAAAGTGATAAAATCAAATCATAGGAATACAAAACTCGAAATGAGTATTTGCCAAAG
ATTTCAAAGATTATGAGCCCAGTTTACACGCTTTATGTTATAAAGGGTAGAGAAGGAGAGATGGGTTTGTTTTGGCTGGCATTTATTTTTTCATCCTTTT
TTAAGATGCAATGGTGAATAGAAAGAAGCGGTCAAATTTGAGAGCAACCTTTTCTTCTTGAAATCTTTGGTTTTTGCTTCTTTGATTAGCTATGGTGGAT
TAGAACTAGACCTTTTTTATTCGTAGGGTAGAGAGAGAAGAGAGAGAGAGATTGACAGGAGAGGAAAAACAGGGGAGAAATAGAAATTGGGAGAGGAGGG
ATGCAACTTTTTGTTATCTACAGCCAATTCTATTTTTTATTTGCTAGAATCTATACGTGTCACACAATTATTGGATGGTGTAAATAAGCTATACTCACCT
CGTCCGGCTCCTAGGGGTCTCATTCCTTTTATTGAATGATTAGTAATATCCTTGTATTTTTTATTGCTTTTTTATAATCTAACTATTTTTTTTCTTTTAA
ATATGAATTAAAAATTTTAAAACATGAATTTTCTACATAATCAAAATAAATTTAATTTTATAAAAATTAACATTCTTTATTATTTGATTCCATATTTTTA
ATTAAATTATATCATTATATTAATTGATTAATTTTTTTTTTATAGATTATAAAAAAATTATACGATTTTTAGTTCAAATTAAAAAAAACTAAATAGTAAA
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AGATCGGTTCCAATTAGCATACCGACAACCAAATTCCTCGCGAGAAAATAATGAAATTATCACGACAAATACATAATTACATCCCGACCGTCCGTCCACC
CACCACGACCTATCGGATTTACCGGGTCCGATAGAGCTTAAATGACCAAAAGCCCCCAAACAATTCGTCCAATTTGCATACGCTTGCCCGCTGGAACTTG
GAAGAGCTCGCCCAACAAAACAGATCTTTAAAAATTAAAATGACGGGAAATACGAAGTTTTAAAACAAAAATTGAATATGCGAACCCGACGATCGCCATA
AGCCACGTTAATCTTCCATTTCCAACCAAAACCAAAATACCAAAAAAAAATTAAAAACAGAAACAGAAAATAAAAAATAAAAAAATAAATAAGATCATTG
GAGATTGATCCAGAACACGAACAATCAGAGAGAATTTGATCTTCTACTACAACAATCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAAGGTTGATAGAGATTCCCCGT
CTCTGTGAAATTCCCAATCATTGACTTTCATTTTTAAGATTTTTTTTAATTCTACAAACTAATCAGACTCTGACAATTTTGGCTGCCCTGACAACGGGAT
TCTCTCTAGCTATGGCTTCGCGCCCGGCGGACTTGTAGTCGTAGCTGCATACATGGCGGTCTGTGTACCGGTGCTCGGCGCAGAACAGCTCTCCGCAGCG
GCATCGGAACCCGGTCAACCCGACCTTCCTTCTGCACCCAGAGCACCGATTTACCTCCGATCTCGGTCGATCCAACGAAGACGGCGTTGTTTTTAAGTCC
TTGATCGTCTCTGCCGATCGCGACGAGTTGGATCTATGAATCCTCTGCGGCAATTTGTTAGACGAAGACGATGAAGACAACGTCGTAGCCATTGCTGTTG
GGGTGGTGGTGGCGCTGAAGCACTTCTGGCACATGTTGTTGGTGGCTGGGTTCCCCGTGACGCCGCAGTTGTTGACGCAAAGAGGTATGGTCTCTGGAAC
CTTAAACTCCGTCTCTTCCTTCTCTGTTTTCTGAGCCATTTTTTCTCCTTTTTGCAGGTTTCTCGACGGATACTGTAATCGAGGGAATTCGGAGAGAGAG
AAGAGACTCGTAAAGGTTGGGTTCGTTTGGTGGGCGATCGAGAGAGAGACGGGGGATTTGAAGGGATCGAGAGGTCGGTAATGGCAATGGAATATGGGCC
TCAGAGAGACGCGTATGATCTCATTTTTTGGTTTTATTGAAATGACGAGAATAGCCTCCAATTGTTTTTTTTGGTAGATCAGGCTAACGTTCTCTATAAT
TACATATCTTTAAATATTTTTAAG