« Back to Solanum lycopersicum search


Detailed information on CNT30510970


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONSLYT002947, E-value = 0.0

Expression of CNT30510970

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (35 aa)
MTIDNGLSSDSYTMQSSIQSKKLFLQILVILYQFI*

>peptide 2 (34 aa)
MKYITLILQNKICLNIINRTFRTVNDSNYNSLKI*

>peptide 3 (61 aa)
MVSLLILTQCNHQSKVRNCFFKSWLYCINLYDIIRLKRISIFFLNISICKYWFAHYCLKLG*

>peptide 4 (35 aa)
MCNIHYYILYISLIFFFFIFFVQHKLQKLNINKLT*

>peptide 5 (29 aa)
ERSDRKYLLYIILFYIYVKNYFHESTPYL*

Sequence

>CNT30510970
GAAAGATCAGACCGTAAATATCTATTGTATATTATCTTATTTTATATTTATGTAAAAAATTATTTTCACGAATCGACACCATATTTATAAAGAAGAAAAC
AATTACCTAACTTAGATGCTAGTGAAGTAGATAGGGATGATATATACTTTTTATATAAATATATATAATATATATATCTAACAATAATAAAGTAAATGGT
CCCAACCACCAACAATTTGATGTCTCAAAATCTTAATAAAATTGACCTCACTAATTAATGTGCAATATCCACTATTATATTCTATATATTTCCCTCATCT
TCTTCTTCTTCATTTTCTTTGTACAACACAAATTACAAAAGTTAAATATAAACAAATTGACTTGAAATTCCATCTACTTCAATAGCCACAACAATCAAAG
GTATTTCTTTCAAATTCTACTTGCGTATGGAAATGTAGTGACTGGTGAATCGCTTTTTCTTTAGTAAAAAGTCAGATAAAATCGAGTTTGAATGAAACTG
AATAAGAGTTGATAAACGAAATATATGTGAAGTATGAAATTGTTTCCATGACAATTGACAATGGTCTCTCTTCTGATTCTTACACAATGCAATCATCAAT
CCAAAGTAAGAAATTGTTTCTTCAAATCTTGGTTATACTGTATCAATTTATATGACATAATTCGGTTAAAAAGAATTAGTATATTTTTTTTAAATATTAG
TATTTGCAAATATTGGTTTGCTCATTATTGTTTAAAATTAGGATGAAATGTAATAATAAAATCTGAGAATTAAGTATTTCTGTTTTTTCTTTTTACCATT
TTTTGGAAGTTGGAATTTTTTTGCTTCTTAACAATACCTAAGTTTGATTTATGATAAATATTTGTTCATATCGGATATGGATTATATAAAATTATTTAAA
CACGATAGTTAAGTGACACAATGAAATGAAAATGAACAATACATATTTATTTGTTTAATGTAAATATTGAACGCGAATAAATATTTAATGCCTGATTTTC
AAATTAAACTTGTACTTAGATTTTGATAATATCTTATTATATTTTCTTCCTTTGTGAATGCTACAAGTACCAACTACTATCAAACATTAAAGAATATTGA
AAATTCAATCTCTTAATACCTTTGTGTTGATTAATGACTTGAGTGTCTTATTTTGAATGTTAAATTAGATTCTTATCAAAGTCATTTGTTAGAATACAAA
TTCCTTTTTTCCTTTGACCCTTTCAATCTCTTTTTTTTTGTTTTAAACTTTATATACATGTTTCATAGTCAACAAACAACAGTGTAAAAAGTGTGATATA
ATGCAGGTATGCAATAATTGTTACCAGTAGTACCTAGTTAGTCATAAAATAACAACAAAAAATGAGTATTGAAATCATTTCTAAATTCGAACATATAAAT
TAATATTTTTATTTTTAAATTATCAACATTTTTAAAAATATCACTCTGTTTAATTACTTAAGTTCTGATACAACCCTAATCTGTCACATGATATCAGAGA
GTTATCTCAAATTATTGTACGAGCATGTAACTCTTAATGAAAAATTAAAAGAAATATTATAAATATCATTAAATTTCTAAAAAATTATGAAATATATTAC
ACTCATATTGCAAAATAAAATATGTTTAAATATAATTAATCGAACATTTAGAACTGTCAATGATTCGAATTATAATTCGCTTAAAATTTAAAAATATTTT
CAATACTCGCCCGATAGTAAACATGTGGTAAGAGAAAGGAAGTTGCCAAGGATTTTTGGGATGTAGGACCCAAAAGTTGTATGAATATTGTCTGTATATC
AGACAACATGATTCAACAGAATTGCAGAAAATAGAGAAAATTTGTTCCCCAAAAAGTACAAAAGGGTAAAAACAGAAAAAAGTTACTGTTTGGTCCAATG
AAATCCAACTTTCCTTTACCTTTTATTTTATTTTTATCTAATATCATAGATTAAAAAACAGATATTTAAATTGATATAAAATTTAACATAAAATAAATAT
TTAAATTTATATAAAATTTGACATCGAGGATTTTGTGACAAGGCAAGTCTTCATCTATCTATTCATACTTCTGGCGATTGCGAAAATTTACGATCAAGTT
TTAATGCGTGGTTTACTTTTGCAAAATTTATTTTGATTGGATTTTAAATTTAAATAGTGACACTGAAACACCTTATTTATGCAAAGTCAATGTTTTCTTT
TTATTTTATATTGACAAAATTATATAAATTGATAAATTTTGATAAATAATTATTAATTTTAGTGATACTTTTATTTATTACCATTTATAACAATACTATG
TTAAATCTGCAATATGTATTAGAAGTGAATTATGTATGCAATATATATGAATTATAATTGTTTTTTGAAATATATTATGTTTGTTTGGTAAAAATTTGAC
ATATTGTATTAAAATGTTTGATAAATGTATTATCCATTATTAAAGCTTGTATTATATGTGAATAATAAATTGTTCTTTGTAATACATACTAAACTTGTAT
TATAAATGAATTAAAAGCGATCAAGAAAAAAAATATTATTGCTATAAATAATAAATATTTTTTTATTATGATGTATTTTTGTAAGTTTCCCTTTTTTATT
AGGTGATTGATATCTGCATAGGAGCCTGATTAAATTTAAATTCAAAAAAGTCTAGAGTAAAACATTTTCTAATAAAGATACTTTATATTTAGGAGATTCA
AATCCAAAATCTTTGATTAATAATAACAGAATACTTACTATTTCGCTCTATAAAATTCAAATTCTCAAACCCACCGATACACGTAATTGTGGCCCCTACA
CTATTTGGCCCAAAAGTGAAATGGATTTTCATAATCGGGCCCCATGGCCCATAAAACCTATTCTTCTGTGACTTTTGACTTTCAACTCTCATAAAAATAG
CAAAATATAATAAAAAGAAAAAAAAAGAATAAAAAGTAATTAATTTTTATTCCTATTAAGTATCTTAAAAGAAAGAAGCTAAGTTTTTAATATCATAAAA
CTCGTGTATTAATTAAATAAGGATAATTTTGAAAGAATAAAAACAATTTCTTTTTTAAAATTTTAATACACAACTTATTGAAAATTACAAAAAAAAAATC
TAAAACATCACTTATTTTAAAACATTAACTAAGGTCATATATTTGCATTCTTTTATCATGTAGTTAGTGAGTATTTAAGTAGAAAAGTAGGACAAATTAA
AGGACATTTAATTTACTTGCCTAACCAATAAAATATGGATGGACCATCCACTTATGACCTAACTAAGGATTTTTTTAAATTTTATATTTCACTTTTTTAA
GTGTGGCCAAATATTTGGACCACACACATATATATAATGATTATAATAAGTAGACGGATGAAGATTATTACTATAGGTAGAATGAAAGACCATTAATTAT
AAGTTTGAGTACCAAAACTTACTAAAGTGACACTTACCCTTTTGACAATTTCACTAATCATGTTTTATAGTTTGACATATTAATCCAATAAAATCAAAAT
ATTACTTACTCAATTTGCCCGTCCT