Detailed information on CNT30510437


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q94HW2|POLR1_ARATH, E-value = 2e-46

BLAST vs NONCODE:
NONSTUT001419, E-value = 0.0

Expression of CNT30510437

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (30 aa)
MRGSISSGKYTLLKCNWLARIRQLKSRNKV*

>peptide 2 (60 aa)
MTIICGSHKLTYNTHAKRDVRSSHDEIIQFTNQPPIPSMITKWLHLLWREFSIRIYMSVN*

>peptide 3 (60 aa)
FNCTMLTVMLLTHILIQMRKVQPVRLGICLEHTQPCSNKTWIEFLSFNSMQKLEQLFPSC*

>peptide 4 (69 aa)
MYCCYLTKKIKFTFWCLVQISSTATSQKPFQYYYINLSKSAQHYFDIIISTSQIPELDFIVRTLYNIFC*

>peptide 5 (80 aa)
VQLHHVNSHAAYSYTDTDEESSASTIGDLPRTYSTLQQQNVDRISVFQQYAKAGTTVSFLLAYTVLVLYGCRSSVCDGNA*

>peptide 6 (33 aa)
MLKKMFQTSNTFLIIARDNNIVNIDHQINTQSW*

>peptide 7 (34 aa)
MSNSKITTEFTKPSSRRLFQTIPRNQHTRLLGSA*

>peptide 8 (36 aa)
MLKDNKKPRNKWNLCIYTPTNIKKSLVIRLLPLFPR*

>peptide 9 (47 aa)
MIYMNSHYYSYIYFLHSPFAVFTHLLLNILKSHKRSNLLHYAKSFFF*

>peptide 10 (83 aa)
MEKFSMIVVSFLTWLTIFLPHLYFDDLHELTLLFLYLLFTFPFRSIYSLIIEHFEVPQTVKSSALCKIFFFLNKDNVKCIVVI*

Sequence

>CNT30510437
GTTCAATTGCACCATGTTAACAGTCATGCTGCTTACTCATATACTGATACAGATGAGGAAAGTTCAGCCAGTACGATTGGGGATTTGCCTAGAACATACT
CAACCCTGCAGCAACAAAACGTGGATAGAATTTCTGTCTTTCAACAGTATGCAAAAGCTGGAACAACTGTTTCCTTCTTGCTAGCCTACACAGTTCTGGT
ACTGTACGGATGCCGCTCTTCTGTTTGTGATGGTAACGCATAGTTGGACACACAAGTGAACTGGTAAAGCTCCCATTAATTCCTGAATTATTAACAAATA
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TTTCAAGCACTGCAACAAGTCAAAAACCATTTCAATATTATTATATCAACTTATCAAAGTCCGCGCAACACTATTTTGATATCATTATATCAACTTCTCA
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TTAGAATGTCTATCAGAGGGTGATATTGCCCAATCAGCGTCTATATATCCAATGATATGCTCATAGCCTTGATTCTCGAAGAGTAATCCTTTACTTAGAG
CTGACTTTATATATCTTAAAATGTGAATTGCATCTCAATGACTATTATATGTGGAAGTCATAAACTGACTTACAACACTCATGCCAAAAGAGATGTCAGG
TCTAGTCACGATGAGATAATTCAATTTACCAACCAGCCACCTATACCTTCCATGATCACTAAGTGGCTTCACCTATTGTGGCGAGAGTTTAGCATTCGGA
TCTATATGAGTGTCAATTGAGCTACTACCATCATTTTTGTCTCCTTGAGAATGTCTAAGTCATATTTGCGTTTAGACATAACAATACCTAATTTAGACTG
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CCTAGCAACAAAACTAAGTGGTGCTCCATATAGACTTCTTGCTCAAGATCATCGTGAAAGCATTCCTAATGTCTAACTGATGAAGAGGCCAATGATGACC
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TGTCTCAGATTCACCAAAAGTAGTTTATTTTTGGAGAACCCGACACGGGTACAACATCAAAAGTGAAGAGTCCGTGCAACTAAGGTAGGAAGGGAAACAA
GCTCCCAAGTACCACTCGTATGTAAAGCAGACATTTCATCAATCACAGTCTACCTCCATCTTGGATGAGAAAGTGTTTCACCTAGACTGCCTCCATCTTG
GATGAGGAAGTGTTTCACCTAAACTGCCTCCATCTTGGATGAGAAAGTGTTTCACCTGTGGTCTTAGGAATGAATGTAGAAGATAGAGATGATATAAAGG
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TGGCGTTGCAGCGGGCGACATAGAAGCAACCGTAGAGTCCTCAAAATTTGGTACATGTAAGAACTGAGGTATGGACACGGGAGACATAGAAGTAACAATA
CTCCTCAAAAGTTGGTATAGGTAAGATGTGAGGTATGGGTAAGACTTCAGCGACATCAACATAATCAGAAGATGAATAGTAAGGTTGAGATTCAAAGAAT
GTGACATCGGCAGACATAAGGTTGCGACAAAGATCAGATTTACAGAAAGGGGTGATTACCAGATCAAAGGTTTTTACCAGGCCTGTCATCTGAAGAGTTG
TTAGTGGGTGCACTCTCTACATGAACAAATGTTTGAATAGTTTTAGATTCCTTAAGTTTTGATATTCTATGTACATAGATCGAATAGTTTGTACAACCAC
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GCAGATATGTAACATGAGATAAAATATGCATCAACAAGCAGTCAAATTTGATCAACAGATGGAGATTAAATATGCTCCAACACAGAGTCAGCATAGATAG
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AGACGCAGACAAAAT