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Detailed information on CNT30510398


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q8RV06|SDC2_ORYSJ, E-value = 2e-11

BLAST vs NONCODE: nothing found

Expression of CNT30510398

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (38 aa)
MKICRGAEQRGLQNCSNEIAKVGLKWHDAHNACLLDNL*

>peptide 2 (48 aa)
MFVRKDYTYSYPYLYDTSSVLTMSLNIESKSCQVFEKTFHFLYRIPPH*

>peptide 3 (31 aa)
PPLVMYPQYSSFSISQSCANQSKTATSKSFE*

Sequence

>CNT30510398
GCCACCACTAGTAATGTATCCCCAATATTCATCTTTCTCTATTTCCCAGAGTTGTGCAAACCAATCTAAAACAGCCACTTCAAAATCTTTTGAATGAAAA
TCTGTAGGGGTGCTGAGCAAAGGGGTCTCCAAAATTGTTCAAATGAAATTGCAAAAGTGGGGCTAAAGTGGCATGATGCTCATAATGCATGTTTGTTGGA
TAACCTGTAAATTAAATAACCAAAGATATAATTATGAATAAAATCGTAACATATTATTTGGCCAAATCAAAAAAAAAAGAAAAATTAAAAGATATGTAAA
ATAAAGTTAGGGATGATTTATTAGTGTATAACTTTTGATTAATTTTGCTTATAAATACTTTTATGTTTATTACACAGGTAAAAATAAATGAAAATGTATT
TATTTAAATAAAATTGAGATTAAATTACCTCGATGCTAATGCTTGTATAATTCCGTTGAGTAAAAAGTAACTATGTTTGTACGGAAAGACTATACATATT
CATATCCTTACCTATATGATACTTCTTCCGTTTTGACAATGTCTCTAAATATTGAGTCAAAATCATGTCAAGTTTTTGAAAAGACGTTTCATTTTTTATA
TCGGATTCCACCACACTGAGACATAAATTCTTCCTTGGCGATAATGGTGCATCAATTTCACCTTCTGTTGGAACTACCGTTAAATC