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Detailed information on CNT30509931


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|P0DO54|TIP12_MUSAC, E-value = 4e-42

BLAST vs NONCODE:
NONGMAT001209, E-value = 2e-09

Expression of CNT30509931

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (36 aa)
MYSTYFTGIYFSISIRFIVKRKVLHIIIWIIFLKRL*

>peptide 2 (32 aa)
MVCCGCTSNCHTCRVNDYTVPIDANYVKVKIN*

>peptide 3 (44 aa)
MPPVANSRRAQAAVDPSNCAMMYKIPRNKVMFPPTKAPKVTAGLT

>peptide 4 (47 aa)
FKTNQNILFTTIKIKKINNKSRPNKQSTIQQCPLNIDKQTKKFTKRK*

>peptide 5 (60 aa)
MTILSLLTLKNSHVYNFFFTTFSERFMDILPKRSAKARNYLSHCYTWYVVVVLQTVTHVE*

Sequence

>CNT30509931
TTTTAAAACAAATCAAAATATCTTATTTACCACGATCAAAATAAAGAAAATAAATAACAAAAGCCGTCCGAATAAACAAAGTACAATTCAACAGTGCCCA
TTAAACATAGACAAACAAACAAAGAAGTTTACAAAGAGAAAATGAAAATTAAACAACGAGTTGATAAAAATTCAGCACTACTTAAAAATCTCCACTTGGG
ATTTGCTCATGAGTGTGGCTAATGAAGATGAATTCATAGATGAATCCAGCAAGCCCACCACCAATAAGTGGTCCAGCTAACCAAAGATGGGCCAAATGAC
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TAAAAGTATAGTTTGATGTATTCTACTTACTTCACTGGTATATATTTCAGTATTAGTATTCGTTTTATCGTAAAACGGAAAGTACTCCATATAATAATAT
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ATGGATATACTTCCTAAAAGATCTGCAAAAGCTCGAAATTACCTCTCACATTGTTACACATGGTATGTTGTGGTTGTACTTCAAACTGTCACACATGTAG
AGTAAATGACTATACAGTCCCTATTGACGCTAACTATGTAAAAGTCAAAATTAATTAAATGTCAAGCCTAAAGTCATAAAAATTAAATCCAATAATAATA
CAACTGAATAATTAGTGAGATGTGTACATTATTTGAACTCTAAAAAAGGTCAGTCACAAGTAACCTGTTTTTTTTTCAATATTACGACAAAAGTATAACA
ACTATAAAATTCAATAATAAATTTTATAATTCGTGTAAAATTAAAATACGACAAATAAATTGAGAGATCGAAAATAGGCTTACCATGCCACCGGTGGCGA
ATTCAAGGAGAGCGCAAGCAGCAGTGGATCCAAGCAACTGTGCAATGATGTACAAAATTCCACGGAACAAAGTGATGTTTCCACCAACAAAAGCACCGAA
GGTAACAGCAGGGTTGACG