Detailed information on CNT30507978


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30229065Nicotiana attenuataAnanas comosus2.7725.6886.1794reverse complement
CNT30425623Nicotiana attenuataPapaver somniferum2.7720.6185.1194reverse complement

Expression of CNT30507978

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (93 aa)
NFQNILSSLLFQIICFSLILPSAERTRGKREQKKPLKNLSKNGPYLKVDTTLILITQSGGLSKESHLKSEHVPALFLWLLNSLELKRLCRFLF*

>peptide 2 (73 aa)
MSFVTKLSHFSGKWMWILRSFIRTGKKTDSFAGLALYIHKISCRIYLNTIQSNLSITTSFVLNIFGCYSEVLL*

>peptide 3 (68 aa)
MKSICSGSICCLLGLVRGVVHRTYRCLFDCTGTADSSIVLSCCKPWLGNVIVIHDIQNLVLVTFYQED*

>peptide 4 (46 aa)
MAFEFLGIEKAMSFFVLNLYGFAYLLNENPSELISKKKNQLVCELG*

>peptide 5 (29 aa)
MLSVATNLLLQDLLCIVIFVGIGSHSIDS*

>peptide 6 (38 aa)
MGQHHAFIIPIDKLSFRIGLISQYCRHQRPSNSTVLRN*

>peptide 7 (38 aa)
MCDLSLLIQINQRCLVVVGRIETFIFVHPESNLSQLIL*

>peptide 8 (40 aa)
QFPKYSVISSIPNYMLLLNFAVSRKNKRQERTKKTTQKFI*

>peptide 9 (39 aa)
MLPMGITSRFVNPSSFSTSPLSERLNITTKAFGVRVANF*

Sequence

>CNT30507978
CAATTTCCAAAATATTCTGTCATCTCTTCTATTCCAAATTATATGCTTCTCCTTAATTTTGCCGTCAGCAGAAAGAACAAGAGGCAAGAGAGAACAAAAA
AAACCACTCAAAAATTTATCTAAGAATGGCCCTTACCTAAAAGTTGATACGACTTTAATACTGATCACACAAAGTGGTGGTCTCTCAAAAGAATCACATC
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TATTTACTAAATGAAAATCCTAGTGAGTTGATCTCCAAAAAGAAAAACCAACTTGTGTGTGAGCTGGGTTGATTTGGAGATTCGGATGGCTTTTTCTCTC
CAGAAACTTGCTGCGTCAAAATTGATGGTTTCATAGAAGGAGATAACTAGTTCTTGGATTGTTTTATGTTCAGCACTCGTGAAAATAAGTGGAAGATGTG
ATGGATTGAGATTTGAGAAGGATTTTACTCCCTTCTTGTGTACATGGTTTGCAAAGGTGATGCTACTGAAGCGTCTTGTTACCATCCAACAGTGTCACAA
CTCATGACCTTTCTGTAGATCGGCTATGTAAACAATTTCCAGAATGTTGTTGCATGTGTGATTTGTCTCTCCTCATTCAAATAAATCAGAGATGCTTAGT
TGTAGTTGGGAGAATAGAAACCTTTATTTTTGTGCATCCAGAATCTAACCTTTCCCAGTTAATTCTATAAGCCAGTTCTTAGTAATTCCACAGCTTTAAC
ATTGTCATTCTGAAAGCTAAGAGGGAATCAGTTTTAGATGGAGCTTGTATGAGTAAAACTTCTGTGAGCCTTATCTAATTTTTGTTGCAACACATAGAAA
CAAGTTAGGGGTAAAGTGTAAAAATGGGTCAACATCATGCTTTCATAATACCAATCGACAAACTCTCCTTCAGAATAGGATTGATTTCTCAGTATTGTAG
ACATCAAAGGCCCAGCAATTCCACTGTTCTGAGAAATTGAAGAAGTTTTGGTCAGTTGGGTTCCTTTCTTGTTAGTCCAGCTACCTATGAGATTCTGTGG
GTTGTCATAGTGGTCTTTATCTCAGATGTTGGAGTAGAAGATTAAAAGACGAAAGGATCGCGTGGAGTTTTTTTCCAAAAATTGTATAGCCTAATCTGCG
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ATGATTCTGTTCCCAAGAGAAGACATTATTGATTGACAAATTCAACTATATGCTCTTTTGCTCTGGAATCAGTAAGGCAAACATGTAACAGGTTTTTGTT
TCATGTCTTTTGTAACAAAGCTATCACATTTTTCTGGCAAATGGATGTGGATTTTGAGAAGTTTCATAAGAACTGGTAAAAAAACTGACTCTTTTGCTGG
CCTGGCACTATATATTCACAAGATAAGTTGCAGGATCTACTTGAACACAATACAGTCAAACCTCTCTATAACAACCTCGTTTGTTCTGAATATTTTTGGA
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GGATATTGTTATAGAGAGGTTTGTTTGTACATATATTAATCCTTGTTCCATCCCCATCTTTTGAGCACGTCAACATTTTGCCATGTCCACATGGTACTAT
TCACTAAACTTATATATACTTGACTCCACATATTCATCATAACTGCAGTCAGTCGGCATCTTACTTCCATGGACATTGATTAAGTGATTATTCTTCCCAC
TAGTATCATTTACTTTAATGTACACTTAGATATTTCAGAAGAAATTTCTGGTTTCAACTTTTGAATCTCCCCTTAGGCTGACTATAACAAGGTCGCAACC
TAAGTAGTATCAAATGGTAAGCATGTAAAGAGTGTTTTCACAATGGCCATGAAAAATTGCTTTGAGGATGGCCAAAAAAGCACTTAGCTGATCAGATTTA
CTATATTTTCAACAATCTGGATTGGTAGAATGATCTATGTCATTTCCCAACTTTGTTTTTATAAATATTATAACTCCTACTTTGGTGGTAGCAGACCTGT
TTGATAGCTAGACCACTATCTCCTGTCTAACTCACCTTCAGCAACTCAAATTTTGCGATATTTTTTATTTCTGATCAAAGGAATGGCATCTTTTACTGTA
AGTCCTAGCTATTTAGCACGATATTGGAAATCTTATTGCTATTACTCAAACATATGAAACTTCTGGGGTTTTCAACAGATGAACGGCTAACTAGATCTGA
TTTGTCAGATCAACATGAAAAGCATTTGTAGTGGTAGCATCTGTTGTCTTTTGGGTTTGGTAAGGGGAGTAGTTCATAGAACTTATAGATGCTTATTTGA
CTGTACTGGTACTGCTGACTCTTCCATTGTTCTTTCTTGCTGCAAGCCTTGGCTAGGTAACGTTATTGTGATTCACGATATTCAGAATTTAGTGTTAGTA
ACGTTTTATCAGGAAGATTGAGATCTCTAGTGTTAGTAAATGTTTTATCAGGATATATATTCAGAACTCTATTTGTGGATAATTAGATAACAGTTAAATG
CTCTTGTTTTTTGGCACATTCTAATGCTTTTGGTAGGTACTTGATGCTATCAGTTGCTACCAACTTGCTGTTGCAAGATCTCTTGTGTATAGTAATCTTT
GTTGGGATAGGTAGCCACTCAATCGACTCCTGATCTTCAATAAGGGAATCAGACATATGTATTTACAATGTTGCCTATGGGAATTACATCTCGTTTTGTA
AATCCTAGCAGTTTTAGCACTTCCCCTCTTTCTGAACGATTAAATATCACTACCAAAGCCTTTGGAGTCAGAGTAGCAAATTTCTGATGCAAGAATATCA
CAACAGGATCCTTTTGAGTAGGCATAGCAAGCTTCATCTTTTCATGTGGTAGTTGGTTCCGCTAATTATATTAGTATTATCTTTTTCCTTTGAGAACTTA
TTGAATCTTCGTTACTGATGTTTTACCAGTGTGCCTCATAATTTTGAGTTTTAATTTATCAGTTGGATCTTGTGGCCATTGAATCAGTTCCTGGAGCTGT
CACCTCACTCTCTAACATTGTCAATTACTTGGTTCATGAGGTGAAAAGCATTTGCCCTCTCTTTGCTCGATTCATTTGAGGTTGCTATCTTGCTTTAATC
AATTATTTGATTGATTTGGCTGTTAAAAATTTGTGCTAATTGTTTTTCCATGTGGCCCAGTTTAAGGTGAAATGGTATTCCTTTCAGCGG