Detailed information on CNT30494125


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30606094Olea europaeaGossypium raimondii1.7423.9584.6291reverse complement

Expression of CNT30494125

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (55 aa)
MTMELHPLMNSVHVFLLMFPFFSLCFKERKHVVQLFSSMLSTLCVVGGTLERYLL*

>peptide 2 (61 aa)
MELKLQMNAQYMIRSRSIVVLSHLRLKIRTLIQTYIQKINAFTEREREREREHYAAETTTL*

>peptide 3 (65 aa)
MLDVQKAHLIRAQEKIKLAVDRHRRDSNWPKGICSMLCSDFIAFTPWQTGQMRTSGLSILVCLKL*

>peptide 4 (50 aa)
MCTTIVHIDRFKGMSAGAPGFPYSREQMLETEEQCHNKMYKHTSQTPYYK*

>peptide 5 (45 aa)
MIRSGSPFCQRESTAPWHSQLNSKDKIFLSHFLDRTLLPAGNIPL*

>peptide 6 (50 aa)
MKRIGPVAYRLKLPTSATINPIFHNSQLKKTLGHKVSQSTVSPHLRANLE*

>peptide 7 (40 aa)
MNCPSESSNISPVFSMSLAISTLVIHTLTVSMFIVQDQYK*

>peptide 8 (44 aa)
MSALGGVLVYNYFHASINATLFQAIYGRDPHPLTRYGSQTTATH*

>peptide 9 (33 aa)
MGNLTNVSLFVELIKATLLRLVQRSFLYYFSPQ*

>peptide 10 (37 aa)
MDFIEGLPKSGRFDSLLVVVDRLSKYAHLIPLNHPFT*

>peptide 11 (32 aa)
MFLSPFVHFLSYYEKGLISLSPAGPCRHIYHI*

>peptide 12 (34 aa)
MLSLYLFPMTLAKKFPRLQKLQSESFKLSNHILL*

>peptide 13 (36 aa)
MHIFIETKSKYGTETAHSLRLKQSKMLYRFILLTAD*

Sequence

>CNT30494125
GGAAGATCTAAATTTGGTTCTGTTCTGTTAATATCAACTTTGCTTATTACCTGATGGTTTGTTTTTCATTCATTATTTCTCCCGGAATGTTTTGAAATAA
AATGTAATGTCACGAAGAGCACTATCTCTTCAATTTTACAAATCAATCTGAAGCAGATAATATTTCCTTTTCTTCCTTTCTTGCATTTTGAGATTTTTTC
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