CANTATAdb - search

Detailed information on CNT30491131

BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)

Target	Query species	Target species	Query coverage (%)	Target coverage (%)	Identity	Alignment length (nt)	Orientation
CNT3021628	Olea europaea	Citrullus lanatus	4.39	49.16	93.16	117	forward
CNT30167792	Olea europaea	Pistacia vera	9.71	78.25	89.19	259	forward
CNT30194074	Olea europaea	Secale cereale	10.72	29.79	89.86	286	forward
CNT30597298	Olea europaea	Fraxinus excelsior	6.71	33.03	85.47	179	forward
CNT30365705	Olea europaea	Sorghum bicolor	10.72	53.86	89.16	286	forward
CNT30115505	Olea europaea	Oryza nivara	5.85	36.62	89.1	156	forward

Expression of CNT30491131

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (37 aa)
MLLLLLLLLLLLLLLLWLKKSTVGSVINWSPTLYRFM*

>peptide 2 (40 aa)
MVLLQVLGLNIPRYEVRFVCHYFLNNIMLDSSDKVTIIFC*

>peptide 3 (40 aa)
MTDLFATKYNPSILLVYIPSAFDFTMMLYKFYYLARVCMK*

>peptide 4 (33 aa)
MVLPGEETMEEKQAKEVSVAYNSKPRVPEVIVM*

Sequence

>CNT30491131
GGTAATGGGTTACTCCTATAGCACGTCCTTGTACAATGCTCAAGGCTCTTGGTTGAGTAACAGGAGCAACTTTTAATTTATTATGAGCCCAAACTATGGA
TTCAATAAGTTATTGCCAATAACCACGTTCGCTGAATAGAAACATCAAACTAAAAGCCCATACAAAATGAGCACCTAGGAATAAAAGTCCATATGCAGAT
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GTTCCCGAAGTCATAGTTATGTAGATATGAAATTGTGCTCATATCCAACTAATCATGTTGTATATATCTGCTTATGTCTCATAGATCATGCATAGAAATT
CCAAAATAGCTCCAGATTCATTTGCTTCTATATTAAAAATTCTTCGCTTGGCCACATAAATTACAGGTGCACAATGCTGTTGCTGTGGCTAGATTACTTA
ATGCAATAGTTTTTCTTTCGAAAATTATCTACAGCACTATTTGGATAAATAGATTTTAATGAGTATTCTAGTTGTCTATTTCGATAGCTACTATTAAAAG
GAAATGTTAGAATCTCAGGTAATTGTGCACATTATTCCATATTTTTTACCTTAAAAGTGTCCACTAAACACTTCGCAAATTCCATTTTTATTTCTCGCTA
TTCTCATTTACTGTTACTCTCGGACGTATCCATTTAAATTGGATGACCGATTTGTTTGCCACTAAATACAACCCAAGTATTCTATTGGTTTATATTCCGA
GTGCATTTGATTTCACAATGATGCTCTACAAATTTTATTATTTAGCTCGAGTATGTATGAAATAGTTTAAGATAAGTTCAGGTTAAACTATCACAATTTA
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TCTTGTTAAAAATGGGCCTGCAAGCCTTAAGTGCAAAACCAATTGTAAAGCAAAGAAGGTTATTACTTATTTAGAATTATTAGTCAAATTCATCAACAAG
AAAGTAACAGAAGAGTCCAGTTTATGGTTTTGTTGCATTTCTTTCATCAAGTTATTACTCAAGTGAAACTCCATTTTGCTCTGTAATTTCCCTTTATGCA
GTAAAAGCTCTTTTCTCAGTAAAGGATTCGTATGGAGGGAGAGAAAATTGTTAGATTTATTTGATATATTTTTTATGTTAGCATTCTACGATCCCCTAGA
AGATTGAGTGTCTGAAATGAACAATATATTCTAAAAATGCTATATAACACTATGGAGGAATAACTTATTGGTTTTCCAAGCCCGTCGACCACATTATTAA
TTCTGCTACAAATTCAAATTATATGTCGGCCAGTCAGATATCATTTCCTATTGTTTTATAAGGTCCAAATGGTACTACTGCAGGTGTTGGGGCTCAACAT
TCCCAGGTATGAGGTTCGTTTCGTCTGTCATTATTTTCTTAACAATATCATGCTTGATTCTTCAGATAAAGTCACTATAATCTTTTGTTAACATCAACGA
ACTGTTCTCCTGTTTTTTCTTTCTCGTCTGGAATGGTAAAAGGAGTGTGTATGTCCACAAGGATACTTTCTTTTGGTGGGAAAGTCAGCTCAGTTTTTAA
ATTATGATAAAACTATAATACCCAAAAAAAATAAATAAAAAATAGATGGTGTACCTTGTGGACTATTTTCACAATCATCCATATTTTTCCATACTTCATG
TGTATTGTAGGCAGCATTATGCTCTATAAGATTAATAAAGAAAGTACTGGACCTGGTAGAAAACTTTGTTAATGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCT
GCTGCTGCTGCTGCTGCTTTGGTTAAAGAAAAGCACAGTGGGAAGTGTAATTAACTGGAGTCCAACTTTGTACAGATTTATGTAAAGTCAATAAAGAGGT
TCTTGAGAATTTAGATAGGTAAGTAGACAACTGCTGTCTTTATGTCCTAAAATTATTTATAAGAAGCTAAAATATAGCGAATTGATGCCGACAATTAAAT
TGTAAGATGAGATTTCCTTATATTCTGTTCGAATAATATAGTTGTTTGGAAAATATGCTTCACCTCA