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Detailed information on CNT30488054


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|P0CH33|UBQ11_ARATH, E-value = 2e-154

BLAST vs NONCODE:
NONMEST001181, E-value = 6e-106

Expression of CNT30488054

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (48 aa)
MKGRLLLDVVVSQGTAILKLLPSEDKPLLVWWNTLLILDLCLDIINGV*

>peptide 2 (44 aa)
MPSLSWILALTLSIVSELSTSRVMVLPVRVLTKICIPPLSLSTK*

>peptide 3 (31 aa)
RECTKLTFIHKWGEPLGTFIATRTSNIENFT*

>peptide 4 (31 aa)
MVSELSTSKVIVLPVKVFTKICIPPRSLRTK*

Sequence

>CNT30488054
CGAGAATGCACAAAACTAACTTTTATTCATAAATGGGGGGAACCCCTTGGAACTTTCATTGCAACAAGAACATCTAATATTGAAAATTTCACATAAGCCA
TTCAAAAATGGCTAAAAACAACCATAGAACAGTGTGTTAACCACACTGTAGATCACACAGCATCACTTGCAGACTATTATCAGCATAACATTTAGAAACC
ACCACGGAGGCGGAGTACAAGATGAAGGGTAGACTCCTTCTGGATGTTGTAGTCAGCCAGGGTACGGCCATCCTCAAGCTGCTTCCCAGCGAAGATAAGC
CTCTGTTGGTCTGGTGGAATACCCTCCTTATCCTGGATCTTTGCCTTGACATTATCAATGGTGTCTGAGCTCTCCACCTCCAAGGTAATAGTCTTGCCAG
TCAAGGTCTTCACAAAAATTTGCATACCTCCACGGAGCCTCAGAACCAAGTGAAGGGTGGATTCTTTCTGGATGTTGTAGTCTGCCAGAGTACGACCATC
CTCAAGCTGTTTTCCAGCGAAGATGAGCCTCTGCTGATCCGGTGGTATGCCCTCCTTATCCTGGATCTTGGCCTTAACGTTGTCAATTGTGTCTGAGCTT
TCCACCTCAAGAGTAATGGTCTTGCCGGTCAGAGTTTTGACAAAGATCTGCATTCCTCCCCTTAGCCTAAGCACCAAGTGAAGAGTGCTCTCCTTCTGAA
TGTTGTAATCTGCTAGAGTCCGGCCATCCTCCAGCTGCTTGCCTGCAAAAATCAATCTTTGCTGGTCTGGGGGAATACCTTCTTTGTCCTGGATCTTGGC
TTTAACGTTGTCAATAGTGTCAGAGCTCTCGACCTCAAGAGTGATGGTCTTGCCTGTCA