Detailed information on CNT3048357


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30390355Prunus dulcisTriticum turgidum3.0524.3583.43169forward
CNT30566352Prunus dulcisActinidia chinensis1.928.6985.71105forward
CNT30153623Prunus dulcisPrunus persica9.6697.196.82535reverse complement

Expression of CNT3048357

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (50 aa)
MWAAFARDEENLFFYNLVIYNKILFILLFLLHAAISLIFLYCNRVKRVTQ*

>peptide 2 (56 aa)
MATDMEGMATDMEVMDTDMEGIATDMEDMAMDMEGMATATTAKGGLVLLRLKSRIR*

>peptide 3 (83 aa)
MIVISYVYVFALYIKFLFVLSEESIVNGDGHGHGGYGHGHGGYGHGHGGHSHGHGGYGHGHGGYGHGHHGKGGPGAAETEIEN*

>peptide 4 (50 aa)
MAFLHGPLASSSTLLRWSHSCNLIKEATYHKGYQGLSWNPILSKDSYGFR*

>peptide 5 (36 aa)
MYILETNAICNTFTDQITDHLSNIDGPHIYWWGHLY*

>peptide 6 (53 aa)
NHLLHTFIYILSCLLLSKTWHPQRLFFFLVLSLLFSSSPLRSQLLQLVSFSLS*

>peptide 7 (52 aa)
MMTIFLMITSMGMDMTIGTSMGMGMTTGMDDMAMATMAKGDLVLLRLKPRIR*

>peptide 8 (61 aa)
QSSLAYFHIHIIVLVVKQNMASSKAFLLLGLVFAVLLISSEVSATPTREFLTFLTKSYILN*

>peptide 9 (55 aa)
MSKISSMAWLLKIEEDILTTNEILKLVKLQKKKRLRQFQRKKFKEICQVSKVYLF*

>peptide 10 (53 aa)
MASSKAFLLLGLAFAALLISSEVSATPTREFLTFLTKSYILNSNCIFLSSNDL*

>peptide 11 (35 aa)
MRERLLWLDCQQSVNGFSSWSFGFIFYPSALVTFM*

>peptide 12 (30 aa)
MEGEHILTTNEILTLVKITLLFPNINRVHI*

Sequence

>CNT3048357
TCAATCATCTCTTGCATACTTTCATATACATATTATCGTGCTTGTTGTTAAGCAAAACATGGCATCCTCAAAGGCTTTTCTTCTTCTTGGTCTTGTCTTT
GCTGTTCTCCTCATCTCCTCTGAGGTCTCAGCTACTCCAACTCGTGAGTTTCTCACTTTCTTAACTAAATCATATATATTAAATTAGTAATTGTTTCTTT
CCAGTAACGATTTGTGAATTTAGGCACATTTTAATTAAGGTGCACTGGTCGTGAAAATGATTATGCTTCGAACTCTTTTTCTGCATGTAGGGTTAGTGGT
TGTTGCACTTGCGTGACTTAATTTGCACCTTATTAAATACAAACCGATCTATGATTGTTATAAGTTATGTATATGTTTTTGCTTTATATATAAAATTTTT
GTTTGTTCTCTCAGAGGAGAGTATAGTCAACGGTGATGGCCACGGACATGGAGGGTATGGCCACGGACATGGAGGTTATGGACACGGACATGGAGGGCAT
AGCCACGGACATGGAGGATATGGCCATGGACATGGAGGGTATGGCCACGGCCACCACGGCAAAGGGGGGCCTGGTGCTGCTGAGACTGAAATCGAGAATT
AGATAACCTATTAGTTTCTGTGACTTACGTTGCAGTTGTGTTGTAAGGGTAGTAGTACGAAATAAAGTTGTTTGGTTGAGTAATCTATATGAAATATCAA
TCATAGACTCGTCTTAAGCTTGTTCTCGTGTTCTCTGTAATGTACGCATTGGAATGTGTTCTCTTGTTATGTGATAAAATGTGATGTAACTTTCTCAATA
CATATATTATGTAAAAAAATGTTTAGTATGGCTTGACTCCTTAAAATGGAGGGGGAGCACATCCTCACAACAAATGAGATTTTGACACTTGTTAAAATAA
CTTTACTTTTTCCTAATATTAATCGAGTTCATATATGACTCATTTGTTTTGTGCGATCACATTTGGTTAATGAATTGTGCACCAAATCTAATAGGATATC
GATCCTCTGCTATAATTTTAGTCCCCTAATAGGATGGATCGTACTTTGGAGCACATTCGGTAGTTCCTACTCTCACTCAAAAATACATATTGGTTGGTCC
ATTAAAATGCAAATATCACCTCTCATATCATTATGCGAACATTGGGAACAAGAGTAGTGTTTCCACCGTTGGCAAGGGATTGGAAGATCTAGCTTGATGG
AAAAATAAGGAGTAAAACTTATAGAAGCATGCATGTCGTGTATGTATTGACGATACTAATTTGGCAATTTCTAGTTGGTGAATTAAGAAAACATTTTTAA
TCTATATATGTAAAGTAAAATATCGTTGTAGTTAAATTTTAAAATAATTCATCTAAGAAATTTGTGGTCAATTTGTGATTGTAGGGGTCTAAGAGATTTG
TGGTCACTTACCGTTGGATGTAAATTCAACGGTTCACTCACTCTTGCACTCATTTTAAGAAACTTTTTTGAACCGTTGGATGTTACATCCAAAGGTGGGT
GACCACAGTTTCATGAACCCTTGTGATCCAAGAGATCGAGACTATTGATAAGATATACAAATGCATGAACTAATTTAGTCAAATTGATAACTCGACGACT
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TCTTTTTCTACAACCTAGTGATTTATAATAAAATTTTATTTATCTTACTATTTCTATTGCATGCTGCCATAAGCCTTATATTTTTATATTGTAATAGAGT
GAAACGCGTCACTCAATGACTTTCAGTATGGGCAGTAGCCAAAAATATTAGAATTTAATTTATGCATATGCTCAGTGCTCAAATTTATGGATGAAGCCAC
GTGAAGATTTTGTTATATAAAAACAAAAATAAGCAAAAAAGAAAAATGGAAGGCCACCCCACGTGAAATGGTGAAGCAACGGCTACAATTACAAAGCAAA
CCATCAACAAAGAAATAAAAAATGCAAAAGGAAGCATCCAATGCAAATTATAAAAAAAAAGTAATAGGAAACCGTGCGAATGCCAGTCTTCATTCTTAAT
AGCTGCCATGCCAAGTATATCAATTTACGATGCCTAATACATTAATTAGCACTAATCGATAATTTTTTGATACTCTAACGATAATATCGATAATTAGGAG
TGTATTCAATTCAAATTTTTAATGATTTTTATAGAGTTTAAAGTTTGAATGTATTCAATTTAAATTTTTTAAGAGTTTATAAAAGTCTAATGATATTCAA
TTGTGACTTTTAAAAAGTAGTTAAAGTAGTTAAAAGTTTGGTGGTATTCAAAAAGTTAATGATTTTTTAAAAAGCTTATTAAATGAATGACTTTTCTATA
AAAGTATTTGAGCTAATTGTTAACAGCAAAAGTCTTGTTAATTTATACTAGTGACTTTTATAAGTATTTAAGAATTTTTCAACTCTATGAAAGTTACTAA
TTTAAAAAAAGTCTTTATAAGTATGAATTAGATACACCTAGTATTGAATTCATAATATATCAGGTATTGAAAATTTATATTCCGTATCAGGCGGTAAGTA
GCTATATAGCCATATTTTCGAGTAAATATTATATGAGCTTTGAAGATAATTAACATTTATTCTCTTTGTACTTTAGTAGTTGGGGTTGTAACTTGTATCT
GGTCCTGATTTTGCATATCTATTATTTGGTAAAGTACTTCTGAAAAAGCAGAAATCATCAAAGTTTGTGGACATGAGAGAGAGATTACTGTGGCTGGATT
GTCAACAAAGTGTGAATGGCTTTTCTTCATGGTCCTTTGGCTTCATCTTCTACCCTTCTGCGTTGGTCACATTCATGTAATCTTATAAAGGAAGCCACGT
ACCACAAAGGCTACCAAGGGCTGAGTTGGAATCCCATTCTAAGTAAGGATTCTTATGGTTTCAGATGATCTAGTTACATGAGAACTAGGAACGGAGAACT
TTCCCTCCTTTCAACCCGACTCTTTGGTATTAAGAATACTGATTTTAAGAATGAGTGATTGCCCTTCTCCGACCCTTATTGCCCAACCTAAAAGTAGACA
GCTAATACGATCCACTTATTGATAACTATTGTAGATTAATCTATATTAAATTGACTTGTATTAATATAACTTTATACACAGTACTAGATAATATAGTAGA
GAGATTCAGAAACTTTAATAATTGTGACCACAAAAGGAAGCAGTATAGGTCCTACCTGTGCATTTTTTCCTGCCTAAACCCTAAACACCTTTTGTTTTTG
TGATAATCTAAACATGCTAAATTAAGAATGAAAATTAACAGTTAAAGGACTCTCACGATCACTCTACAATACTGCGACCTGAATGCTGAATCAGCAACTT
AAGTTTCAGCCCATTTTCCACATACCTTGAAAATATCTCATCCAATTTCATGCAACTAATCAGACAAAAATCAACTTCTTTTGACTTGATCGAAAAAGAC
AGCTTAGGGCCCGTTTGAAAACCATTTCAATTTTAGTTTTTAGTTTTTTAGTTTTTTAGTTTTTTTTTGTGTTAGAGTATACAAGAAAAAGAAGGAGAAT
GAAATTGAGTGAAGATGAGATTGAGAGAGAAGATGAAAAGAGAGGATAAGAGGAAGGAGTAACAAAAGTGAAAACAAAAACTAAAAACTGAAATATATTT
GAAATTGTTTTCACTTTTGTTCCTCCTCCCTCCCTTATCCTCCATTCTCATCATCTCTCTCATCTCAATCCTCACTCCCACTCTCATTTTTCTCTAACAT
TCTAGCACAAAAAATGAAAACCAAAAACTAAAAATGAAATGATTATCAAATAGCCCTTACCTTTCGCGTTCCCACCTTTAAGAGAAGCCTACTTAATACG
TAGTCCATCAAAAGCAGGAAAAAAAGAAAAACATTGCTTGATAAAGTCCAAAACCAAAAGATTAAAAATAGGGGTTGGGTTTGGCACTTTATCCTTTAAT
CATACTTATCTTCTGATTTGAAAAAAAAATCCCAAATTCTTCTTTTCTCTCTCCTTATCTTTCCAACCCCACTGATATCTCAGAATAAATAGGGAGAACC
AAGCCACATTATACTCACTCAGCAATCATCTCTTGCATACTTTCATATATACATTATCGTGCTTGTTAAGCAAAACATGGCATCCTCAAAGGCTTTTCTT
CTTCTTGGTCTTGCCTTTGCTGCTCTCCTCATCTCCTCTGAGGTCTCAGCTACTCCAACTCGTGAGTTTCTCACTTTCTTAACTAAATCATATATATTAA
ATAGTAATTGTATCTTTCTTTCCAGTAACGATTTGTGAGTTTAGGCTCATTTTAATTAAGGTGCACTGGTCGTGAAAATGATTATGCTTCGAATTTGTAC
TAGATATATATAGCATTAGTGCTCTAAAATATATTAATTCTGAGAATATCTGGATGTAATTTACTCTTTCTGCAGGAAGGGCTAGTGGTTGTTGTACTTG
CATGGCTTAATCTATGATGGTTAAGTGATGTATATTTTAGAGACTAATGCTATTTGTAACACATTTACTGACCAGATTACTGATCACCTTTCTAATATAG
ATGGGCCCCACATATACTGGTGGGGCCACCTCTATTAGAGAGATGGTCAGTAAATATGGTCCAAAGTAGCAGCACTCTATTTTTTTCTACATATTTTCTT
GGGTGCTGATTTTTCCACTCCTTTTTTGGTTTTTTAATGCTTTTTACTTTAACATATAAGGAAGTGTAAGTTGACAAAAGATGAGTGGGAACATACAATT
TCCAACAAAAAGAATGTAAGTGGATAAAAGAAGAGTGATAAAATCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTATATATATATAAAGTTTTTGT
TTGTTCTATCAGAGGAGAGTGCAGTCAACTATGATGACAATTTTCTTGATGATCACGAGCATGGGCATGGACATGACCATAGGCACGTCCATGGGCATGG
GCATGACCACAGGCATGGACGACATGGCCATGGCCACCATGGCAAAGGGGGACCTGGTGCTGCTGAGACTGAAACCGAGAATTAGATAACTTGTTAGTTT
CTGTACTTATGTTGCAGGTGTATCGTAAGGGTAGTAGTATGCAATAAAGTTGTAATGGTTTGAGTAATATCTATAAACTCTCGATCATAGGTTCGCCTTA
AGCTTGTTCTTGTGTTCTCTGTCATGTACGAATTGGATCACCTTGTTATGTACTAAAATGTGATTTAACTTGTTGAATACATATTATGTCAAAAATTTCT
AGTATGGCTTGGCTACTTAAAATTGAGGAGGACATCCTCACAACAAATGAGATTTTGAAACTTGTTAAACTTCAAAAGAAAAAAAGGTTAAGGCAATTCC
AAAGAAAAAAATTTAAAGAAATTTGCCAAGTTTCAAAAGTCTATTTGTTTTGAAGACGAACTCCTCCTCAGTTTTAAGGAGTGTAAGTTTTTTCCTAATA
TTAATGGAGTTTCATATATGACTCATTTGTTTTGTG