Detailed information on CNT30472632


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q0IQF7|RS16_ORYSJ, E-value = 5e-86

BLAST vs NONCODE: nothing found

Expression of CNT30472632

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (42 aa)
MRAKQHLDIAPPESSSNDRKRSGKLGQYRQRSSKRGQASAQR*

>peptide 2 (29 aa)
MAFMLCLWDEHVPTFTPFFSLCQLVAIHV*

>peptide 3 (32 aa)
MDIWYCCPVATKFRSCQQLLLFLWVIWRLLYF*

>peptide 4 (32 aa)
MFGTSRLPQWQLHSACGMNRSLRCTTILFTVS*

>peptide 5 (59 aa)
MFCDHEDHMINHLWSSVNLAAGINMVLSSILNFGLMRWNFWVQCRTYVWDFTSAPMAIA*

>peptide 6 (44 aa)
MSMSLNLDRPASRMGSKALRRSISGRMSSIGTPFTLISPRPGLV*

>peptide 7 (35 aa)
MGNVHPPYYPVIYVLFTCLNTACLKCHVFWSNTLP*

>peptide 8 (33 aa)
MLMDPPERASLGNAGNHKFNETGLNRQNPMSTI*

>peptide 9 (39 aa)
MFHDSICTDHSLAAVFVILKMEHKIAYLTTFASNLSIRL*

>peptide 10 (38 aa)
MCFGVIRCPDGNNSACGVSRSQCLPPFVPLSCYPYIIS*

>peptide 11 (40 aa)
MGWALEGKLASCEAQVCVRCDKRPRGEGEEARVSALTNTT*

>peptide 12 (44 aa)
MRARNQAPNTEEDMIKEMGILTNRQIPSAETYKLRLHRYRFLNS*

>peptide 13 (48 aa)
MHLWPCVSRICSVYDVWLPLLILGATLPINQLRGLLASIEKQLMAFYW*

>peptide 14 (46 aa)
MYYHIIHCELMLCFPLIIKDKDWKFSYIVLCSMIQSVLIIRLLQFL*

>peptide 15 (62 aa)
MIGNDLASWDSTGNGPASAGKQALNGRTSGTWRGRRDHRTSWARSAWGRRRGGCGRSVRRCP*

>peptide 16 (76 aa)
MTTTRGRSARDDGRAGSPQTQAIRDVLLSFAVFFSNPLRCSFRIITSIFYFKRIIFLSVEWLLFYFVLINRFISAV*

>peptide 17 (97 aa)
MNCNNRGHQTKERYLTNQNSECNHLAIQNVLHATSITEGDLLKGIIQIIKMKPFGKSKLLILYNLQFLYCHFSVSLHMGCRNHESQKSSTKYRRRHD*

Sequence

>CNT30472632
GGAATAAATTACAGCTCAACATGGTCCAACTCATTCAGAACTGAACTACAGCTCAACATGATGCAACTCACTCAGGAATGAATTACAGCTCAACACGATG
GTTTCTTTGTGTTAATATAAGCCAGCTTTAACTCCAACAAGCAGAATGAGCTATCAGATGAGATCACATTAAACCAAGCAGTGGGCATTCAAACTAAGAA
GAAAAAGATAGAATTGAACCAAAATGCTTAATCTTCCACATGCTCATGGATCCACCAGAAAGAGCATCACTAGGCAATGCAGGCAACCATAAATTCAATG
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GTCACCAGATATGAACTGTAATAATAGAGGACATCAAACAAAGGAAAGATACCTGACCAATCAGAATTCAGAATGTAACCATTTGGCAATTCAAAATGTT
TTACATGCCACATCCATAACAGAAGGGGATTTGTTAAAAGGCATCATACAGATAATCAAAATGAAACCATTTGGCAAATCGAAACTTTTGATACTTTACA
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CATGCTGTCCATCCATAAAACAAACACAAATAAACATAAAATTTTGACAGAAATCCAAGTAAAATTTAAACACTAATCTTGCCCTCAAATAGCATAAATA
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GGTCGGCGACGAGGAGGGTGCGGTCGTAGCGTGCGAAGATGTCCTTGACCTCCTTCTTGGCGGCCTCGTCGACGTACTTCTGGTAGTACGCGACAAGCCC
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GGCGACGGCGACGGCGCGCTAGGGCTGTGGCGGCGAGGGGAGGTGGCGGCGGATTAGGGGGGAGCGCAAGGAGAGGAACGCTTTTATAGCTCGGATTAGA
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ATTTTATGGTGAGAACTTAATGGGCTGGGCTTTAGAAGGAAAACTGGCGAGTTGTGAGGCCCAAGTGTGTGTTCGTTGTGATAAAAGGCCACGGGGGGAG
GGCGAAGAAGCTAGGGTTTCGGCCCTCACGAACACTACTTGATCTTATCCGAGCGAGCCGTCCGGCGGCGCCGCGGCGGCCGGAGTCGCCTCCCCGTGGC
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TTCTAATCCTTTGAGGTGTTCTTTTCGAATAATTACAAGTATTTTTTATTTTAAAAGGATTATTTTTTTGTCTGTTGAATGGCTTCTGTTTTATTTTGTG
CTTATTAATCGTTTTATTAGTGCGGTCTGAATCTATATCACCTTCGCGTAATTGACAAAGTGATTTGGTTCCGGAATGATATTGACGAAGAATAGTGTGC
CTAGCTACCTACTTTTGTTTTAGGCGGTTCTGTATTGCGCGTGACCTTTTGGATCTTTGTTCGCAATGAGTTAATATTATGTGCTTGTTACCTTGCTGGG
TTCTGCTGTACTATAGGGGCTCGATGGTGGGTTTTAAACTTCGTTCTGCATAAAGATTTTACTGATGTAAACATCTGCATATCATTAAATTGTCTGTATC
AGTATCAATAGTCATTGCACTTGCCTAGTTTCTACCACCTGTTGCAATCCTCTGCATATCTGAAATTAATTCATACTGTTGCATTGATAGTTATCCTCAT
GGTTAAACATTTAGAATGCACTTGTGGCCATGTGTATCACGAATTTGCTCAGTGTATGATGTTTGGCTGCCTTTGCTCATATTAGGTGCTACACTGCCAA
TCAATCAACTAAGGGGTCTGTTAGCTAGCATAGAAAAGCAGCTAATGGCTTTTTATTGGTAAGACTATTAGCTAATCTATTAGGTTGGCCCTGTTTGAAT
TCTCCATCTAATTGTTAGTGGTATTTAGCCTGGTACTTAGCTAACCTTTAATTAGCTATAGGTAGTGCATTTTCAGCTATTAGTTATGGATCTATCTAAA
CAGGCCCTAAAGGAACTCGGCCTTGCTTGACAAGTTGACATGATTATGCATGTTTTGTGATCATGAGGATCATATGATAAACCACCTTTGGTCCAGTGTT
AATTTAGCGGCTGGCATTAATATGGTATTGAGCTCCATCCTCAATTTTGGATTAATGAGGTGGAATTTTTGGGTACAGTGTAGAACTTATGTTTGGGACT
TCACGTCTGCCCCAATGGCAATTGCATAGTGCCTGTGGGATGAACAGGTCCTTGAGATGTACTACCATATTATTCACTGTGAGCTGATGTTATGTTTTCC
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TTAAGATGGAACACAAAATTGCTTATTTAACCACCTTTGCTTCTAACTTATCCATTAGACTTTAAGTTTAACCTGACATGTCATATATTTGGGACTTTTA
AGTTTCCCCTATGGCTTTTATGCTGTGCCTGTGGGATGAACACGTCCCAACATTTACTCCATTTTTTTCACTTTGTCAGCTAGTAGCCATACATGTTTAG
CTGATCATTAAGAATGGGAAATGTACATCCTCCATACTATCCGGTTATATATGTTCTGTTTACCTGCTTGAACACAGCTTGTTTGAAGTGTCATGTGTTT
TGGAGTAATACGCTGCCCTGATGGCAACAACAGTGCCTGCGGGGTGAGCAGGTCCCAATGTTTACCACCATTTGTCCCACTTAGTTGCTATCCATACATT
ATTAGCTGATCATTTGTGAAAAGGAAAAGTTAACAAATTTATTATTGAATTTATTATGCTAGGTTGTCAGATGCATATTCTTTTGTTTAAACTTTGTTGA
ACGATTGGATCATAATTTGTCCTGCAACTTACAAGTAATGTGCCCTATCGTTTATTTGTAGCCTTTTGTTTTCCCAGCTTTGTACCTTGAAAATGTGATT
TCATGGTGGCTGATTTTGTGCCTTTGTGATTTAGCCTCGTAGTCCTATGGGTCAACAGCAAGCCTGTGCTTGGCTTAAAGCTACAAAGAGGATAATATGT
TGAACTTATTTGCCTTGGTAATGTTTTAGGCTTACAGGTCCACTTGCTCCTGCTGTGATTCTGATGCTAATTGACTTGAAGGCTCTCAATGAAGCAGAAA
GATGTTGCTGCCTTGCAGAATGAAGTTGGAGTTAAATACATGGAATGGATATTTGGTATTGTTGTCCTGTAGCCACAAAATTTAGAAGCTGTCAACAATT
GTTATTATTTCTCTGGGTGATATGGCGCCTGCTGTATTTTTAATTCTGACTGATTCCTACTTCTCAAGTGCAGATTCAGTGTGATAGTGGTGGCATTCTG
CTGCTATGTTAACATGTTCACTGTAAACAAATTGCTTGCTGAAATGAGTTAGCATGTGTGTTGCTATCTGTTTACATGTGAGCAAATCG