« Back to Saccharum spontaneum search


Detailed information on CNT30460572


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q6Z358|C3H49_ORYSJ, E-value = 6e-90

BLAST vs NONCODE: nothing found

Expression of CNT30460572

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (50 aa)
MGIKLIPQILLSYSAIESTNVEGPYSLIIWRCQGWHLTCLAQKFQCNWVIN

>peptide 2 (50 aa)
MVVEVDSMVDTDHGSMAVVQDSHPVLSCLMAELARLAAALVCLHRPVILL*

>peptide 3 (43 aa)
MSQMRLHVEVPSLWTQSHHGHKIDPSNPAQLFCYRVHQCRGSL*

Sequence

>CNT30460572
CCCGGTTTTTCAAACTTTGATAAGCAATACAACAAAGTTTTACTGTTAACCACAAATTAAGAAATTGTAAAAGCTGGTGACCCACGAGGGTTATATTCTC
CTGCTGAGCAATTAGAGCAGTAGCAATATCCAACATCTTGAAAGGACTTCAGTTCTGAATTGGCTGCTGCGGCTGCTGCTGAGCTGGAGGGCCATGAGGC
GGCTGTTGTCCTGCACCTGCTTGCGGTGGTTGCTGAGATGAACTAGCCTGTGCCTGTGCTGGTTGTGCTAGCATCGGCTGGTAAGGTGGATATTGTGGTG
GGTAGGGCATACGCGGTGGAGGCATGTAGCCACCATATGGTGGTGGAGGTGGATAGTATGGTGGATACTGACCATGGTAGTATGGCGGTGGTGCAGGATA
GCCACCCTGTGCTGAGCTGCTTGATGGCTGAGCTTGCCCGGCTTGCTGCGGCCCTGGTTTGCCTTCACCGTCCTGTGATTTTACTATAGCACCCATCCTC
TGTGGATCCATGGATGGGTACAGAGTCCGCTCCGCTGCTGGTGGTGCTGGAATGTTGAAGTAGTACGATGCTGGTGCAGCCTGTTGCTGCTGGCCCTCCA
TCCCAGGGGGTTGAGGTTGGTCAACGCTCTGCTGCTGAGATATGACAGCCCTAGGGAGCAGTCCTCCATGGGAAACCTGTCCCTGCCTCCCAGACTCATC
CTCCTCAGGCTTTGGAGCCTGAGGCTTGCCCCACATCAGCTTTAGACGGACACCCTTGATGACTAGCTTGTTAGCAAGCTCCTCTGCAGCCTTCTCTGCG
CCTTCTCTTGTAGTATATGTCACAAATGCGATTGCACGTTGAAGTACCATCCTTATGGACTCAATCTCACCATGGGCATAAAATTGATCCCTCAAATCCT
GCTCAGTTATTCTGCTATCGAGTCCACCAATGTAGAGGGTCCTTATAGTCTCATCATCTGGCGGTGTCAGGGATGGCATCTCACCTGCCTTGCTCAAAAG
TTTCAGTGCAACTGGGTCATTAAC