CANTATAdb - search

Detailed information on CNT3043617

BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|P69309|UBIQP_AVEFA, E-value = 0.0

BLAST vs NONCODE:
NONMTRT001024, E-value = 6e-78

Expression of CNT3043617

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (46 aa)
AFLVLNLRLHIVNRIRALDLQSYCLPCKGLHEYLHTTSQTQNQVQS*

>peptide 2 (44 aa)
MPSLSWILAFTLSMVSELSTSRVMVFPVRVLTKICIPPLNRRTK*

>peptide 3 (40 aa)
MVSELSTSRVIVFPVRVLTKICIPPLSRRTKCKVDSFWML*

Sequence

>CNT3043617
GCCTTCCTTGTCCTGAATCTTCGCCTTCACATTGTCAATCGTATCAGAGCTCTCGACCTCCAAAGTTATTGTCTTCCCTGTAAGGGTCTTCACGAATATC
TGCATACCACCTCTCAGACGCAGAACCAAGTGCAAAGTTGACTCCTTTTGGATGTTGTAATCCGCAAGGGTCCTACCGTCCTCCAATTGCTTACCGGCGA
AGATAAGCCTCTGCTGATCTGGGGGGATACCCTCCTTGTCTTGGATCTTGGCCTTCACGTTATCAATGGTATCGGAGCTCTCGACCTCCAGAGTAATTGT
TTTCCCGGTTAGGGTTTTGACGAAAATCTGCATACCACCTCTCAGTCGGAGAACCAAGTGCAAAGTCGATTCCTTTTGGATGTTGTAGTCGGCGAGGGTT
CGGCCGTCCTCCAATTGCTTTCCAGCAAAAATCAACCTCTGCTGGTCTGGTGGGATGCCCTCCTTGTCTTGGATCTTGGCCTTCACGTTGTCGATGGTAT
CAGAGCTCTCGACTTCTAGGGTTATGGTCTTCCCCGTTAGGGTTTTGACGAAGATCTGCATACCACCCCTCAATCGCAGAACCAAGTGAAGAGTTGATTC
CTTCTGGATGTTGTAGTCGGCTAGGGTTCTGCCGTCCTCCAATTGCTTGCCGGCGAAGATGAGCCTCTGCTGATCGGGGGGAATTCCCTCCTTGTCTTGG
ATCTTGGCCTTGACGTTGTCGATTGTGTCAGAGCTCTCCACCTCGAGAGTGATTGTCTTGCCGGTTAGGGTTTTGACGAAGACCTGCATGATTGTCAATC
TCAGAAGAAAAAAAATCGAATAGGAAATTGGAAGAGAGAATTTCAGGAGCGATTTAAAAAGGCTTTGAGAGAATTGT