Detailed information on CNT30403753


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30712713Beta vulgarisGlycine max4.9931.7589.72107reverse complement
CNT30714122Beta vulgarisMalus domestica golden4.9925.9185.98107reverse complement
CNT30575742Beta vulgarisOryza barthii5.0424.1187.96108reverse complement

Expression of CNT30403753

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (41 aa)
MTIINNNNSSNNNNYHKSSSSNHNSNNEIIVIIYNNNHSSK*

>peptide 2 (36 aa)
MELFLVGVRVWGFRFSINWLRGRKKKFGVKKNLPAL*

>peptide 3 (46 aa)
MKVSETRMRSMAHQECSFLNYLRMIDFCINSCLIQQLRVLLSSFSL*

>peptide 4 (50 aa)
HIYLTILSTFLLFLSHPTELSVRREFARKTPKLVFLSNFVSDECRSSKAH*

>peptide 5 (47 aa)
MVSEPTRHKCYGSNLVHTSFPSGICSVIQRRVLHPHIKRKGHSRDEP*

>peptide 6 (45 aa)
MSRDNVLNIQGASTSRLNCWLTWSFDSINHTYQSFFKKNKHLLPT*

>peptide 7 (56 aa)
MDYFIYGKPLILFYLQFLIYFLILLNKLVFLYEIFSSPAMGILVYVVEISSPLWEL*

>peptide 8 (64 aa)
MLWRSPLPYGSCEFGLFVFRYGKLFSLVIVQDYQHEGIRNSNAVNGSSRMLFPKLSQNDRLLHQ*

Sequence

>CNT30403753
CACATATATTTGACAATTCTCTCTACTTTCTTGCTTTTTCTTTCTCATCCAACTGAGTTAAGCGTCAGAAGAGAGTTCGCCCGAAAAACCCCCAAGTTAG
TATTCTTGTCTAATTTTGTAAGTGACGAATGTAGATCATCCAAGGCACATTAGCATGGCATACTCCTCCTGTTCAACCAGGGTTTGTTTGAAACCAAACT
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