Detailed information on CNT30384312


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONSTUT000738, E-value = 2e-07

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30524944Triticum turgidumPhaseolus vulgaris5.6124.695.51245reverse complement
CNT3018229Triticum turgidumZea mays4.3584.82100190forward
CNT30351849Triticum turgidumEragrostis tef3.336.1895.83144forward
CNT30100515Triticum turgidumOryza rufipogon5.7198.0391.16249forward
CNT30578120Triticum turgidumOryza barthii3.4125.8799.33149reverse complement

Expression of CNT30384312

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (30 aa)
MTAWMAGSLSSEHYGWQRAPSRVVVAAELA*

>peptide 2 (34 aa)
MFINTVTIVSPVLECMDTSWNLRILIGSILKLFE*

>peptide 3 (32 aa)
MLLIQGMLLCNGPHVLGCSIFSSYLTPVCWLF*

>peptide 4 (31 aa)
MFCFFVLWNWKICCISKCKSVCHGPVIDLQA*

>peptide 5 (30 aa)
MYLHASFLIQIYCVADPSLAGRALRYTTCS*

>peptide 6 (95 aa)
KIFDLALFNSTATHTPNPSSHPLLPFPRPPPLHQYPSARSTPVPAPAQNMPYLSRSTTPLSSPLYMPQPPPHLSPRHGHEPIHPGPDHSLDLRRQ*

>peptide 7 (65 aa)
MATSPYTPVQITALICGGSSGSKTDCCGWTTVDVVHYLPSHINLPSSIVVEQRTCRGEPHDALAI*

>peptide 8 (64 aa)
MSRAAATDPSSVDAEHWRGTGGAAGTDAVYRGADATKMATGFFLPRCSDGRRLLGFAPVLPPCT*

>peptide 9 (40 aa)
MTTIANSYPYLFMSNINHLPVVGFGTPVCSNTSAPCLSTL*

>peptide 10 (36 aa)
MFQAINLLMLKASYILVPDGVGGNMKCLILPPIQIN*

>peptide 11 (57 aa)
MPSTGEVQVAPLARMQCTGALTPRRWPLASSCRAAAMGAASSALPQSSRPALRCCCS*

>peptide 12 (63 aa)
MWKLHVCVDVFLARTDSRPRLLTLYYHQNVYKIFTLCFPSWCLLVSKLAQEVGKSQRDTARIS*

>peptide 13 (45 aa)
MVLSSICRHKSLSCCLSMCPIYPLFFLAYEEGFVNMNFMSGSAWI*

>peptide 14 (55 aa)
MILGELNRTPSFSQHLILKAQVKNKCSTVSSSPLPHRTQQASLFMLKCCVDVSGN*

>peptide 15 (41 aa)
MQVCMSWSCHRSAGISPCHVVCPCVLYIHSSSLHMRRGSSI*

>peptide 16 (35 aa)
MAFLEIGVAAFLLEGNEASGHDLFSAELNLLSLKL*

>peptide 17 (35 aa)
MELYLWNICSLLSFSTTTVHNSSLSAMVVHAGDII*

>peptide 18 (35 aa)
MFYCFIISTPTQDTTSITLYVEMLRRCFRQLICSC*

Sequence

>CNT30384312
AAAATTTTCGACCTAGCCCTTTTTAACTCCACGGCCACACACACACCTAACCCTAGTTCCCATCCTCTCCTCCCGTTCCCTCGGCCGCCGCCACTCCACC
AATATCCATCTGCCCGCTCCACGCCGGTGCCGGCGCCGGCGCAGAACATGCCTTACCTCTCCCGATCCACCACTCCCCTCTCTTCTCCGCTCTATATGCC
TCAGCCACCTCCTCATCTTTCCCCCCGCCATGGCCACGAGCCCATACACCCCGGTCCAGATCACAGCCTTGATCTGCGGCGGCAGTAGTGGCAGCAAGAC
CGACTGTTGTGGCTGGACGACGGTCGACGTCGTCCATTACCTCCCGTCGCACATCAATCTGCCTTCTTCGATCGTAGTCGAGCAGCGTACGTGCCGTGGT
GAACCCCATGATGCGCTGGCCATCTAAACCAGATCCACGCCGATGAGAAGGCCAAGGTGGAGGGCTGCAACCGGATTTGGAAGTCGCTAATGTCCCGTGC
GGCAGCCACGGATCCATCTTCGGTCGATGCCGAGCACTGGCGAGGTACAGGTGGCGCCGCTGGCACGGATGCAGTGTACAGGGGCGCTGACGCCACGAAG
ATGGCCACTGGCTTCTTCCTGCCGCGCTGCAGCGATGGGCGCCGCCTCCTCGGCTTTGCCCCAGTCCTCCCGCCCTGCACTTAGGTGCTGCTGCTCGTAG
CCATCTCGGTGGGTGAGTTTGTCCCCTTGAGGAGGAAGGGTTAAGGATTTACCCGGTGTGAGATATCGCATTATTCGAGGAACCCTAGATGCTGTCGCAG
TAAAGAATCGTCAACAAGGGCGTTCTAGTGCGTTGTAGATTCTTATCCAAGACTTGTATCATTTGATGATGCCATGTGAATCGCTAGAAACATGTGAAGT
GTATGGCTAACCCAATAACGAAAGTTTCGTAAGGGGACTGGAGCAGGCTACCATGAGACAAAAGATCCTCTTTCTAAAGAAGCTCTGATCTTACCTACTG
CAGGGTTAGTAGATTGGTGGGTGTAACATTTGTATTCTTTCAAAATTTGTTGGTGATGTCAGTCTTTATCTGCTTAGTTATTTCTACGTACATGTGTACT
ACATAGGTTCTGGGTATATGTCCACTAGATATGTTCTGTTTCTTTGTACTCTGGAATTGGAAGATATGTTGTATTAGCAAATGCAAGTCTGTATGTCATG
GTCCTGTCATCGATCTGCAGGCATAAGTCCTTGTCATGTTGTTTGTCCATGTGTCCTATATATCCACTCTTCTTCCTTGCATATGAGGAGGGGTTCGTCA
ATATGAATTTCATGTCTGGCTCTGCTTGGATTTAGATTGGCCTGGTATTGGATTTAGATTGTTTTGCGTGCATTAATTGGCATGTTATTGGATTTGAGTG
CATTAAATTTGCCCTGATATTATATTCATATTGTTTGAGTACACATTGCCCTGGTAATTAGATTCAGATCTCATGTATATGTGTTGAGTAATGTTACTGA
TCCAAGGGATGCTCTTATGCAATGGTCCTCATGTGTTAGGCTGTAGTATATTTTCTAGTTATCTTACTCCTGTATGCTGGTTATTTTAGTGCTTAAATGG
ATGGTGTGGCAAACTATGCTTCATATGGCATTTTCATTGAATTAATGTGATTGCACTGTTTCACAGTTCAGGAATGGCTTTCTTGGAGATTGGTGTTGCA
GCATTTCTACTTGAAGGAAATGAAGCCAGTGGTCATGATCTCTTCAGCGCAGAACTTAATTTGTTATCTTTGAAGCTATAACAAGTATTGATGAACTGCT
CAAGGTATGTTACTGCTCAGTCTTTATGATGTAGCCAGATTTTTTGTGATTTTGTGATGTACTTGCATGCTTCATTCTTAATTCAGATATATTGTGTTGC
CGATCCTTCCCTCGCTGGGCGTGCCCTAAGATACACGACGTGCTCTTAATTAAGATATACTGTATCGGAGTATGAATCTGTTGTGTGAGAAGCCTGTTTT
GTTTAGCTTCAGGGCATACCAATTCATTCATTAATTTGACATATATGTTCTGTTCAGCATGATAATGGTAGATTTGGCATGTGGAAACTCCATGTCTGCG
TAGATGTTTTTTTAGCACGAACTGACAGTAGGCCTCGCCTTCTGACTTTATATTATCACCAAAATGTATACAAGATTTTTACATTGTGCTTTCCAAGCTG
GTGTCTCCTAGTCTCTAAACTAGCCCAGGAGGTTGGCAAGAGTCAACGAGACACAGCGAGGATAAGCTAATTGCTAGGTTACAGAGTTGGAGAATCTCTC
CACAAAATGGACTAGAGGGTTAACCCTGTGAGCTACTAGTGCAAAGTCCTTGAATCTCTCTCTCTCTCCATGCTTCATGGGAGTTGGGGGGGGGGGGGTA
TCCTTTTGAATATTTTCCCGTTGCGCTCTTTCTAGATGCTCCATGCCGACGTTATAAATATTTCCATGAACATTTGGCCAGTCCACCCCCTTTTTCCCAT
CTGAAGTAGGTGTAGCCCTGAACTATTCAGTATATTTTATGATATTGGGGGAGCTAAACCGAACACCCAGTTTTTCCCAGCATCTTATATTGAAGGCGCA
AGTGAAGAATAAATGTTCTACTGTTTCATCATCTCCACTCCCACACAGGACACAACAAGCATCACTCTTTATGTTGAAATGCTGCGTAGATGTTTCAGGC
AATTAATTTGCTCATGTTGAAGGCATCGTACATTCTTGTACCTGACGGTGTGGGTGGCAATATGAAATGTTTAATACTCCCTCCGATCCAAATTAATTGA
TGCTAGTTTAGTAAAAAAGTTAGTAAAACTTTGTACTAGACCAGCGTCAATTAATATGTATCGGAGGGGGAGTAGTTGATTTCTTCACATTCAACAGGAT
TGGAGTGCACATGGAGCTCTACTTGTGGAATATATGCTCTCTGCTTTCCTTTTCCACAACTACAGTTCACAATTCAAGTCTTTCTGCTATGGTAGTACAC
GCCGGTGATATTATTTAAGAATTATACTGTACATCAAACATAACTATAAATTTGTTGATCTGACGTACTTGTAGCAACAAAAATGCTTATGATTCCTTGA
GTAGTCCGTGTGATGTAGTGTGTGTGCGCTTTAGGGATTAGGGATCCCATAACCTGATGACAACCATTGCAAATTCTTATCCATATTTATTTATGAGTAA
CATAAATCACTTGCCTGTTGTTGGTTTTGGAACCCCAGTGTGTTCCAACACCTCTGCACCATGTTTATCAACACTGTGACAATAGTATCCCCAGTGCTAG
AATGCATGGATACTTCATGGAACCTGCGTATCCTTATTGGATCCATTTTAAAATTGTTTGAGTGAAAATAGAAGAACCAAATAATTCACATTCTGTTCTT
GAACTCATTGCAAGTGCATCTCTCTAGCTTTTTAAACAATTGATTGGTAAAAGGTAAAAGGACTAAGATTCACGCAGCTACGCCGCAGGTAATTGTCCAT
CTTCCACAGGGAAAGTATTTCTTCTATTGATCATAATATTCAATGGAGCTTGGAGCATGGTAATTAATATGTATCATTTTATATCTAACTTGACTTTTCC
ATGGAGTAATCCAACCAAATGTTTTAACTAAAAAGTGATTGTGATGGCTCTACATGTATCCACATAAATATTAACAAAATAAAAATTATCACATTAATTA
AAAAGGATTAATCTCAAGATTCATGATGTAGTCCATCAAGACTATATGTCGTTCGTATAACACGTTCTTGTAACATGTTCCTATAACAAAAGTATTTGAT
GTAACATGATAATTGTAGTTTAGAGACCATGGTTTGTTCGTATAGAAACCTGAGCTTGCTTGCTTCTACAATTAACTTTCAAGATGTAATTGTCCATTAG
TGAGCATGGTCATTGGAAAACGTCTTTCTACTTAAAATTAACTGAAGAATATTGTATTTTTTTAGAAATAAAATGAAGAATAGTTAATATGTGAAACAAG
AGCTCACACAGACCATGCTGTTGGGAGATGCGCAGTGCTTGGACATGTTAATTTTTTAGGCTGTCTTAACGTTTGTGAATGCGCAGGCAATGTCGACCAT
GGGTTGAGGCTAGACTTTGCTGGATAAGGTTCCCCCTCAGATAATGACGGCATGGATGGCCGGATCTTTGTCTAGTGAGCACTATGGATGGCAGCGAGCG
CCAAGCCGGGTGGTGGTGGCTGCAGAATTAGCATAGGGGTTTGTAGATTTTAGTTTCTTGTGTTTTGCTAGTCCATACAGATGAATTATTTGGAAATATA
TGTAATTTTAAGGTTTTGTGTAAAAAAACCTGCTTATGTTTATGATTTTTTCTTTTAGTTAATG